Toksin-antitoksin system

Toksin-antitoksin- systemet er et  sæt af to eller flere nært beslægtede gener , der tilsammen koder for både et "gift" -protein og dets tilsvarende "modgift". Når et sådant system er lokaliseret på et plasmid (et autonomt genetisk element), vil dattercellen kun overleve, hvis den arver plasmidet , som et resultat af opdelingen af ​​den oprindelige celle, der indeholder plasmidet. Hvis dattercellen fratages plasmidet, ødelægges det ustabile antitoksin , nedarvet fra moderens cytoplasma , og det stabile giftige protein dræber cellen; dette fænomen er blevet kaldt "post-segregational killing" ( engelsk post-segregational killing, PSK ) [2] [3] . Toksin-antitoksin-systemer er udbredt blandt prokaryoter , og ofte indeholder én prokaryot organisme mange kopier af sådanne systemer [4] [5] .  

Toksin-antitoksin-systemer klassificeres normalt efter, hvordan antitoksinet neutraliserer toksinet . I tilfælde af type I toksin-antitoksinsystemer undertrykkes translation af mRNA'et , der koder for toksinet, ved at binde til det af et lille ikke-kodende RNA , der tjener som et antitoksin. I tilfælde af type II-systemer hæmmes toksinproteinet post-translationelt ved binding til et andet protein, antitoksinet. Der kendes et eksempel på type III-systemer, hvor toksinproteinet binder sig direkte til antitoksin -RNA'et [6] . Gener, der koder for toksin-antitoksin, overføres ofte fra organisme til organisme ved horisontal genoverførsel [7] . De er ofte forbundet med patogene bakterier og er ofte lokaliseret på plasmider, der bærer gener for virulens og antibiotikaresistens [1] .

Der er også kromosomale toksin-antitoksin-systemer, hvoraf nogle er involveret i cellulære processer såsom stressrespons, cellecyklusstop og programmeret celledød [1] [8] . Fra evolutionens synspunkt kan toksin-antitoksin-systemer betragtes som egoistisk DNA , det vil sige, at formålet med disse systemer er at øge deres eget antal, uanset om de bringer fordel eller skade for værtsorganismen. Adaptive teorier er blevet foreslået for at forklare udviklingen af ​​toksin-antitoksin-systemer; for eksempel er det muligt, at kromosomale toksin-antitoksin-systemer udviklede sig for at forhindre nedarvning af store deletioner i værtsgenomet [9] . Toksin-antitoksin-systemer har fundet anvendelser inden for bioteknologi , såsom metoden til at opretholde plasmider i cellelinjer . De kan tjene som mål for antibiotika og bruges som vektorer til positiv selektion [10] .

Evolutionære fordele

Plasmider indeholdende toksin-antitoksin-systemer betragtes som et eksempel på egoistisk DNA inden for det gencentrerede syn på evolution ( eng.  Gene-centred view of evolution ). Det menes, at toksin-antitoksinsystemer kun kan opretholde deres eget DNA, selv til skade for værtsorganismen [1] . Ifølge andre teorier øger disse systemer egnetheden af ​​de plasmider, der bærer dem, sammenlignet med konventionelle plasmider [11] . I dette tilfælde hjælper toksin-antitoksin-systemerne værts-DNA'et og befrier cellens afkom fra andre plasmider (toksin-antitoksin-systemet lokaliseret på plasmidet fører til døden af ​​celler, der ikke har arvet dette plasmid under deling, derfor, hvis cellen dør, så elimineres cellerne indeholdt i dens plasmider). Denne visning understøttes af computersimuleringsdata [12] . Det forklarer dog ikke tilstedeværelsen af ​​toksin-antitoksin-systemer på kromosomer .

Der er en række adaptive teorier, der forklarer den evolutionære fordel ved kromosomale toksin-antitoksinsystemer i forhold til naturlig udvælgelse . Den enkleste forklaring på eksistensen af ​​sådanne systemer på kromosomer er, at de forhindrer fremkomsten af ​​farlige store deletioner i cellegenomet [9] . MazEF -toksin-antitoksin-locuset fra Escherichia coli og andre bakterier inducerer programmeret celledød som reaktion på langvarig sult , især på fraværet af aminosyrer [15] . Indholdet af den døde celle absorberes af naboceller, det vil sige, det kan forhindre døden af ​​nære slægtninge til den døde celle og derved øge den celles kumulative egnethed . Dette eksempel på altruisme bringer bakteriekolonier tættere på flercellede organismer [12] .

