IRF7

Interferon regulatorisk faktor 7

Tilgængelige strukturer

Ortholog søgning: PDBe , RCSB

Liste over PDB-id'er
2O61

Identifikatorer

Symbol

IRF7 ; IRF-7H; IRF7A; IRF7B; IRF7C; IRF7H

Eksterne ID'er

OMIM: 605047 MGI : 1859212 HomoloGene : 128624 GeneCards : IRF7 Gen

Gen-ontologi
Fungere	• RNA-polymerase II-kernepromotorsekvensspecifik DNA-binding • RNA-polymerase II kernepromotor proksimal region sekvensspecifik DNA-bindende transkriptionsfaktoraktivitet • DNA-binding • proteinbinding
celle komponent	• kerne • nukleoplasma • cytoplasma • cytosol • endosommembran
biologisk proces	• negativ regulering af transkription fra RNA-polymerase II-promotor • toll-lignende receptor signalvej • MyD88-uafhængig toll-lignende receptor signalvej • regulering af adaptiv immunrespons • transkription fra RNA polymerase II promotor • cellulær respons på DNA skade stimulus • respons på virus • immunglobulin medieret immunrespons • etablering af viral latens • cytokin-medieret signalvej • regulering af type I interferon produktion • positiv regulering af type I interferon produktion • interferon-alfa produktion • interferon-beta produktion • positiv regulering af interferon-alfa produktion • positiv regulering af interferon-beta produktion • regulering af MyD88-afhængig afgiftslignende receptor signalvej • regulering af MyD88-uafhængig afgiftslignende receptor signalvej • afgiftslignende receptor 3 signalvej • afgiftslignende receptor 4 signalvej • afgiftslignende receptor 9 signalvej • TRIF -afhængig afgiftslignende receptor signalvej • MDA-5 signalvej • medfødt immunrespons • type I interferon biosyntetisk proces • regulering af monocytdifferentiering • positiv regulering af transkription, DNA-templeret • positiv regulering af transkription fra RNA polymerase II promotor • regulering af immunrespons • interferon-gamma-medieret signalvej • type I interferon signalvej • positiv regulering af type I interferon-medieret signalvej • negativ regulering af makrofag apoptotisk proces
Kilder: Amigo / QuickGO

RNA-ekspressionsprofil

Mere information

ortologer

Udsigt

Human

Mus

Entrez

RefSeq (mRNA)

RefSeq (protein)

Locus (UCSC)

Chr 11:
0,61 – 0,62 Mb

Chr 7:
141,26 – 141,27 Mb

Søg i PubMed

[en]

[2]

Interferon regulatorisk faktor 7 , også kendt som IRF7 , er medlem af interferon transkriptions regulatoriske faktorfamilien .

Funktion

IRF7 koder for interferon regulatorisk faktor 7, et medlem af interferon transcription regulatory factor (IRF) familien. IRF7 har vist sig at spille en vigtig rolle i transkriptionel aktivering af virus-inducerede cellulære gener, herunder type I interferon gener.IRF7 regulerer især mange interferon-alfa gener. [1] Den konstitutive ekspression af IRF7 er hovedsageligt begrænset til lymfoidt væv, hovedsageligt dendritiske celleplasmaceller , mens IRF7 induceres i mange væv. Flere varianter af IRF7-transkripter er blevet identificeret, selvom deres funktionelle implikationer endnu ikke er blevet fastslået. [2]

IRF7-vejene har vist sig at være nedreguleret i nogle metastaserende brystkræftcellelinjer, hvilket kan hjælpe cellerne med at undgå immunresponset. [3] Gendannelse af IRF7 i disse cellelinjer resulterer i reduceret metastase og øget overlevelsestid i dyremodeller.

IRF7-genet og produktet var defekte hos patienter med alvorlig modtagelighed for H1N1- influenza , mens dem med modtagelighed for andre virussygdomme såsom CMV, RSV og parainfluenza forblev uændrede. [fire]

Interaktioner

IRF7 har vist sig at interagere med IRF3 . [5]

