IRF1

Den regulatoriske faktor interferon 1 er et protein , som hos mennesker er kodet af IRF1 -genet . [1] [2]

Funktion

Den regulatoriske faktor Interferon 1 var det første medlem af interferon regulatorisk transkriptionsfaktor (IRF)-familien , der blev identificeret. Det blev først beskrevet som en transkriptionsfaktor, der er i stand til at aktivere ekspressionen af ​​interferon beta- cytokiner , [3] , men efterfølgende blev det fundet, at IRF-1 kan fungere som en transkriptionsaktivator eller repressor af forskellige målgener. IRF-1 regulerer ekspressionen af ​​målgener ved at binde til interferonstimulerende responselementer (ISRE) i dets promotorer . IRF-1-proteinet binder til ISRE gennem N-terminal helix-turn-helix DNA-bindende domæner, [4] , som er meget konserverede blandt alle IRF-proteiner.

Ud over dets funktion som transkriptionsfaktor har IRF-1 også vist sig at være i stand til at transaktivere tumorsuppressorproteinet p53 via dets cofaktor p300 . [5]

IRF-1 har vist sig at spille en rolle i immunresponser, der regulerer apoptose , DNA-skade og tumorundertrykkelse . [6]

Forordning

Det blev fundet, at den ekstreme C-terminus af IRF-1 regulerer evnen til at aktivere transkription, nanobodies rettet mod denne region (MF1) er i stand til at øge aktiviteten af ​​IRF-1. [7]

Modelorganismer

Modelorganismer blev brugt til at studere IRF1's funktioner. En foreløbig knockout musestamme , kaldet Irf1 tm1a(EUCOMM)Wtsi , [11] [12] blev skabt under det internationale program af Knockout Mouse Consortium - et stort mutageneseprojekt til at skabe og distribuere modeldyr til sygdomsforskning af interesserede forskere - ved Sanger Instituttet . [13] [14] [15]

Han- og hundyr gennemgik standard fænotypisk test for at bestemme effekten af ​​fjernelse. [9] [16] Femogtyve forsøg blev udført, og to fænotypiske parametre blev fundet at være unormale. Homozygote mutante dyr viste patologi af perifere blodlymfocytter , især et fald i antallet af CD8 - positive T-celler og NK-celler og en stigning i CD4- positive T-celler. Musene havde også unormale hudfænotyper som bestemt ved undersøgelse af den kaudale epidermis . [9]

Interaktioner

IRF1 har vist sig at interagere med:

• CHIP [17]
• GAGE [18]
• HSP70 / HSP90 [19]
• IRF8 [20] [21]
• KPNA2 [22]
• MYD88 [23]
• PCAF [24]
• STAT1 [25]
• TAT [26]
• VEGFR2 [27]