Ifølge en anden teori er toksin-antitoksin kromosomsystemer bakteriostatiske , men ikke bakteriedræbende [16] . For eksempel hæmmer RelE globalt translation under betingelser med mangel på næringsstoffer , og dets udtryk reducerer risikoen for sult ved at reducere cellens næringsbehov [17] . mazF- toksinhomologen , mazF-mx, er nødvendig for dannelsen af ​​frugtlegemer i Myxococcus xanthus [18] . Disse bakterier danner tætte klumper, og når der er mangel på næringsstoffer, samles en gruppe på 50.000 celler til en frugtkrop [19] . maxF-mx-toksinet er en komponent i den ernæringsmæssige stressreaktionsvej og gør det muligt for nogle celler i frugtlegemet at danne myxosporer. Det er blevet foreslået, at M. xanthus "slavede" toksin-antitoksin-systemet og tog antitoksinet under sin egen molekylære kontrol for at regulere dets livscyklus [18] .

Det er blevet foreslået, at kromosomale kopier af toksin-antitoksin-systemer kan give anti -afhængighed , det vil sige hjælpe med at fjerne plasmidet fra cellens afkom uden at udsætte det for toksinet. For eksempel koder genomet af Erwinia chrysanthemi for et antitoksin, der modvirker toksinet kodet af F-plasmidet [20] .

Ni mulige funktioner af toksin-antitoksin-systemer er blevet foreslået [21] :

  1. Cellulært "skrald": Toksin-antitoksinsystemer blev lånt fra plasmider og efterladt i celler på grund af udviklingen af ​​afhængighed af deres toksiner.
  2. Stabilisering af genomiske parasitter (rester fra transposoner og bakteriofager ). Tilstedeværelsen af ​​toksin-antitoksinsystemer på disse elementer kan gavne dem ved at reducere muligheden for deres deletioner. Mange kromosomale toksin-antitoksinsystemer kan ved nærmere undersøgelse faktisk tilhøre indlejrede parasitiske elementer eller deres rester i genomet.
  3. Selviske alleler : I løbet af rekombination kan ikke-vanedannende alleler ikke erstatte vanedannende alleler, men den modsatte substitution er mulig.
  4. Genregulering: Nogle toksiner fungerer som generelle repressorer af genekspression [22], mens andre er mere specifikke [23] .
  5. Vækstkontrol: som nævnt dræber bakteriostatiske toksiner ikke værtscellen, men begrænser dens vækst [16] .
  6. Resistente celler : Nogle bakteriepopulationer har en underpopulation af celler, der er resistente over for flere antibiotika , styret af toksin-antitoksin-systemer. Disse langsomt voksende hårdføre celler sikrer befolkningen mod fuldstændig udryddelse [24] .
  7. Programmeret celledød og overlevelse af dens nære slægtninge, som i eksemplet med MazEF- medieret altruisme beskrevet ovenfor (se ovenfor).
  8. Forskellige niveauer af resistens af celler i en befolkning over for stressende forhold, hvilket forårsager programmeret død af nogle celler, hvilket forhindrer udryddelse af hele befolkningen.
  9. Modvirkende bakteriofager : Når bakteriofag forstyrrer transkription og translation af cellulære proteiner, begrænser aktivering af toksin-antitoksinsystemer fagreplikation [ 25] [26] .

Et eksperiment, hvor fem toksin-antitoksin-systemer blev fjernet fra E. coli - celler, gav imidlertid ikke noget bevis for de fordele, som toksin-antitoksin-systemer giver værtscellen. Disse resultater sår tvivl om hypoteserne om vækstkontrol og programmeret celledød [27] .

Klassifikation

Type I

Virkningen af ​​type I toksin-antitoksinsystemer skyldes den komplementære baseparring af antitoksin-RNA'et med det mRNA , der koder for toksinproteinet. Translation af dette mRNA undertrykkes enten på grund af ødelæggelse af RNase III eller på grund af reduceret tilgængelighed af Shine-Dalgarno-sekvensen eller ribosombindingsstedet . I disse tilfælde er toksinet og antitoksinet ofte kodet af modsatte DNA-strenge. Den overlappende region af disse to gener (normalt 19-23 nukleotider lange ) bestemmer deres komplementære parring [28] .

Toksiner i type I-systemer er repræsenteret af små hydrofobe proteiner, hvis toksicitet skyldes deres evne til at ødelægge cellemembraner [ 1] . Kun nogle få type I systemtoksiner er blevet identificeret som intracellulære mål, muligvis på grund af vanskelighederne forbundet med at studere proteiner, der er toksiske for celler, der indeholder dem [8] .

