CF-koden ("klassificering af enzymer") eller enzymkoden er enzymets klassifikationsnummer i henhold til den internationale hierarkiske klassifikation. Det vedtagne system klassificerer enzymer i grupper og indekserer individuelle enzymer, hvilket er vigtigt for forskningsstandardisering.
Klassificeringen af enzymer er baseret og ajourføres med jævne mellemrum af Enzyme Commission ( eng. Enzyme commission , deraf udtrykket "EC number", der er vedtaget i den engelske litteratur) hos International Union of Biochemistry and Molecular Biology . Hver CF-kode er også forbundet med det anbefalede navn på det tilsvarende enzym. Mere end 3500 enzymer er blevet klassificeret.
Klassificeringen af enzymer tager hensyn til enzymers reaktion og substratspecificitet og ikke deres proteinstruktur . CF-koden definerer den kemiske reaktion, der katalyseres af enzymet. Af denne grund har lignende enzymer (nogle gange snesevis) fra forskellige organismer den samme CF, på trods af strukturelle forskelle.
Nogle gange har forskellige enzymer af den samme organisme den samme CF. For eksempel tilhører bugspytkirtellipase og hepatisk lipase begge EC 3.1.1.3 , da de katalyserer den samme kemiske reaktion ( hydrolyse af en esterbinding i triglycerid ), selvom det første enzym er et fordøjelsesenzym og virker i tarmen , og det andet enzym. refererer til lipoprotein metabolisme enzymer i blodet .
Der er en UniProt - database [1] , der identificerer hvert protein ved dets primære sekvens. Begge databaser supplerer hinanden.
Hvert klassifikationsnummer indeholder forkortelsen KF og en rækkefølge på fire tal adskilt af prikker, og er sammensat efter et bestemt princip. Hvert successivt tal repræsenterer en mere og mere præcis klassificering af enzymet. Da databasen konstant opdateres, kan koderne ændre sig, og koderne på nogle niveauer kan forblive tomme.
Endelig modtager alle enzymer, der tilhører denne underunderklasse, deres serienummer ( det fjerde nummer i koden).
| Klasse | katalyseret reaktion | Reaktionstype | Eksempler |
|---|---|---|---|
| CF 1 Oxidoreduktase |
Redoxreaktioner. Overførsel af H- og O-atomer eller elektroner fra et substrat til et andet | AH + B → A + BH ( reduktion ) A + O → AO ( oxidation ) |
dehydrogenase , oxidase |
| CF 2 transferaser |
Overførsel af en funktionel gruppe fra et substrat til et andet. Det kan være en methyl-, acyl-, phosphat- eller aminogruppe. | AB+C→A+BC | aminotransferase , kinaser |
| KF 3 hydrolaser |
Dannelse af to produkter fra et substrat ved hydrolyse . | AB + H2O → AOH + BH | lipase , amylase , protease , phosphatase |
| KF 4 Lyaser (syntaser) |
Den ikke-hydrolytiske tilføjelse eller fjernelse af en gruppe til eller fra et substrat. Dannelse af CC-, CN-, CO- eller CS-bindinger. | RCOCOOH → RCOH + CO2 | carboxylase |
| KF 5 isomeraser |
Intramolekylær omlejring, dvs. isomerisering af substratmolekylet. | AB→BA | isomeraser , mutaser osv. |
| CF 6 Ligaser (syntetaser) |
Forbindelsen af to molekyler som et resultat af syntesen af en ny CO-, CS-, CN- eller CC -binding , koblet med den samtidige hydrolyse af ATP . | X + Y + ATP → XY + ADP + Pi | syntetase |
| KF 7 | Transporten af ioner eller molekyler over membraner eller deres adskillelse i membraner. | membrantransportproteiner [2] |
Enzyme Nomenclature Scheme blev først udviklet i 1955 , da den internationale kongres for biokemi i Bruxelles etablerede enzymkommissionen . Den første version af nomenklaturen dukkede op i 1961 og omfattede omkring 900 enzymer, i 1978-versionen var der mere end 2000 enzymer. 1995- versionen indeholder over 3500 enzymer.
| Enzymer | |
|---|---|
| Aktivitet | |
| Regulering | |
| Klassifikation | |
| Typer |
|