Proteom

Den aktuelle version af siden er endnu ikke blevet gennemgået af erfarne bidragydere og kan afvige væsentligt fra den version , der blev gennemgået den 25. august 2019; verifikation kræver 1 redigering .

Et proteom  er et sæt kropsproteiner produceret af en celle, væv eller organisme over en bestemt periode. Eller mere strengt er det helheden af ​​udtrykte proteiner i en given celletype eller i en organisme på et givet tidsrum under givne forhold. Udtrykket er et derivat af ordet "protein" (protein), der har samme oprindelse som ordet " genom " (helheden af ​​alle en organismes gener).

Udtrykket er blevet anvendt på flere forskellige typer biologiske systemer. Et celleproteom  er et sæt proteiner, der findes i en bestemt celle under visse miljøforhold, såsom under påvirkning af visse hormoner . Det komplette proteom af en organisme er det samlede sæt af proteomer af alle celler. Udtrykket "proteom" refererer også til et sæt proteiner fra en subcellulær organisme, såsom et virus (viralt proteom).

Proteomet, især i eukaryoter , er større end genomet, hvilket betyder, at der er flere proteiner end gener . Dette skyldes alternativ splejsning såvel som post-translationel modifikation af proteiner, såsom deres glycosylering og phosphorylering .

Mens genomet er defineret af sekvensen af ​​nukleotider , er proteomet ikke summen af ​​sekvenserne af aminosyrer . Proteomet omfatter også de rumlige strukturer af alle de proteiner, det indeholder (se sekundær proteinstruktur , tertiær proteinstruktur ) og den funktionelle interaktion mellem dem.

Proteomics  , videnskaben om proteomer, har udviklet sig stort set gennem adskillelse af proteiner ved todimensionel elektroforese . Den første måling er adskillelsen af ​​proteiner baseret på deres elektriske ladning ved isoelektrisk fokusering . Den anden dimension er adskillelsen af ​​proteiner baseret på deres molekylvægt ved hjælp af en:SDS-PAGE-metoden .

Historie

Udtrykket "proteom" blev foreslået i 1994 af den australske videnskabsmand Mark Wilkins [1] ved symposiet 2D Electrophoresis: from protein maps to genomes" i Siena , Italien . Udtrykket dukkede op på tryk i 1995 [2] i udgivelsen af ​​en del af Wilkins' ph.d.-afhandling.

Proteomforskning er et stort internationalt videnskabeligt projekt . I 2001 blev den internationale Human Proteome Organisation (HUPO )  oprettet for at arbejde på det . Deltagerne i projektet er særligt opmærksomme på proteinerne i blodet, leveren og hjernen.

Se også

Noter

  1. Wilkins, Marc. Proteomics data mining  (neopr.)  // Ekspertgennemgang af proteomics . - England , 2009. - December ( bd. 6 , nr. 6 ). - S. 599-603 . - doi : 10.1586/epr.09.81 . — PMID 19929606 .
  2. Wasinger VC, Cordwell SJ, Cerpa-Poljak A., Yan JX, Gooley AA, Wilkins MR, Duncan MW, Harris R., Williams KL, Humphery-Smith I. Fremskridt med gen-produktkortlægning af Mollicutes: Mycoplasma genitalium  ( Engelsk)  // Elektroforese: tidsskrift. - 1995. - Bd. 7 , nr. 7 . - S. 1090-1094 . - doi : 10.1002/elps.11501601185 . — PMID 7498152 .

Links