Nogle gange inkluderer Type I-systemer også en tredje komponent. I tilfældet med det velundersøgte hok/sok-system er der udover hok-toksinet og sok-antitoksinet et tredje gen kaldet mok . Det overlapper næsten fuldstændigt med genet, der koder for toksinet, og translationen af ​​toksinet afhænger af translationen af ​​denne tredje komponent [3] . Af denne grund er begrebet toksinbinding til antitoksin i nogle tilfælde en forenkling, og antitoksinet binder sig faktisk til et tredje RNA, som så virker på translationen af ​​toksinet [28] .

Eksempler på systemer
Toksin Antitoksin Kommentar Kilde
hok sok Det første kendte og bedst undersøgte type I system, der stabiliserer plasmider i en række gramnegative bakterier [28]
fst RNAII Første type I-system identificeret i en Gram-positiv bakterie , fundet i Enterococcus [29]
TisB IstR Reagerer på DNA-skader [tredive]
LdrD Rdld Kromosomalt system fundet i Enterobacteriaceae [31]
FlmA FlmB Hok/sok homolog, der også stabiliserer F-plasmidet [32]
ibs Sib Det hed oprindeligt QUAD-RNA. Opdaget i intergene regioner E. coli [33]
TxpA/BrnT RatA Giver nedarvning af hudelementer under spordannelse i Bacillus subtilis [34]
SymE SymR Kromosomalt system induceret af SOS-respons [5]
XCV2162 ptaRNA1 Identificeret i Xanthomonas campestris og forekommer i fylogenetisk heterogene organismer. [35]

Type II

Type II-systemer er bedre undersøgt end type I-systemer [28] . I disse systemer binder det ustabile antitoksinprotein sig stærkt til det stabile toksin og hæmmer dets aktivitet [8] . Den største familie af systemer af denne type er vapBC [36] , og bioinformatiske metoder har vist, at 37 til 42 % af type II-systemer tilhører denne familie [13] [14] .

Type II-systemer er normalt organiseret i operoner , hvor genet, der koder for antitoksinet, sædvanligvis placeret opstrøms for genet, der koder for toksinet. Antitoksinet undertrykker toksinet ved negativt at regulere dets udtryk. Toksinet og antitoksinet er typisk omkring 100 aminosyrerester lange [28] . Et giftstofs skadelighed kan skyldes flere egenskaber. CcdB-proteinet forstyrrer for eksempel DNA- topoisomeraser II og DNA-gyrase [37] , mens MazF-proteinet er en farlig endoribonuklease , der skærer cellulære mRNA'er i henhold til specifikke motiver [38] . De mest almindelige toksiner er endonukleaser, som også er kendt som interferaser [39] [40] .

Nogle gange optræder et tredje protein i type II toksin-antitoksin-systemer [41] . I tilfældet med det førnævnte MazEF-system er der et yderligere regulatorisk protein, MazG. Det interagerer med Era E. coli GTPase og er karakteriseret som en nukleosidtriphosphatpyrophosphathydrolase [42] , som hydrolyserer nukleosidtriphosphater til monophosphater. Yderligere undersøgelser har vist, at MazG transskriberes til det samme polycistroniske RNA som MazE og MazF, og MazG binder til MazF-toksinet, hvilket yderligere hæmmer dets aktivitet [43] .

Eksempler på systemer
Toksin Antitoksin Kommentar Kilde
CCdB CcdA Placeret i F-plasmidet af E. coli [37]
ParE ParD Har mange kopier i Caulobacter crescentus [44]
MazF Labyrint Findes på kromosomet af E. coli og andre bakterier [25]
yafO yafN Systemet induceres af SOS-responset på DNA-skade i E. coli [41]
HicA hicb Findes i arkæer og bakterier [45]
barn Kis Stabiliserer plasmid R1 ; relateret til CCdB/A-system [16]

Type III

Toxin ToxN
Identifikatorer
Symbol ToxN, type III toksin-antitoksin-systemer
Pfam PF13958
Tilgængelige proteinstrukturer
Pfam strukturer
FBF RCSB FBF ; PDBe ; PDBj
PDBsum 3D model

Type III toksin-antitoksin-systemer er afhængige af den direkte interaktion mellem protein-toksin og RNA-antitoksin. Proteinets toksiske virkninger neutraliseres direkte af RNA'et [6] . Det eneste kendte eksempel på nuværende tidspunkt er ToxIN-systemet, der findes i den plantepatogene bakterie Pectobacterium carotovorum . ToxN-toksinproteinet er omkring 170 aminosyrerester langt og er giftigt for E. coli . Dets toksicitet hæmmes af ToxI RNA , som indeholder 5,5 tandemgentagelser af et 36 nukleotidmotiv (AGGTGATTTGCTACCTTTAAGTGCAGCTAGAAATTC) [46] [47] . Krystallografisk analyse af ToxIN viste, at inhibering af ToxN kræver dannelsen af ​​et trimerisk ToxIN-kompleks, hvor tre monomerer er bundet til tre ToxN-monomerer . Komplekset holdes sammen af ​​flere RNA-protein-interaktioner [48] .

