IRF4

♣

Interferon regulatorisk faktor 4

PDB i kombination med 2dll.

Tilgængelige strukturer

Ortholog søgning: PDBe , RCSB

Liste over PDB-id'er
2DLL

Identifikatorer

Symbol

IRF4 ; LSIRF; MUM1; NF-EM5

Eksterne ID'er

OMIM: 601900 MGI : 1096873 HomoloGene : 1842 GeneCards : IRF4 Gen

Gen-ontologi
Fungere	• regulatorisk region DNA-binding • sekvensspecifik DNA-bindende transkriptionsfaktoraktivitet • proteinbinding • transkriptionsfaktorbinding • protein-lysin N-methyltransferaseaktivitet • sekvensspecifik DNA-binding
celle komponent	• nuklear nukleosom • kerne • cytosol • membran
biologisk proces	• transkription, DNA-templeret • peptidyl-lysin-methylering • cytokin-medieret signalvej • negativ regulering af toll-lignende receptor signalvej • T-celleaktivering • forsvarsrespons på protozoer • myeloid dendritisk celledifferentiering • positiv regulering af DNA-binding • histon H3 acetylering • histon H4 acetylering • positiv regulering af interleukin-10 biosyntetisk proces • positiv regulering af interleukin-2 biosyntetisk proces • positiv regulering af interleukin-13 biosyntetisk proces • positiv regulering af interleukin-4 biosyntetisk proces • regulering af T-hjælper celledifferentiering • positiv regulering af transkription, DNA -templeret • positiv regulering af transkription fra RNA-polymerase II-promotor • interferon-gamma-medieret signalvej • type I interferon signalvej • T-hjælper 17 celle-forpligtelse
Kilder: Amigo / QuickGO

RNA-ekspressionsprofil

Mere information

ortologer

Udsigt

Human

Mus

Entrez

RefSeq (mRNA)

RefSeq (protein)

Locus (UCSC)

Chr 6:
0,39 – 0,41 Mb

Chr 13:
30,75 – 30,77 Mb

Søg i PubMed

[en]

[2]

Interferon regulatorisk faktor 4 , også kendt som MUM1 , er et protein , som hos mennesker er kodet af IRF4 -genet , [1] [2] [3] placeret ved 6p25-p23.

Symbolet MUM1 har flere værdier ; det er ældre end synonymet for IRF4 (HGNC: 6119), desuden er det nuværende officielle HGNC-symbol for melanom forbundet med (muteret) antigen 1 (HGNC: 29641; placeret på 19p13.3).

Klinisk betydning

I pigmentceller kan IRF4 -genet reguleres af MITF . [4] IRF4 er en transkriptionsfaktor, der er impliceret i akut leukæmi . [5] Dette gen er stærkt forbundet med forskellige pigmenteringsmønstre såsom solfølsomhed, fregner, blå øjne og brunt hår. [6]

Interaktioner

IRF4 har vist sig at interagere med:

BCL6 , [7]
NFATC2 , [8]
SPI1 , [9] [10] og
STAT6 . [7]

