Histon deacetylase 7

Tilgængelige strukturer

Ortholog søgning: PDBe RCSB

Liste over PDB-id'er
3C0Y , 3C0Z , 3C10 , 3ZNR , 3ZNS

Identifikatorer

Symboler

HDAC7 , HD7A, HDAC7A, HD7, histon deacetylase 7

Eksterne ID'er

OMIM: 606542 MGI: 1891835 HomoloGene: 9124 GeneCards: 51564

Beslægtede arvelige sygdomme

Sygdommens navn

Links

fedme


[en]

Gen-ontologi
Funktioner	• metalionbinding • GO:0001106 transkriptionscorepressoraktivitet • proteinkinasebinding • 14-3-3 proteinbinding • hydrolaseaktivitet • proteinkinase C-binding • kromatinbinding • histon-deacetylaseaktivitet • NAD-afhængig histon-deacetylase-aktivitet (H3-K14-specifik ) • GO:0001948, GO:0016582 plasmaproteinbinding • SUMO-transferaseaktivitet
celle komponent	• nukleoplasma • cytoplasma • cellekerne • histon-deacetylasekompleks • cytosol
biologisk proces	• transkription, DNA-afhængig • negativ regulering af NIK/NF-kappaB signalering • positiv regulering af cellemigration involveret i spirende angiogenese • celle-celle forbindelsessamling • vaskulogenese • GO:1901227 negativ regulering af transkription ved RNA polymerase II • histon H3 deacetylering • negativ regulering af osteoblastdifferentiering • negativ regulering af interleukin-2-produktion • GO:0009373 DNA-afhængig regulering af transkription • histondeacetylering • GO:0045996 negativ regulering af transkription, DNA- templeret • GO:0031497, GO:0006336, GO:0006336, GO:0006336, GO:0045996 0034724 , GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 kromatinorganisation • proteinsumoylering
Kilder: Amigo / QuickGO

RNA-ekspressionsprofil

Mere information

ortologer

Slags

Human

Mus

Entrez


51564


56233

Ensemble


ENSG00000061273


ENSMUSG00000022475

UniProt


Q8WUI4


Q8C2B3

RefSeq (mRNA)


NM_001098416 NM_001308090 NM_015401 NM_016596 NM_001368046

NM_001204275 NM_001204276 NM_001204277 NM_001204278 NM_001204279
NM_001204280 NM_001204281 NM_019572 NM_001378971

RefSeq (protein)


NP_001091886 NP_001295019 NP_056216 NP_001354975

NP_001191204 NP_001191205 NP_001191206 NP_001191207 NP_001191208
NP_001191209 NP_001191210 NP_062518 NP_001365900

Locus (UCSC)

Chr 12: 47,78 – 47,83 Mb

Chr 15: 97,69 – 97,74 Mb

PubMed- søgning

[2]

[3]

Rediger (menneske)

Rediger (mus)

Histon deacetylase 7 ( Histone deacetylase 7 ) er et enzym kodet i mennesker af HDAC7 genet [1] [2] [3] .

Funktion

Histoner spiller en afgørende rolle i reguleringen af transkription , cellecyklus og udviklingsprocesser. Acetylering/deacetylering af histoner ændrer kromosomernes struktur og påvirker transkriptionsfaktorers adgang til DNA . Proteinet kodet af dette gen deler sekvenshomologi med medlemmer af histon-deacetylase-familien. Dette gen er ortologt til muse HDAC7-genet, et protein, der stimulerer undertrykkelsen af medieringen af den transkriptionelle corepressor SMRT. Adskillige alternative splejsningsvarianter , der koder for flere isoformer , er blevet fundet for dette gen [3] .

Interaktioner

HDAC7A har vist sig at interagere med:

BCL6 [4] ,
Endotelin type A-receptor [5] ,
HDAC3 [6] ,
HTATIP [7] ,
IKZF1 [8] og
NCOR1 [6] .