Se også

• Interferon
• IRF1, IRF2 , IRF3 , IRF4 , IRF5 , IRF6 , IRF7 , IRF8 og IRF9

Noter

1. ↑ Maruyama M., Fujita T., Taniguchi T. Sekvens af et cDNA, der koder for human IRF-1  //  Nucleic Acids Res : journal. - 1989. - Juni ( bind 17 , nr. 8 ). — S. 3292 . doi : 10.1093 / nar/17.8.3292 . — PMID 2726461 .
2. ↑ Itoh S., Harada H., Nakamura Y., White R., Taniguchi T. Tildeling af det humane interferon regulatoriske faktor-1 (IRF1) gen til kromosom 5q23-q31  //  Genomics :  journal. - Academic Press , 1991. - November ( bind 10 , nr. 4 ). - S. 1097-1099 . - doi : 10.1016/0888-7543(91)90208-V . — PMID 1680796 .
3. ↑ Miyamoto M., Fujita T., Kimura Y., Maruyama M., Harada H., Sudo Y., Miyata T., Taniguchi T. Reguleret ekspression af et gen, der koder for en nuklear faktor, IRF-1, der specifikt binder til IFN-beta-genregulerende elementer  (engelsk)  // Celle  : tidsskrift. - Cell Press , 1988. - September ( vol. 54 , nr. 6 ). - S. 903-913 . - doi : 10.1016/S0092-8674(88)91307-4 . — PMID 3409321 .
4. ↑ Escalante CR, Yie J., Thanos D., Aggarwal AK Struktur af IRF-1 med bundet DNA afslører determinanter for interferonregulering  //  Natur: journal. - 1998. - Januar ( bind 391 , nr. 6662 ). - S. 103-106 . - doi : 10.1038/34224 . — PMID 9422515 .
5. ↑ Dornan D., Eckert M., Wallace M., Shimizu H., Ramsay E., Hupp TR, Ball KL Interferon regulatorisk faktor 1-binding til p300 stimulerer DNA-afhængig acetylering af p53   // Mol . celle. Biol. : journal. - 2004. - November ( bind 24 , nr. 22 ). - S. 10083-10098 . - doi : 10.1128/MCB.24.22.10083-10098.2004 . — PMID 15509808 .
6. ↑ Entrez-gen: IRF1 interferon regulatorisk faktor 1 . Arkiveret fra originalen den 8. marts 2010. (ubestemt)
7. ↑ Möller A., ​​Pion E., Narayan V., Ball KL Intracellulær aktivering af interferon regulatorisk faktor-1 af nanobodies til det multifunktionelle (Mf1) domæne  //  J. Biol. Chem.  : journal. - 2010. - December ( bind 285 , nr. 49 ). - P. 38348-38361 . - doi : 10.1074/jbc.M110.149476 . — PMID 20817723 .
8. ↑ Citrobacter -infektionsdata for Irf1 . Velkommen Trust Sanger Institute. Hentet 19. marts 2015. Arkiveret fra originalen 3. april 2015. (ubestemt)
9. ↑ 1 2 3 Gerdin AK The Sanger Mouse Genetics Program: High throughput karakterisering af knockout mus  //  Acta Ophthalmologica : journal. - Wiley-Liss , 2010. - Vol. 88 , nr. S248 . - doi : 10.1111/j.1755-3768.2010.4142.x .
10. ↑ Mouse Resources Portal Arkiveret 24. december 2011 på Wayback Machine , Wellcome Trust Sanger Institute.
11. ↑ International Knockout Mouse Consortium (link ikke tilgængeligt) . Hentet 19. marts 2015. Arkiveret fra originalen 20. marts 2012. (ubestemt) 
12. ↑ Mouse Genome Informatics . Dato for adgang: 19. marts 2015. Arkiveret fra originalen 9. januar 2015. (ubestemt)
13. ↑ Skarnes WC, Rosen B., West AP, Koutsourakis M., Bushell W., Iyer V., Mujica AO, Thomas M., Harrow J., Cox T., Jackson D., Severin J., Biggs P., Fu J., Nefedov M., de Jong PJ, Stewart AF, Bradley A. En betinget knockout-ressource til den genomomfattende undersøgelse af  musegenfunktion //  Nature: journal. - 2011. - Bd. 474 , nr. 7351 . - s. 337-342 . - doi : 10.1038/nature10163 . — PMID 21677750 .
14. ↑ Dolgin E. Mouse bibliotek indstillet til at blive knockout   // Nature . - 2011. - Juni ( bd. 474 , nr. 7351 ). - S. 262-263 . - doi : 10.1038/474262a . — PMID 21677718 .
15. ↑ Collins FS, Rossant J., Wurst W. En mus af alle grunde   // Cell . - Cell Press , 2007. - Januar ( vol. 128 , nr. 1 ). - S. 9-13 . - doi : 10.1016/j.cell.2006.12.018 . — PMID 17218247 .
16. ↑ van der Weyden L., White JK, Adams DJ, Logan DW Musgenetikværktøjssættet: afslørende funktion og mekanisme. (engelsk)  // Genome Biol : journal. - 2011. - Bd. 12 , nr. 6 . — S. 224 . - doi : 10.1186/gb-2011-12-6-224 . — PMID 21722353 .