Se også

Interferon
IRF1 , IRF2 , IRF3 , IRF5 , IRF6 , IRF7 , IRF8 og IRF9

Noter

↑ Grossman A., Mittrücker HW, Nicholl J., Suzuki A., Chung S., Antonio L., Suggs S., Sutherland GR, Siderovski DP, Mak TW Kloning af human lymfocytspecifik interferon regulatorisk faktor (hLSIRF/hIRF4) og kortlægning af genet til 6p23-p25 // Genomics : journal. - Academic Press , 1997. - Februar ( vol. 37 , nr. 2 ). - S. 229-233 . - doi : 10.1006/geno.1996.0547 . — PMID 8921401 .
↑ Xu D., Zhao L., Del Valle L., Miklossy J., Zhang L. Interferon regulatorisk faktor 4 er involveret i Epstein-Barr virus-medieret transformation af humane B-lymfocytter // J Virol : journal. - 2008. - Juni ( bind 82 , nr. 13 ). - P. 6251-6258 . - doi : 10.1128/JVI.00163-08 . — PMID 18417578 .
↑ Entrez Gene: IRF4 interferon regulatorisk faktor 4 . (ubestemt)
↑ Hoek KS, Schlegel NC, Eichhoff OM, Widmer DS, Praetorius C., Einarsson SO, Valgeirsdottir S., Bergsteinsdottir K., Schepsky A., Dummer R., Steingrimsson E. Novel MITF-mål identificeret ved hjælp af en to-trins DNA-mikroarray strategi // Pigment Cell Melanoma Res . : journal. - 2008. - Bd. 21 , nr. 6 . - s. 665-676 . - doi : 10.1111/j.1755-148X.2008.00505.x . — PMID 19067971 .
↑ Adamaki M., Lambrou GI, Athanasiadou A., Tzanoudaki M., Vlahopoulos S., Moschovi M. Implikation af IRF4 afvigende genekspression i de akutte leukæmier i barndommen (engelsk) // PLOS One : journal. - 2013. - Bd. 8 , nr. 8 . — P.e72326 . - doi : 10.1371/journal.pone.0072326 . — PMID 23977280 .
↑ Praetorius C., Grill C., Stacey SN, Metcalf AM, Gorkin DU, Robinson KC, Van Otterloo E., Kim RS, Bergsteinsdottir K., Ogmundsdottir MH, Magnusdottir E., Mishra PJ, Davis SR, Guo T., Zaidi MR, Helgason AS, Sigurdsson MI, Meltzer PS, Merlino G., Petit V., Larue L., Loftus SK, Adams DR, Sobhiafshar U., Emre NC, Pavan WJ, Cornell R., Smith AG, McCallion AS, Fisher DE, Stefansson K., Sturm RA, Steingrimsson E. A Polymorphism in IRF4 Affects Human Pigmentation through a Tyrosinase-Dependent MITF/TFAP2A Pathway (engelsk) // Cell : journal. - Cell Press , 2013. - November ( vol. 155 , nr. 5 ). - S. 1022-1033 . - doi : 10.1016/j.cell.2013.10.022 . — PMID 24267888 .
↑ 1 2 Gupta S., Jiang M., Anthony A., Pernis AB Lineage-specifik modulering af interleukin 4-signalering ved interferon regulatorisk faktor 4 // Journal of Experimental Medicine : journal. — Rockefeller University Press, 1999. - December ( bd. 190 , nr. 12 ). - S. 1837-1848 . - doi : 10.1084/jem.190.12.1837 . — PMID 10601358 .
↑ Rengarajan J., Mowen KA, McBride KD, Smith ED, Singh H., Glimcher LH Interferon regulatorisk faktor 4 (IRF4) interagerer med NFATc2 for at modulere interleukin 4-genekspression // Journal of Experimental Medicine : journal. — Rockefeller University Press, 2002. - April ( bd. 195 , nr. 8 ). - S. 1003-1012 . - doi : 10.1084/jem.20011128 . — PMID 11956291 .
↑ Messing AL, Zhu AQ, Singh H. Samlingskrav for PU.1-Pip (IRF-4) aktivatorkomplekser: hæmmende funktion in vivo ved hjælp af fusionerede dimerer // EMBO J. : journal. - 1999. - Februar ( bind 18 , nr. 4 ). - S. 977-991 . doi : 10.1093 / emboj/18.4.977 . — PMID 10022840 .
↑ Escalante CR, Shen L., Escalante MC, Brass AL, Edwards TA, Singh H., Aggarwal AK Krystallisation og karakterisering af PU.1/IRF-4/DNA ternært kompleks // J. Struct. Biol. : journal. - 2002. - Juli ( bd. 139 , nr. 1 ). - S. 55-9 . - doi : 10.1016/S1047-8477(02)00514-2 . — PMID 12372320 .

