Human Proteome Project

Human Proteome Project ( HPP ) er et internationalt projekt, der skal skabe et proteomkort, der omfatter alle proteiner kodet af det menneskelige genom . Projektets primære opgave er udarbejdelse af proteomiske kort over hovedproteinerne i blodplasma , lever , hjerne [1] .

Historie

Det internationale projekt "Human Proteome" startede i september 2010 i Sydney og blev en fortsættelse af projektet "Human Genome" [2] . Deltagerne i Human Proteome-projektet omfatter seks initierende lande: Republikken Korea , USA , Den Russiske Føderation , Sverige , Canada og Iran ). Med hensyn til omfanget af det stillede problem og den anslåede arbejdsintensitet af arbejdet viste Human Proteome-projektet sig at være meget større end Human Genome-projektet. Mens det menneskelige genom består af omkring 20 tusind gener, overstiger antallet af proteiner i den menneskelige krop på grund af tilstedeværelsen af ​​forskellige proteinproteoformer 2 millioner [3] . Derudover, i modsætning til genomet, ændrer proteomet sig konstant afhængigt af indflydelsen fra intracellulære og eksterne faktorer, og er faktisk et sæt proteiner, der er fastsat i tid i et bestemt biologisk objekt og i en bestemt situation.

Metoder

Blandt metoderne til at studere proteomet, der er accepteret af det internationale samfund, er en af ​​de mest succesrige udviklingsmetoder blevet en kromosom- eller gencentreret tilgang, hvor resultaterne af proteinanalyse kortlægges til deres tilsvarende proteinkodende gener . Formalisering af den videnskabelige opgave på grund af den gen-centrerede tilgang gør implementeringen meget mere realistisk sammenlignet med alternative tilgange (total proteintyping), hvilket giver dig mulighed for at fokusere på proteiner kodet af generne fra et bestemt kromosom og derved opdele projektet i separate delprojekter - i henhold til antallet af kromosompar i genomet mennesket [4] .

Se også

Noter

  1. ↑ Dedov, I. I., Tyulpakov, A. N., Chekhonin, V. P., Baklaushev, V. P., Archakov, A. I., & Moshkovsky, S. A. Personlig medicin: nuværende tilstand og fremtidsudsigter // Bulletin of the Russian Academy of Medical Sciences. - 2012. - T. 67 , nr. 12 . - S. 4-12 . — ISSN 0869-6047 . - doi : 10.15690/vramn.v67i12.474 .
  2. ↑ Legrain P., Aebersold R., Archakov A., Bairoch A., Bala K., Beretta L., Bergeron J., Borchers CH, Corthals GL, Costello CE et al. Det menneskelige proteomprojekt: nuværende tilstand og fremtidig retning // Molekylær & cellulær proteomik. - 2011. - T. 10 , nr. 7 . - S. M111. 009993 . - doi : 10.1074/mcp.M111.009993 .
  3. ↑ Archakov A., Zgoda V., Kopylov A., Naryzhny S., Chernobrovkin A., Ponomarenko E., Lisitsa A. Kromosomcentreret tilgang til at overvinde flaskehalse i Human Proteome Project // Ekspertgennemgang af proteomics. - 2012. - T. 9 , nr. 6 . - S. 667-676 . - doi : 10.1021/pr300821n .
  4. ↑ Ponomarenko, E. A., Zgoda, V. G., Kopylov, A. T., Attorney, E. V., Igisonis, E. V., Lisitsa, A. V., & Archakov, A. I. Rusland i det internationale projekt "human proteome": første resultater og udsigter // Biomedicinsk kemi. - 2015. - T. 61 , nr. 2 . - S. 169-175 . - doi : 10.18097/PBMC20156102169 .

Litteratur