17. ↑ Narayan V., Pion E., Landré V., Müller P., Ball KL Docking-afhængig ubiquitinering af interferon-regulatorisk faktor-1-tumorsuppressorproteinet af ubiquitin-ligasen CHIP  // J Biol Chem  .  : journal. - 2010. - Oktober ( bd. 286 , nr. 1 ). - S. 607-619 . - doi : 10.1074/jbc.M110.153122 . — PMID 20947504 .
18. ↑ Kular RK, Yehiely F., Kotlo KU, Cilensek ZM, Bedi R., Deiss LP GAGE, et antiapoptotisk protein binder og modulerer ekspressionen af ​​nukleophosmin/B23 og interferon regulatorisk faktor 1  //  J. Interferon Cytokine Res. : journal. - 2009. - Oktober ( bind 29 , nr. 10 ). - S. 645-655 . - doi : 10.1089/jir.2008.0099 . — PMID 19642896 .
19. ↑ Narayan V., Eckert M., Zylicz A., Zylicz M., Ball KL Kooperativ regulering af interferon-regulerende faktor-1-tumorundertrykkende protein ved hjælp af kernekomponenter i det molekylære chaperon-maskineri  // J Biol Chem  .  : journal. - 2009. - September ( bind 284 , nr. 38 ). - P. 25889-25899 . - doi : 10.1074/jbc.M109.019505 . — PMID 19502235 .
20. ↑ Schaper F., Kirchhoff S., Posern G., Köster M., Oumard A., Sharf R., Levi BZ, Hauser H. Functional domains of interferon regulatory factor I (IRF-1  )  // Biochem. J. : journal. - 1998. - Oktober ( bind 335 , nr. 1 ). - S. 147-157 . — PMID 9742224 .
21. ↑ Sharf R., Azriel A., Lejbkowicz F., Winograd SS, Ehrlich R., Levi BZ Funktionel domæneanalyse af interferonkonsensussekvensbindende protein (ICSBP) og dets association med interferonregulatoriske faktorer  //  J. Biol. Chem.  : journal. - 1995. - Juni ( bind 270 , nr. 22 ). - P. 13063-13069 . doi : 10.1074/ jbc.270.22.13063 . — PMID 7768900 .
22. ↑ Umegaki N., Tamai K., Nakano H., Moritsugu R., Yamazaki T., Hanada K., Katayama I., Kaneda Y. Differentiel regulering af karyopherin alfa 2-ekspression af TGF-beta1 og IFN-gamma i normale mennesker epidermale keratinocytter: tydeligt bidrag fra KPNA2 til nuklear translokation af IRF-1  //  J. Invest. Dermatol. : journal. - 2007. - Juni ( bind 127 , nr. 6 ). - S. 1456-1464 . - doi : 10.1038/sj.jid.5700716 . — PMID 17255955 .
23. ↑ Negishi H., Fujita Y., Yanai H., Sakaguchi S., Ouyang X., Shinohara M., Takayanagi H., Ohba Y., Taniguchi T., Honda K. Beviser for licensering af IFN-gamma-induceret IFN regulatorisk faktor 1 transkriptionsfaktor af MyD88 i Toll-lignende receptorafhængigt geninduktionsprogram  (engelsk)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal. - 2006. - Oktober ( bind 103 , nr. 41 ). - P. 15136-15141 . - doi : 10.1073/pnas.0607181103 . — PMID 17018642 .
24. ↑ Masumi A., Wang IM, Lefebvre B., Yang XJ, Nakatani Y., Ozato K. Histonacetylase PCAF er en phorbol-ester-inducerbar coaktivator af IRF-familien, der giver øget interferonrespons  //  Mol celle. Biol. : journal. - 1999. - Marts ( bind 19 , nr. 3 ). - S. 1810-1820 . — PMID 10022868 .
25. ↑ Chatterjee-Kishore M., van Den Akker F., Stark GR Adenovirus E1A nedregulerer LMP2-transkription ved at interferere med bindingen af ​​stat1 til IRF1  //  J. Biol. Chem.  : journal. - 2000. - Juli ( bind 275 , nr. 27 ). - S. 20406-20411 . - doi : 10.1074/jbc.M001861200 . — PMID 10764778 .
26. ↑ Sgarbanti M., Borsetti A., Moscufo N., Bellocchi MC, Ridolfi B., Nappi F., Marsili G., Marziali G., Coccia EM, Ensoli B., Battistini A. Modulation of human immunodeficiency virus 1 repplication by interferon regulatory factors  (engelsk)  // Journal of Experimental Medicine : journal. — Rockefeller University Press, 2002. - Maj ( bd. 195 , nr. 10 ). - S. 1359-1370 . - doi : 10.1084/jem.20010753 . — PMID 12021315 .
27. ↑ Lee JH, Chun T., Park SY, Rho SB Interferon regulatorisk faktor-1 (IRF-1) regulerer VEGF-induceret angiogenese i HUVEC'er   // Biochim . Biofys. Acta : journal. - 2008. - September ( bd. 1783 , nr. 9 ). - S. 1654-1662 . - doi : 10.1016/j.bbamcr.2008.04.006 . — PMID 18472010 .