Bioteknologiske applikationer

Bioteknologiske anvendelser af toksin-antitoksin-systemer er startet af flere bioteknologiske virksomheder [10] [16] . Toksin-antitoksin-systemer bruges hovedsageligt til at opretholde plasmider i store cellekulturer af bakterier. I et eksperiment, der testede effektiviteten af ​​hok/sok - locuset , blev det vist, at det indsatte plasmid, der udtrykker beta-galactosidase , var 8-22 gange mere stabilt under celledelinger end i en kontrolkultur uden toksin-antitoksin-systemet [49] [ 49] 50] . I meget anvendte mikrobiologiske processer, såsom fermentering , har de datterceller, der ikke har arvet et plasmid, en større fitness sammenlignet med celler, der indeholder plasmider, og i sidste ende kan celler, der mangler plasmider, fuldstændig fortrænge værdifulde industrielle mikroorganismer. Således hjælper toksin-antitoksin-systemer, der hjælper med at opretholde vigtige plasmider, med at opretholde effektiviteten af ​​industrielle processer [10] .

Derudover kan toksin-antitoksin-systemer blive mål for antibiotika i fremtiden. Induktionen af ​​patogen-dræbende molekyler kan hjælpe med at overvinde det voksende problem med multilægemiddelresistens [51] .

Udvælgelse af plasmider indeholdende -insertet er et almindeligt problem ved DNA- kloning . Toksin-antitoksin-systemer kan kun bruges til positivt at udvælge de celler, der indeholder plasmidet med det indsatte af interesse for forskeren, mens de kasseres de celler, der ikke indeholder det indsatte gen. For eksempel er CcdB -genet, der koder for toksinet, indsat i plasmidvektorer [52] . Genet af interesse går derefter i rekombination med CcdB -genet , hvilket inaktiverer transkription af det toksiske protein. Derfor dør transformerede celler, der indeholder plasmidet, men ikke insertet, på grund af CcdB-proteinets toksiske egenskaber , og kun de celler, der har plasmidet med insertet, overlever [10] .

Det er også muligt at bruge både CcdB-toksin og CcdA-antitoksin. CcdB findes i det rekombinante bakterielle genom, og en inaktiveret version af CcdA indsættes i en lineær plasmidvektor. En kort sekvens er fusioneret til genet af interesse, som aktiverer antitoksingenet, når det indsættes på det sted. Ved hjælp af denne metode er det muligt at opnå en retningsspecifik genindsættelse [52] .