Litteratur

Mamane Y., Sharma S., Grandvaux N., Hernandez E., Hiscott J. IRF-4-aktiviteter i HTLV-I-induceret T-celle leukomogenese // J. Interferon Cytokine Res. : journal. - 2002. - Bd. 22 , nr. 1 . - S. 135-143 . - doi : 10.1089/107999002753452746 . — PMID 11846984 .
Yamagata T., Nishida J., Tanaka S., Sakai R., Mitani K., Yoshida M., Taniguchi T., Yazaki Y., Hirai H. En ny interferon regulatorisk faktor familie transkriptionsfaktor, ICSAT/Pip/LSIRF, der negativt regulerer aktiviteten af interferon-regulerede gener (engelsk) // Mol. celle. Biol. : journal. - 1996. - Bd. 16 , nr. 4 . - S. 1283-1294 . — PMID 8657101 .
Iida S., Rao PH, Butler M., Corradini P., Boccadoro M., Klein B., Chaganti RS, Dalla-Favera R. Deregulering af MUM1/IRF4 ved kromosomal translokation i myelomatose (engelsk) // Nat. Genet. : journal. - 1997. - Bd. 17 , nr. 2 . - S. 226-230 . - doi : 10.1038/ng1097-226 . — PMID 9326949 .
Brass AL, Zhu AQ, Singh H. Monteringskrav for PU.1-Pip (IRF-4) aktivatorkomplekser: hæmmende funktion in vivo ved hjælp af fusionerede dimerer // EMBO J. : journal. - 1999. - Bd. 18 , nr. 4 . - S. 977-991 . doi : 10.1093 / emboj/18.4.977 . — PMID 10022840 .
Rao S., Matsumura A., Yoon J., Simon MC SPI-B aktiverer transkription via et unikt prolin-, serin- og threonin-domæne og udviser DNA-bindingsaffinitetsforskelle fra PU.1 // J. Biol. Chem. : journal. - 1999. - Bd. 274 , nr. 16 . - S. 11115-11124 . doi : 10.1074 / jbc.274.16.11115 . — PMID 10196196 .
Marecki S., Atchison ML, Fenton MJ Differentiel ekspression og distinkte funktioner af IFN-regulatorisk faktor 4 og IFN-konsensussekvensbindende protein i makrofager (engelsk) // J. Immunol. : journal. - 1999. - Bd. 163 , nr. 5 . - P. 2713-2722 . — PMID 10453013 .
Gupta S., Jiang M., Anthony A., Pernis AB Lineage-specifik modulering af interleukin 4-signalering ved interferon regulatorisk faktor 4 // Journal of Experimental Medicine : journal. — Rockefeller University Press, 2000. - Vol. 190 , nr. 12 . - S. 1837-1848 . - doi : 10.1084/jem.190.12.1837 . — PMID 10601358 .
Mamane Y., Sharma S., Petropoulos L., Lin R., Hiscott J. Posttranslationel regulering af IRF-4-aktivitet af immunofilinet FKBP52 // Immunitet: tidsskrift. - Cell Press , 2000. - Vol. 12 , nr. 2 . - S. 129-140 . - doi : 10.1016/S1074-7613(00)80166-1 . — PMID 10714679 .
Gupta S., Anthony A., Pernis AB Stadiespecifik modulering af IFN-regulatorisk faktor 4-funktion af Krüppel-type zinkfingerproteiner (engelsk) // J. Immunol. : journal. - 2001. - Bd. 166 , nr. 10 . - P. 6104-6111 . - doi : 10.4049/jimmunol.166.10.6104 . — PMID 11342629 .
Imaizumi Y., Kohno T., Yamada Y., Ikeda S., Tanaka Y., Tomonaga M., Matsuyama T. Mulig involvering af interferon regulatorisk faktor 4 ( IRF4) i en klinisk undertype af voksen T-celle leukæmi // Jpn. J. Cancer Res. : journal. - 2002. - Bd. 92 , nr. 12 . - S. 1284-1292 . - doi : 10.1111/j.1349-7006.2001.tb02151.x . — PMID 11749693 .
Rengarajan J., Mowen KA, McBride KD, Smith ED, Singh H., Glimcher LH Interferon regulatorisk faktor 4 (IRF4) interagerer med NFATc2 for at modulere interleukin 4-ekspression (engelsk) // Journal of Experimental Medicine : journal. — Rockefeller University Press, 2002. - Vol. 195 , nr. 8 . - S. 1003-1012 . - doi : 10.1084/jem.20011128 . — PMID 11956291 .
Sharma S., Grandvaux N., Mamane Y., Genin P., Azimi N., Waldmann T., Hiscott J. Regulering af IFN-regulatorisk faktor 4-ekspression i humane T-celleleukæmivirus-I-transformerede T-celler // J. Immunol. : journal. - 2002. - Bd. 169 , nr. 6 . - S. 3120-3130 . - doi : 10.4049/jimmunol.169.6.3120 . — PMID 12218129 .
Escalante CR, Shen L., Escalante MC, Brass AL, Edwards TA, Singh H., Aggarwal AK Krystallisering og karakterisering af PU.1/IRF-4/DNA ternært kompleks (engelsk) // J. Struct. Biol. : journal. - 2003. - Bd. 139 , nr. 1 . - S. 55-9 . - doi : 10.1016/S1047-8477(02)00514-2 . — PMID 12372320 .
Hu CM, Jang SY, Fanzo JC, Pernis AB Modulering af T-celle cytokinproduktion ved interferon regulatorisk faktor-4 // J. Biol. Chem. : journal. - 2003. - Bd. 277 , nr. 51 . - P. 49238-49246 . - doi : 10.1074/jbc.M205895200 . — PMID 12374808 .
Fanzo JC, Hu CM, Jang SY, Pernis AB Regulering af lymfocytapoptose ved interferon regulatorisk faktor 4 (IRF-4 ) // Journal of Experimental Medicine : journal. — Rockefeller University Press, 2003. - Vol. 197 , nr. 3 . - S. 303-314 . - doi : 10.1084/jem.20020717 . — PMID 12566414 .
O'Reilly D., Quinn CM, El-Shanawany T., Gordon S., Greaves DR Multiple Ets-faktorer og interferon regulatorisk faktor-4 modulerer CD68-ekspression på en celletypespecifik måde // J. Biol. Chem. : journal. - 2003. - Bd. 278 , nr. 24 . - S. 21909-21919 . - doi : 10.1074/jbc.M212150200 . — PMID 12676954 .
Sundram U., Harvell JD, Rouse RV, Natkunam Y. Ekspression af B-celleproliferationsmarkøren MUM1 ved melanocytiske læsioner og sammenligning med S100, gp100 (HMB45) og MelanA (engelsk) // Mod. Pathol. : journal. - 2004. - Bd. 16 , nr. 8 . - S. 802-810 . - doi : 10.1097/01.MP.0000081726.49886.CF . — PMID 12920225 .