Litteratur

• Harada H., Taniguchi T., Tanaka N. Interferonregulerende faktorers rolle i interferonsystemet og cellevækstkontrol  (engelsk)  // Biochimie : journal. - 1999. - Bd. 80 , nr. 8-9 . - S. 641-650 . - doi : 10.1016/S0300-9084(99)80017-0 . — PMID 9865486 .
• Pitha PM, Au WC, Lowther W., Juang YT, Schafer SL, Burysek L., Hiscott J., Moore PA Rolle af interferon regulatoriske faktorer (IRF'er) i virus-medieret signalering og regulering af cellevækst  (engelsk)  // Biokemi : journal. - 1999. - Bd. 80 , nr. 8-9 . - s. 651-658 . - doi : 10.1016/S0300-9084(99)80018-2 . — PMID 9865487 .
• Yu-Lee L. Stimulering af interferon regulatorisk faktor-1 af prolactin  (engelsk)  // Lupus : journal. - 2002. - Bd. 10 , nej. 10 . - S. 691-699 . - doi : 10.1191/096120301717164921 . — PMID 11721695 .
• Pine R. IRF og tuberkulose  (neopr.)  // J. Interferon Cytokine Res .. - 2002. - T. 22 , No. 1 . - S. 15-25 . - doi : 10.1089/107999002753452629 . — PMID 11846972 .
• Romeo G., Fiorucci G., Chiantore MV, Percario ZA, Vannucchi S., Affabris E. IRF-1 som en negativ regulator af celleproliferation  (neopr.)  // J. Interferon Cytokine Res.. - 2002. - T. 22 , nr. 1 . - S. 39-47 . - doi : 10.1089/107999002753452647 . — PMID 11846974 .
• Cha Y., Sims SH, Romine MF, Kaufmann M., Deisseroth AB Human interferon regulatorisk faktor 1: intron-exon organisation  (engelsk)  // DNA Cell Biol. : journal. - 1992. - Bd. 11 , nr. 8 . - s. 605-611 . - doi : 10.1089/dna.1992.11.605 . — PMID 1382447 .
• Harada H., Fujita T., Miyamoto M., Kimura Y., Maruyama M., Furia A., Miyata T., Taniguchi T. Strukturelt lignende, men funktionelt forskellige faktorer, IRF-1 og IRF-2, binder til det samme regulatoriske elementer af IFN og IFN-inducerbare gener  (engelsk)  // Cell  : journal. - Cell Press , 1989. - Vol. 58 , nr. 4 . - s. 729-739 . - doi : 10.1016/0092-8674(89)90107-4 . — PMID 2475256 .
• Miyamoto M., Fujita T., Kimura Y., Maruyama M., Harada H., Sudo Y., Miyata T., Taniguchi T. Reguleret ekspression af et gen, der koder for en nuklear faktor, IRF-1, der specifikt binder til IFN -beta-gen regulatoriske elementer  (engelsk)  // Cell  : journal. - Cell Press , 1988. - Vol. 54 , nr. 6 . - S. 903-913 . - doi : 10.1016/S0092-8674(88)91307-4 . — PMID 3409321 .
• Harada H., Takahashi E., Itoh S., Harada K., Hori TA, Taniguchi T. Struktur og regulering af de humane interferon regulatoriske faktor 1 (IRF-1) og IRF-2 gener: implikationer for et gennetværk i interferonsystem  (engelsk)  // Mol. celle. Biol. : journal. - 1994. - Bd. 14 , nr. 2 . - S. 1500-1509 . — PMID 7507207 .