Se også

Interferon
IRF1 , IRF2 , IRF3 , IRF4 , IRF5 , IRF6 , IRF8 og IRF9

Noter

↑ Marié I., Durbin JE, Levy DE Differentiel viral induktion af forskellige interferon-alfa-gener ved positiv feedback gennem interferon-regulatorisk faktor-7 // EMBO J. : journal. - 1998. - November ( bind 17 , nr. 22 ). - P. 6660-6669 . - doi : 10.1093/emboj/17.22.6660 . — PMID 9822609 .
↑ Entrez-gen: IRF7 interferon regulatorisk faktor 7 . (ubestemt)
↑ Bidwell. Silencing af Irf7-baner i brystkræftceller fremmer knoglemetastaser gennem immunescape . Naturmedicin (2012). Hentet: 23. juli 2012. (ubestemt)
↑ Jean-Laurent Casanova. Mod en genetisk teori om infektionssygdomme i børn . NIH (2013). Hentet 21. marts 2015. Arkiveret fra originalen 2. april 2015. (ubestemt)
↑ Au WC, Yeow WS, Pitha PM Analyse af funktionelle domæner af interferon regulatorisk faktor 7 og dens tilknytning til IRF-3 // Virology: journal. - 2001. - Februar ( bind 280 , nr. 2 ). - S. 273-282 . - doi : 10.1006/viro.2000.0782 . — PMID 11162841 .