Noter

  1. ↑ 1 2 3 4 5 Van Melderen L. , Saavedra De Bast M. Bakterielle toksin-antitoksinsystemer: mere end selviske enheder?  (engelsk)  // PLoS genetik. - 2009. - Bd. 5, nr. 3 . — P. e1000437. - doi : 10.1371/journal.pgen.1000437 . — PMID 19325885 .
  2. ↑ Gerdes K. Toxin-antitoksin moduler kan regulere syntesen af ​​makromolekyler under ernæringsmæssig stress.  (engelsk)  // Journal of bacteriology. - 2000. - Vol. 182, nr. 3 . - S. 561-572. — PMID 10633087 .
  3. ↑ 1 2 Faridani OR , Nikravesh A. , Pandey DP , Gerdes K. , Good L. Konkurrerende inhibering af naturlige antisense Sok-RNA-interaktioner aktiverer Hok-medieret celledrab i Escherichia coli.  (engelsk)  // Nukleinsyreforskning. - 2006. - Bd. 34, nr. 20 . - P. 5915-5922. doi : 10.1093 / nar/gkl750 . — PMID 17065468 .
  4. ↑ Fozo EM , Makarova KS , Shabalina SA , Yutin N. , Koonin EV , Storz G. Overflod af type I toksin-antitoksinsystemer i bakterier: søgninger efter nye kandidater og opdagelse af nye familier.  (engelsk)  // Nukleinsyreforskning. - 2010. - Bd. 38, nr. 11 . - s. 3743-3759. - doi : 10.1093/nar/gkq054 . — PMID 20156992 .
  5. ↑ 1 2 Gerdes K. , Wagner EG RNA antitoksiner.  (engelsk)  // Aktuel mening i mikrobiologi. - 2007. - Bd. 10, nr. 2 . - S. 117-124. - doi : 10.1016/j.mib.2007.03.003 . — PMID 17376733 .
  6. ↑ 1 2 Labrie SJ , Samson JE , Moineau S. Bakteriofagresistensmekanismer.  (engelsk)  // Naturanmeldelser. mikrobiologi. - 2010. - Bd. 8, nr. 5 . - s. 317-327. - doi : 10.1038/nrmicro2315 . — PMID 20348932 .
  7. ↑ Mine N. , Guglielmini J. , Wilbaux M. , Van Melderen L. Nedbrydningen af ​​det kromosomalt kodede ccdO157-toksin-antitoksinsystem i Escherichia coli-arterne.  (engelsk)  // Genetik. - 2009. - Bd. 181, nr. 4 . - S. 1557-1566. - doi : 10.1534/genetics.108.095190 . — PMID 19189956 .
  8. ↑ 1 2 3 Hayes F. Toksiner-antitoksiner: plasmidvedligeholdelse, programmeret celledød og cellecyklusstandsning.  (engelsk)  // Science (New York, NY). - 2003. - Bd. 301, nr. 5639 . - S. 1496-1499. - doi : 10.1126/science.1088157 . — PMID 12970556 .
  9. ↑ 1 2 Rowe-Magnus DA , Guerout AM , Biskri L. , Bouige P. , Mazel D. Komparativ analyse af superintegroner: konstruktion af omfattende genetisk diversitet i Vibrionaceae.  (engelsk)  // Genomforskning. - 2003. - Bd. 13, nr. 3 . - S. 428-442. - doi : 10.1101/gr.617103 . — PMID 12618374 .
  10. ↑ 1 2 3 4 Stieber D. , Gabant P. , Szpirer C. Kunsten at selektivt drab: plasmidtoksin/antitoksinsystemer og deres teknologiske anvendelser.  (engelsk)  // BioTechniques. - 2008. - Bd. 45, nr. 3 . - S. 344-346. - doi : 10.2144/000112955 . — PMID 18778262 .
  11. ↑ Cooper TF , Heinemann JA Postsegregational drab øger ikke plasmidstabiliteten, men virker til at mediere udelukkelsen af ​​konkurrerende plasmider.  (engelsk)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 2000. - Vol. 97, nr. 23 . - P. 12643-12648. - doi : 10.1073/pnas.220077897 . — PMID 11058151 .
  12. ↑ 1 2 Mochizuki A. , Yahara K. , Kobayashi I. , Iwasa Y. Genetisk afhængighed: egoistisk gens strategi for symbiose i genomet.  (engelsk)  // Genetik. - 2006. - Bd. 172, nr. 2 . - S. 1309-1323. - doi : 10.1534/genetics.105.042895 . — PMID 16299387 .
  13. ↑ 1 2 Pandey DP , Gerdes K. Toxin-antitoxin loci er meget rigelige i fritlevende, men tabt fra værtsassocierede prokaryoter.  (engelsk)  // Nukleinsyreforskning. - 2005. - Bd. 33, nr. 3 . - S. 966-976. - doi : 10.1093/nar/gki201 . — PMID 15718296 .
  14. ↑ 1 2 3 Sevin EW , Barloy-Hubler F. RASTA-Bakterier: et webbaseret værktøj til at identificere toksin-antitoksin loci i prokaryoter.  (engelsk)  // Genombiologi. - 2007. - Bd. 8, nr. 8 . - S. 155. - doi : 10.1186/gb-2007-8-8-r155 . — PMID 17678530 .
