Proteobakterier | ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Escherichia coli | ||||||||||||
videnskabelig klassifikation | ||||||||||||
Domæne:bakterieType:Proteobakterier | ||||||||||||
Internationalt videnskabeligt navn | ||||||||||||
Proteobacteria Stackebrandt et al. 1986 | ||||||||||||
Undergrupper | ||||||||||||
Acidithiobacilla
Alphaproteobacteria
Betaproteobacteria
Gammaproteobacteria
Deltaproteobacteria
Epsilonproteobacteria
Zetaproteobacteria
Oligofleksi
|
||||||||||||
|
Proteobakterier ( lat. Proteobacteria ) er den mest talrige gruppe af bakterier - 1534 arter eller omkring en tredjedel af alle kendte bakteriearter [1] .
Proteobakterier er en meget heterogen gruppe, denne gruppe omfatter både eukaryote symbionter , såvel som et stort antal patogene og opportunistiske mikroorganismer , foto- og kemotrofe bakteriearter, både autotrofer og heterotrofer . Alle proteobakterier er gram-negative med en ydre membran bygget af lipopolysaccharid . Gruppen omfatter både obligate og fakultative aerobe og anaerobe bakterier. Bevægelsestyperne er også forskellige, gruppen omfatter både bakterier med flageller , samt immobile bakterier og bakterier med de såkaldte. "glidende" type bevægelse.
Morfologisk er gruppen også heterogen: dette omfatter stavformede bakterier og kokker og spiralformede bakterier.
Carl Woese udpegede denne gruppe i 1987 og kaldte den i spøg for "lilla bakterier og deres slægtninge" [2] . Gruppen blev isoleret baseret på analysen af 16S rRNA - nukleotidsekvenser , opkaldt efter den antikke græske gud Proteus , som vidste, hvordan man ændrede form efter behag (navnet på proteobakterier afspejler en bred vifte af biokemiske, fysiologiske og morfologiske egenskaber, der er iboende i denne gruppe ).
Baseret på reglerne for bakteriel nomenklatur er Proteobacterium-taxonet illegitimt på grund af fraværet af en defineret type lavere taxon [3] .
Proteobakterier er opdelt i klasser , betegnet med bogstaverne i det græske alfabet: Alpha- , Beta- , Gamma- , Delta- og Epsilonproteobacteria . Inddelingen i klasser blev også foretaget på baggrund af analysen af 16S rRNA . Alfa-, beta-, delta- og epsilon-proteobakterieklasserne er monofyletiske [4] [5] [6] . Slægten Acidithiobacillus fra klassen Gammaproteobacteria blev overført til klassen Acidithiobacilli i 2013 [7] . Ifølge nyere data er denne slægt parafyletisk med hensyn til beta-proteobakterier [8] . Relativt for nylig blev den sjette klasse beskrevet - zeta-proteobakterier ( Zetaproteobacteria ), hvis repræsentant indtil videre er den eneste art (isoleret i ren kultur) - Mariprofundus ferrooxydans [9] , en jernoxiderende neutrofil kemolitoautotrof, først opdaget nær Loihi- vulkanen i 1996 [10] .
Klassen af alfa-proteobakterier omfatter et stort antal fototrofer, den omfatter også symbionter af eukaryoter ( Rhizobium ), obligate intracellulære parasitter ( Rickettsia , Wolbachia ), eddikesyrebakterier ( Acetobacter , Gluconacetobacter ), bakterier, der er i stand til at mobilisere alkohol ( Zymomona ) methylotrofer ( Methylobacteriaceae ) . Den formodede forfader til mitokondrier kommer også fra denne gruppe.
Denne klasse omfatter aerobe og fakultative anaerobe bakterier. Dette omfatter både kemoorganoheterotrofer og kemolitoautotrofer (f.eks. stadium I nitrifiers Nitrosomonadaceae , thiobacteria Thiobacillus ), fototrofiske slægter ( Rhodocyclus og Rubrivivax ). Også inkluderet i denne gruppe er infektionsstoffer: Burkholderia mallei (forårsager til kirtler ) og Burkholderia pseudomallei (forårsager melioidose ), Bordetella pertussis (forårsager til kighoste ) og slægten Neisseria (patogener af meningitis og gonoré ).
Denne klasse omfatter både fototrofiske bakterier (f.eks. Chromatium - lilla svovlanoxygene bakterier), metanotrofer (f.eks. Methylococcus capsulatus ) og bakterier af klinisk og videnskabelig betydning - familierne Enterobacteriaceae , Vibrionaceae , Pseudomonadellaceae , Legionellaceaee , Paciionellaceaee og Franciscus . Denne gruppe omfatter sådanne patogener af særligt farlige infektioner: Yersinia pestis , Francisella tularensis , Haemophilus influenzae , Legionella pneumophila og Vibrio cholerae , såvel som en så vigtig modelorganisme fra et videnskabeligt synspunkt som Escherichia coli .
Denne gruppe omfatter så velkendte bakterier som myxobakterier , der er i stand til at glide og danne flercellede frugtlegemer , såvel som velkendte sulfatreducerende bakterier ( Desulfovibrio , Desulfobacter , Desulfococcus , Desulfonema ) og svovlbakterier ( Desulfuromonas ). Dette omfatter også anaerobe jernbakterier ( Geobacter ). Det omfatter også kendte rovdyrbakterier af slægten Bdellovibrio , obligate intracellulære bakterier af slægten Lawsonia , kemolitotrofer af slægten Hippea , der er i stand til at bruge svovl og brint som energikilde. Klassen omfatter både aerobe og anaerobe bakterier, fakultative anaerobe kendes ikke i denne klasse. De fleste anaerober er i stand til at bruge uorganiske elektronacceptorer og udfører således anaerob respiration . Repræsentanter for klassen spiller en vigtig rolle i kredsløbet af elementer i naturen.
Dette omfatter ordenen Campylobacterales med familierne Campylobacteraceae og Helicobacteraceae , herunder den geokemisk vigtige slægt Sulfurospirillum [11] , det forårsagende middel til menneskelige sår , Helicobacter pylori . Også inkluderet er Wolinella drøvtyggeres fordøjelseskanal symbionter .
Fylogeni af proteobakterier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||