Interkalation er den reversible inklusion af et molekyle eller en gruppe mellem andre molekyler eller grupper.
Der er flere måder, hvorpå molekyler (kaldet ligander i denne sammenhæng ) kan interagere med DNA . Ligander kan binde kovalent eller elektrostatisk eller interkalere. Interkalation er mulig, hvis liganden er af passende størrelse og kemisk natur og kan passe mellem DNA-baserne. Sådanne ligander har sædvanligvis en polycyklisk, aromatisk struktur og er plane. [en]
DNA-interkalatorer bruges i kemoterapi til at hæmme DNA-replikation i hurtigtvoksende cancerceller , såsom doxorubicin ( adriamycin ) og daunorubicin (begge anvendes til behandling af Hodgkins sygdom ) og dactinomycin (bruges til behandling af nefroblastom , Ewings sarkomadom og sarkom ).
Interaktionen af RNA-polymerase med DNA-skabelonen blokeres af antitumor-antibiotikummet actinomycin D, som binder i hullerne mellem tilstødende par af nitrogenholdige baser, ofte mellem GC-par (interkalationsproces), hvilket modvirker interaktionen af enzymet med polydeoxyribonukleotidkæden.
I molekylærbiologi bruges interkalerende midler såsom ethidiumbromid til fluorescensmærkning af DNA, såsom DNA- agarosegelelektroforese . [en]
| kemisk binding | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Intramolekylær interaktion |
| ||||||||||||
| Intermolekylær interaktion | |||||||||||||