  15. ↑ Aizenman E. , Engelberg-Kulka H. , Glaser G. An Escherichia coli kromosomalt "afhængighedsmodul" reguleret af guanosin [korrigeret 3',5'-bispyrophosphat: en model for programmeret bakteriel celledød.]  (engelsk)  // Proceedings af National Academy of Sciences i USA. - 1996. - Bd. 93, nr. 12 . - P. 6059-6063. — PMID 8650219 .
  16. ↑ 1 2 3 4 Diago-Navarro E. , Hernandez-Arriaga AM , López-Villarejo J. , Muñoz-Gómez AJ , Kamphuis MB , Boelens R. , Lemonnier M. , Díaz-Orejas R. parD toxin-antiplasitoxin system R1 - grundlæggende bidrag, bioteknologiske anvendelser og relationer med nært beslægtede toksin-antitoksin-systemer.  (engelsk)  // FEBS-tidsskriftet. - 2010. - Bd. 277, nr. 15 . - P. 3097-3117. - doi : 10.1111/j.1742-4658.2010.07722.x . — PMID 20569269 .
  17. ↑ Christensen SK , Mikkelsen M. , Pedersen K. , Gerdes K. RelE, a global inhibitor of translation, er aktiveret under ernæringsstress.  (engelsk)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 2001. - Bd. 98, nr. 25 . - P. 14328-14333. - doi : 10.1073/pnas.251327898 . — PMID 11717402 .
  18. ↑ 1 2 Nariya H. , Inouye M. MazF, en mRNA-interferase, medierer programmeret celledød under multicellulær Myxococcus-udvikling.  (engelsk)  // Cell. - 2008. - Bd. 132, nr. 1 . - S. 55-66. - doi : 10.1016/j.cell.2007.11.044 . — PMID 18191220 .
  19. ↑ Curtis PD , Taylor RG , Welch RD , Shimkets LJ Rumlig organisering af Myxococcus xanthus under dannelse af frugtlegeme.  (engelsk)  // Journal of bacteriology. - 2007. - Bd. 189, nr. 24 . - P. 9126-9130. - doi : 10.1128/JB.01008-07 . — PMID 17921303 .
  20. ↑ Saavedra De Bast M. , Mine N. , Van Melderen L. Kromosomale toksin-antitoksinsystemer kan fungere som antiafhængighedsmoduler.  (engelsk)  // Journal of bacteriology. - 2008. - Bd. 190, nr. 13 . - P. 4603-4609. - doi : 10.1128/JB.00357-08 . — PMID 18441063 .
  21. ↑ Magnuson RD Hypotetiske funktioner af toksin-antitoksinsystemer.  (engelsk)  // Journal of bacteriology. - 2007. - Bd. 189, nr. 17 . - P. 6089-6092. - doi : 10.1128/JB.00958-07 . — PMID 17616596 .
  22. ↑ Engelberg-Kulka H. , Amitai S. , Kolodkin-Gal I. , Hazan R. Bakterieprogrammeret celledød og multicellulær adfærd i bakterier.  (engelsk)  // PLoS genetik. - 2006. - Bd. 2, nr. 10 . — P. e135. - doi : 10.1371/journal.pgen.0020135 . — PMID 17069462 .
  23. ↑ Pimentel B. , Madine MA , de la Cueva-Méndez G. Kid spalter specifikke mRNA'er på UUACU-steder for at redde kopiantallet af plasmid R1.  (engelsk)  // EMBO-tidsskriftet. - 2005. - Bd. 24, nr. 19 . - P. 3459-3469. - doi : 10.1038/sj.emboj.7600815 . — PMID 16163387 .
  24. ↑ Kussell E. , Kishony R. , Balaban NQ , Leibler S. Bakteriel persistens: en model for overlevelse i skiftende miljøer.  (engelsk)  // Genetik. - 2005. - Bd. 169, nr. 4 . - S. 1807-1814. - doi : 10.1534/genetics.104.035352 . — PMID 15687275 .
  25. ↑ 1 2 Hazan R. , Engelberg-Kulka H. Escherichia coli mazEF-medieret celledød som en forsvarsmekanisme, der hæmmer spredningen af ​​fag P1.  (engelsk)  // Molekylær genetik og genomik : MGG. - 2004. - Bd. 272, nr. 2 . - S. 227-234. - doi : 10.1007/s00438-004-1048-y . — PMID 15316771 .
  26. ↑ Pecota DC , Wood TK Eksklusion af T4-fag af hok/sok dræberlocuset fra plasmid R1.  (engelsk)  // Journal of bacteriology. - 1996. - Bd. 178, nr. 7 . - S. 2044-2050. — PMID 8606182 .