• Sharf R., Azriel A., Lejbkowicz F., Winograd SS, Ehrlich R., Levi BZ Funktionel domæneanalyse af interferonkonsensussekvensbindende protein (ICSBP) og dets association med interferonregulatoriske faktorer  (engelsk)  // J. Biol. Chem.  : journal. - 1995. - Bd. 270 , nr. 22 . - P. 13063-13069 . doi : 10.1074/ jbc.270.22.13063 . — PMID 7768900 .
• Willman CL, Sever CE, Pallavicini MG, Harada H., Tanaka N., Slovakisk ML, Yamamoto H., Harada K., Meeker TC, List AF Deletion af IRF-1, kortlægning til kromosom 5q31.1, i human leukæmi og præleukæmisk myelodysplasi  (engelsk)  // Science : journal. - 1993. - Bd. 259 , nr. 5097 . - P. 968-971 . - doi : 10.1126/science.8438156 . — PMID 8438156 .
• Drew PD, Franzoso G., Becker KG, Bours V., Carlson LM, Siebenlist U., Ozato K. NF kappa B og interferon regulatorisk faktor 1 interagerer fysisk og inducerer synergistisk større histokompatibilitet klasse I genekspression  //  J Interferon Cytokine Res. : journal. - 1997. - Bd. 15 , nr. 12 . - S. 1037-1045 . - doi : 10.1089/jir.1995.15.1037 . — PMID 8746784 .
• Ronco LV, Karpova AY, Vidal M., Howley PM Humant papillomavirus 16 E6 oncoprotein binder til interferon regulatorisk faktor-3 og hæmmer dets transkriptionelle aktivitet  // Genes Dev  .  : journal. - 1998. - Bd. 12 , nr. 13 . - S. 2061-2072 . - doi : 10.1101/gad.12.13.2061 . — PMID 9649509 .
• Nozawa H., Oda E., Ueda S., Tamura G., Maesawa C., Muto T., Taniguchi T., Tanaka N. Funktionelt inaktiverende punktmutation i tumor-suppressor IRF-1-genet identificeret i human gastrisk cancer  ( engelsk)  // Int. J. Cancer : journal. - 1998. - Bd. 77 , nr. 4 . - S. 522-527 . - doi : 10.1002/(SICI)1097-0215(19980812)77:4<522::AID-IJC8>3.0.CO;2-W . — PMID 9679752 .
• Schaper F., Kirchhoff S., Posern G., Köster M., Oumard A., Sharf R., Levi BZ, Hauser H. Funktionelle domæner af interferon regulatorisk faktor I (IRF-1)  (engelsk)  // Biochem. J. : journal. - 1998. - Bd. 335 , nr. 1 . - S. 147-157 . — PMID 9742224 .
• Masumi A., Wang IM, Lefebvre B., Yang XJ, Nakatani Y., Ozato K. Histonacetylase PCAF er en phorbol-ester-inducerbar coactivator af IRF-familien, der giver øget interferon-responsivitet  (engelsk)  // Mol. celle. Biol. : journal. - 1999. - Bd. 19 , nr. 3 . - S. 1810-1820 . — PMID 10022868 .