Litteratur

Ning S., Pagano JS, Barber GN IRF7: aktivering, regulering, modifikation og funktion (engelsk) // Genes Immun. : journal. - 2011. - Bd. 12 , nr. 6 . - S. 399-414 . - doi : 10.1038/gen.2011.21 . — PMID 21490621 .
Pitha PM, Au WC, Lowther W., Juang YT, Schafer SL, Burysek L., Hiscott J., Moore PA Rolle af interferon regulatoriske faktorer (IRF'er) i virus-medieret signalering og regulering af cellevækst (engelsk) // Biokemi : journal. - 1999. - Bd. 80 , nr. 8-9 . - s. 651-658 . - doi : 10.1016/S0300-9084(99)80018-2 . — PMID 9865487 .
Zhang L., Pagano JS Struktur og funktion af IRF-7 (neopr.) // J. Interferon Cytokine Res.. - 2002. - V. 22 , nr. 1 . - S. 95-101 . - doi : 10.1089/107999002753452700 . — PMID 11846980 .
Zhang L., Pagano JS IRF-7, en ny interferon regulatorisk faktor forbundet med Epstein-Barr virus latency (engelsk) // Mol. celle. Biol. : journal. - 1997. - Bd. 17 , nr. 10 . - P. 5748-5757 . — PMID 9315633 .
Wathelet MG, Lin CH, Parekh BS, Ronco LV, Howley PM, Maniatis T. Virusinfektion inducerer samlingen af koordineret aktiverede transkriptionsfaktorer på IFN-beta-forstærkeren in vivo // Mol . celle : journal. - 1998. - Bd. 1 , nr. 4 . - S. 507-518 . - doi : 10.1016/S1097-2765(00)80051-9 . — PMID 9660935 .
Au WC, Moore PA, LaFleur DW, Tombal B., Pitha PM Karakterisering af den interferon regulatoriske faktor-7 og dens potentielle rolle i transkriptionsaktiveringen af interferon A gener // J. Biol. Chem. : journal. - 1998. - Bd. 273 , nr. 44 . - P. 29210-29217 . doi : 10.1074/ jbc.273.44.29210 . — PMID 9786932 .
Lu R., Au WC, Yeow WS, Hageman N., Pitha PM Regulering af promotoraktiviteten af interferon-regulatorisk faktor-7-gen. Aktivering ved interferon og lyddæmpning ved hypermethylering // J. Biol. Chem. : journal. - 2000. - Vol. 275 , nr. 41 . - P. 31805-31812 . - doi : 10.1074/jbc.M005288200 . — PMID 10924517 .
Paris MJ, Williams BR Karakterisering af en 500-kb contig, der spænder over regionen mellem c-Ha-Ras og MUC2 på kromosom 11p15.5 // Genomics : journal. - Academic Press , 2001. - Vol. 69 , nr. 2 . - S. 196-202 . - doi : 10.1006/geno.2000.6339 . — PMID 11031102 .
Marié I., Smith E., Prakash A., Levy DE Fosforyleringsinduceret dimerisering af interferonregulerende faktor 7 afslører DNA-binding og et bipartit transaktiveringsdomæne (engelsk) // Mol. celle. Biol. : journal. - 2000. - Vol. 20 , nej. 23 . - P. 8803-8814 . - doi : 10.1128/MCB.20.23.8803-8814.2000 . — PMID 11073981 .
Smith EJ, Marié I., Prakash A., García-Sastre A., Levy DE IRF3 og IRF7 phosphorylering i virusinficerede celler kræver ikke dobbeltstrenget RNA-afhængig proteinkinase R eller Ikappa B kinase, men blokeres af Vaccinia virus E3L protein (engelsk) // J. Biol. Chem. : journal. - 2001. - Bd. 276 , nr. 12 . - P. 8951-8957 . - doi : 10.1074/jbc.M008717200 . — PMID 11124948 .
Au WC, Yeow WS, Pitha PM Analyse af funktionelle domæner af interferon regulatorisk faktor 7 og dets tilknytning til IRF-3 (engelsk) // Virology : journal. - 2001. - Bd. 280 , nr. 2 . - S. 273-282 . - doi : 10.1006/viro.2000.0782 . — PMID 11162841 .
Lu R., Moore PA, Pitha PM Stimulering af IRF-7-genekspression ved tumornekrosefaktor alfa: krav til NFkappa B-transkriptionsfaktor og gentilgængelighed // J. Biol. Chem. : journal. - 2002. - Bd. 277 , nr. 19 . - P. 16592-16598 . - doi : 10.1074/jbc.M111440200 . — PMID 11877397 .
Morin P., Bragança J., Bandu MT, Lin R., Hiscott J., Doly J. J//Foretrukne bindingssteder for interferon-regulatoriske faktorer 3 og 7 involveret i interferon-A-gentransskription , Civas A. Biol. : journal. - 2002. - Bd. 316 , nr. 5 . - S. 1009-1022 . - doi : 10.1006/jmbi.2001.5401 . — PMID 11884139 .
Caillaud A., Prakash A., Smith E., Masumi A., Hovanessian AG, Levy DE, Marié I. Acetylering af interferon regulatorisk faktor-7 med p300/CREB-bindende protein (CBP)-associeret faktor (PCAF) forringer dens DNA-binding (engelsk) // J. Biol. Chem. : journal. - 2003. - Bd. 277 , nr. 51 . - P. 49417-49421 . - doi : 10.1074/jbc.M207484200 . — PMID 12374802 .
Izmailova E., Bertley FM, Huang Q., Makori N., Miller CJ, Young RA, Aldovini A. HIV-1 Tat omprogrammerer umodne dendritiske celler til at udtrykke kemoattraktanter for aktiverede T-celler og makrofager (engelsk) // Nat. Med. : journal. - 2003. - Bd. 9 , nr. 2 . - S. 191-197 . - doi : 10.1038/nm822 . — PMID 12539042 .
Yang H., Lin CH, Ma G., Baffi MO, Wathelet MG Interferon regulatorisk faktor-7 synergiserer med andre transkriptionsfaktorer gennem multiple interaktioner med p300/CBP-coaktivatorer // J. Biol. Chem. : journal. - 2003. - Bd. 278 , nr. 18 . - P. 15495-15504 . - doi : 10.1074/jbc.M212940200 . — PMID 12604599 .
Ning S., Hahn AM, Huye LE, Pagano JS Interferon Regulatory Factor 7 Regulates Expression of Epstein-Barr Virus Latent Membran Protein 1: a Regulatory Circuit // J. Virol. : journal. - 2003. - Bd. 77 , nr. 17 . - P. 9359-9368 . doi : 10.1128 / JVI.77.17.9359-9368.2003 . — PMID 12915551 .
Fitzgerald KA, Rowe DC, Barnes BJ, Caffrey DR, Visintin A., Latz E., Monks B., Pitha PM, Golenbock DT LPS-TLR4 Signalering til IRF-3/7 og NF-κB Involverer vejafgiftsadapterne TRAM og TRIF (engelsk) // Journal of Experimental Medicine : journal. — Rockefeller University Press, 2003. - Vol. 198 , nr. 7 . - S. 1043-1055 . - doi : 10.1084/jem.20031023 . — PMID 14517278 .
Lin R., Noyce RS, Collins SE, Everett RD, Mossman KL Herpes Simplex Virus ICP0 RING Finger Domain inhiberer IRF3- og IRF7-medieret aktivering af interferon-stimulerede gener // J. Virol. : journal. - 2004. - Bd. 78 , nr. 4 . - S. 1675-1684 . - doi : 10.1128/JVI.78.4.1675-1684.2004 . — PMID 14747533 .