  27. ↑ Tsilibaris V. , Maenhaut-Michel G. , Mine N. , Van Melderen L. Hvad er fordelen for Escherichia coli ved at have flere toksin-antitoksinsystemer i dets genom?  (engelsk)  // Journal of bacteriology. - 2007. - Bd. 189, nr. 17 . - s. 6101-6108. - doi : 10.1128/JB.00527-07 . — PMID 17513477 .
  28. ↑ 1 2 3 4 5 Fozo EM , Hemm MR , Storz G. Små giftige proteiner og de antisense RNA'er der undertrykker dem.  (engelsk)  // Mikrobiologi og molekylærbiologi anmeldelser: MMBR. - 2008. - Bd. 72, nr. 4 . - s. 579-589. - doi : 10.1128/MMBR.00025-08 . — PMID 19052321 .
  29. ↑ Greenfield TJ , Ehli E. , Kirshenmann T. , Franch T. , Gerdes K. , Weaver KE Antisense-RNA'et af par-locuset af pAD1 regulerer ekspressionen af ​​et 33-aminosyre-toksisk peptid ved en usædvanlig mekanisme.  (engelsk)  // Molekylær mikrobiologi. - 2000. - Vol. 37, nr. 3 . - S. 652-660. — PMID 10931358 .
  30. ↑ Vogel J. , Argaman L. , Wagner EG , Altuvia S. Det lille RNA IstR hæmmer syntesen af ​​et SOS-induceret toksisk peptid.  (engelsk)  // Aktuel biologi : CB. - 2004. - Bd. 14, nr. 24 . - s. 2271-2276. - doi : 10.1016/j.cub.2004.12.003 . — PMID 15620655 .
  31. ↑ Kawano M. , Oshima T. , Kasai H. , Mori H. Molekylær karakterisering af lang direkte gentagelse (LDR) sekvenser, der udtrykker et stabilt mRNA, der koder for et 35-aminosyre celledræbende peptid og et cis-kodet lille antisense RNA i Escherichia coli.  (engelsk)  // Molekylær mikrobiologi. - 2002. - Bd. 45, nr. 2 . - S. 333-349. — PMID 12123448 .
  32. ↑ Loh SM , Cram DS , Skurray RA Nukleotidsekvens og transkriptionel analyse af en tredje funktion (Flm) involveret i F-plasmidvedligeholdelse.  (engelsk)  // Gene. - 1988. - Bd. 66, nr. 2 . - S. 259-268. — PMID 3049248 .
  33. ↑ Fozo EM , Kawano M. , Fontaine F. , Kaya Y. , Mendieta KS , Jones KL , Ocampo A. , Rudd KE , Storz G. Undertrykkelse af små toksisk proteinsyntese af Sib og OhsC små RNA'er.  (engelsk)  // Molekylær mikrobiologi. - 2008. - Bd. 70, nr. 5 . - S. 1076-1093. - doi : 10.1111/j.1365-2958.2008.06394.x . — PMID 18710431 .
  34. ↑ Silvaggi JM , Perkins JB , Losick R. Lille utranslateret RNA-antitoksin i Bacillus subtilis.  (engelsk)  // Journal of bacteriology. - 2005. - Bd. 187, nr. 19 . - P. 6641-6650. - doi : 10.1128/JB.187.19.6641-6650.2005 . — PMID 16166525 .
  35. ↑ Findeiss S. , Schmidtke C. , Stadler PF , Bonas U. En ny familie af plasmid-overførte anti-sense ncRNA'er.  (engelsk)  // RNA biologi. - 2010. - Bd. 7, nr. 2 . - S. 120-124. — PMID 20220307 .
  36. ↑ Robson J. , McKenzie JL , Cursons R. , Cook GM , Arcus VL VapBC-operonen fra Mycobacterium smegmatis er et autoreguleret toksin-antitoksin-modul, der kontrollerer vækst via inhibering af translation.  (engelsk)  // Journal of molecular biology. - 2009. - Bd. 390, nr. 3 . - S. 353-367. - doi : 10.1016/j.jmb.2009.05.006 . — PMID 19445953 .
  37. ↑ 1 2 Bernard P. , Couturier M. Celledrab af F-plasmidet CcdB-protein involverer forgiftning af DNA-topoisomerase II-komplekser.  (engelsk)  // Journal of molecular biology. - 1992. - Bd. 226, nr. 3 . - s. 735-745. — PMID 1324324 .
  38. ↑ Zhang Y. , Zhang J. , Hoeflich KP , Ikura M. , Qing G. , Inouye M. MazF spalter cellulære mRNA'er specifikt ved ACA for at blokere proteinsyntese i Escherichia coli.  (engelsk)  // Molecular cell. - 2003. - Bd. 12, nr. 4 . - P. 913-923. — PMID 14580342 .
  39. ↑ Christensen-Dalsgaard M. , Overgaard M. , Winther KS , Gerdes K. RNA-decay by messenger RNA interferases.  (engelsk)  // Metoder i enzymologi. - 2008. - Bd. 447.-P. 521-535. - doi : 10.1016/S0076-6879(08)02225-8 . — PMID 19161859 .
  40. ↑ Yamaguchi Y. , Inouye M. mRNA-interferaser, sekvensspecifikke endoribonukleaser fra toksin-antitoksin-systemerne.  (Engelsk)  // Fremskridt inden for molekylærbiologi og translationel videnskab. - 2009. - Bd. 85. - S. 467-500. - doi : 10.1016/S0079-6603(08)00812-X . — PMID 19215780 .
  41. ↑ 1 2 Singletary LA , Gibson JL , Tanner EJ , McKenzie GJ , Lee PL , Gonzalez C. , Rosenberg SM Et SOS-reguleret type 2 toksin-antitoksin system.  (engelsk)  // Journal of bacteriology. - 2009. - Bd. 191, nr. 24 . - P. 7456-7465. - doi : 10.1128/JB.00963-09 . — PMID 19837801 .
  42. ↑ Zhang J. , Inouye M. MazG, en nukleosidtrifosfatpyrophosphohydrolase, interagerer med Era, en essentiel GTPase i Escherichia coli.  (engelsk)  // Journal of bacteriology. - 2002. - Bd. 184, nr. 19 . - P. 5323-5329. — PMID 12218018 .
  43. ↑ Gross M. , Marianovsky I. , Glaser G. MazG - en regulator af programmeret celledød i Escherichia coli.  (engelsk)  // Molekylær mikrobiologi. - 2006. - Bd. 59, nr. 2 . - S. 590-601. - doi : 10.1111/j.1365-2958.2005.04956.x . — PMID 16390452 .
  44. ↑ Fiebig A. , Castro Rojas CM , Siegal-Gaskins D. , Crosson S. Interaktionsspecificitet, toksicitet og regulering af et paralogt sæt af ParE/RelE-familiens toksin-antitoksinsystemer.  (engelsk)  // Molekylær mikrobiologi. - 2010. - Bd. 77, nr. 1 . - S. 236-251. - doi : 10.1111/j.1365-2958.2010.07207.x . — PMID 20487277 .
  45. ↑ Jørgensen MG , Pandey DP , Jaskolska M. , Gerdes K. HicA fra Escherichia coli definerer en ny familie af translationsuafhængige mRNA-interferaser i bakterier og archaea.  (engelsk)  // Journal of bacteriology. - 2009. - Bd. 191, nr. 4 . - S. 1191-1199. - doi : 10.1128/JB.01013-08 . — PMID 19060138 .
  46. ↑ Fineran PC , Blower TR , Foulds IJ , Humphreys DP , Lilley KS , Salmond GP Det abortive faginfektionssystem, ToxIN, fungerer som et protein-RNA-toksin-antitoksin-par.  (engelsk)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 2009. - Bd. 106, nr. 3 . - S. 894-899. - doi : 10.1073/pnas.0808832106 . — PMID 19124776 .
  47. ↑ Blower TR , Fineran PC , Johnson MJ , Toth IK , Humphreys DP , Salmond GP Mutagenese og funktionel karakterisering af RNA- og proteinkomponenterne af toksin-abortinfektionen og toksin-antitoksin-locus af Erwinia.  (engelsk)  // Journal of bacteriology. - 2009. - Bd. 191, nr. 19 . - P. 6029-6039. - doi : 10.1128/JB.00720-09 . — PMID 19633081 .
  48. ↑ Blower TR , Pei XY , Short FL , Fineran PC , Humphreys DP , Luisi BF , Salmond GP Et behandlet ikke-kodende RNA regulerer et altruistisk bakterielt antiviralt system.  (engelsk)  // Naturens strukturelle & molekylære biologi. - 2011. - Bd. 18, nr. 2 . - S. 185-190. - doi : 10.1038/nsmb.1981 . — PMID 21240270 .
  49. ↑ Wu K. , Jahng D. , Wood TK Temperatur- og væksthastighedseffekter på hok/sok dræberlocuset for forbedret plasmidstabilitet.  (engelsk)  // Bioteknologiske fremskridt. - 1994. - Bd. 10, nr. 6 . - s. 621-629. - doi : 10.1021/bp00030a600 . — PMID 7765697 .
  50. ↑ Pecota DC , Kim CS , Wu K. , Gerdes K. , Wood TK Kombination af hok/sok, parDE og pnd postsegregational dræber loci for at øge plasmidstabiliteten.  (engelsk)  // Anvendt og miljømæssig mikrobiologi. - 1997. - Bd. 63, nr. 5 . - S. 1917-1924. — PMID 9143123 .
  51. ↑ Gerdes K. , Christensen SK , Løbner-Olesen A. Prokaryotic toxin-antitoxin stress response loci.  (engelsk)  // Naturanmeldelser. mikrobiologi. - 2005. - Bd. 3, nr. 5 . - s. 371-382. - doi : 10.1038/nrmicro1147 . — PMID 15864262 .
  52. ↑ 1 2 Bernard P. , Gabant P. , Bahassi EM , Couturier M. Positive-selektionsvektorer, der anvender F-plasmid ccdB dræbergenet.  (engelsk)  // Gene. - 1994. - Bd. 148, nr. 1 . - S. 71-74. — PMID 7926841 .

Litteratur

Links