Se også

Histon deacetylaser

Noter

↑ Marks PA, Richon VM, Rifkind RA Histon-deacetylaseinhibitorer: inducere af differentiering eller apoptose af transformerede celler // Journal of the National Cancer Institute : journal. - 2000. - August ( bind 92 , nr. 15 ). - S. 1210-1216 . doi : 10.1093 / jnci/92.15.1210 . — PMID 10922406 .
↑ Kao HY, Downes M., Ordentlich P., Evans RM Isolering af en ny histon-deacetylase afslører, at klasse I- og klasse II-deacetylaser fremmer SMRT-medieret undertrykkelse // Genes & Development : journal . - 2000. - Januar ( bind 14 , nr. 1 ). - S. 55-66 . - doi : 10.1101/gad.14.1.55 . — PMID 10640276 .
↑ 1 2 Entrez-gen: HDAC7A-histondeacetylase 7A . (ubestemt)
↑ Lemercier C., Brocard MP, Puvion-Dutilleul F., Kao HY, Albagli O., Khochbin S. Klasse II histondeacetylaser rekrutteres direkte af BCL6 transkriptionel repressor // The Journal of Biological Chemistry : journal. - 2002. - Juni ( bind 277 , nr. 24 ). - P. 22045-22052 . - doi : 10.1074/jbc.M201736200 . — PMID 11929873 .
↑ Lee HJ, Chun M., Kandror KV Tip60 og HDAC7 interagerer med endotelinreceptoren a og kan være involveret i downstream-signalering // The Journal of Biological Chemistry : journal. - 2001. - Maj ( bind 276 , nr. 20 ). - P. 16597-16600 . - doi : 10.1074/jbc.C000909200 . — PMID 11262386 .
↑ 1 2 Fischle W., Dequiedt F., Fillion M., Hendzel MJ, Voelter W., Verdin E. Human HDAC7-histondeacetylaseaktivitet er forbundet med HDAC3 in vivo // The Journal of Biological Chemistry : journal. - 2001. - September ( bind 276 , nr. 38 ). - P. 35826-35835 . - doi : 10.1074/jbc.M104935200 . — PMID 11466315 .
↑ Xiao H., Chung J., Kao HY, Yang YC Tip60 er en co-repressor for STAT3 // The Journal of Biological Chemistry : tidsskrift. - 2003. - Marts ( bd. 278 , nr. 13 ). - P. 11197-11204 . - doi : 10.1074/jbc.M210816200 . — PMID 12551922 .
↑ Koipally J., Georgopoulos K. En molekylær dissektion af Ikaros undertrykkelseskredsløb // The Journal of Biological Chemistry : tidsskrift. - 2002. - August ( bind 277 , nr. 31 ). - P. 27697-27705 . - doi : 10.1074/jbc.M201694200 . — PMID 12015313 .

Litteratur

Verdin E., Dequiedt F., Kasler HG Klasse II histon-deacetylaser: alsidige regulatorer // Trends in Genetics : journal. - Cell Press , 2003. - Maj ( vol. 19 , nr. 5 ). - S. 286-293 . - doi : 10.1016/S0168-9525(03)00073-8 . — PMID 12711221 .
Maruyama K., Sugano S. Oligo-capping: en simpel metode til at erstatte cap-strukturen af eukaryote mRNA'er med oligoribonukleotider (engelsk) // Gene : journal. - Elsevier , 1994. - Januar ( bind 138 , nr. 1-2 ). - S. 171-174 . - doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . — PMID 8125298 .
Suzuki Y., Yoshitomo-Nakagawa K., Maruyama K., Suyama A., Sugano S. Konstruktion og karakterisering af et fuldlængde beriget og et 5'-ende beriget cDNA bibliotek // Gene : journal. - Elsevier , 1997. - Oktober ( bd. 200 , nr. 1-2 ). - S. 149-156 . - doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . — PMID 9373149 .
Lee HJ, Chun M., Kandror KV Tip60 og HDAC7 interagerer med endotelinreceptoren a og kan være involveret i downstream-signalering // The Journal of Biological Chemistry : tidsskrift. - 2001. - Maj ( bind 276 , nr. 20 ). - P. 16597-16600 . - doi : 10.1074/jbc.C000909200 . — PMID 11262386 .
Fischle W., Dequiedt F., Fillion M., Hendzel MJ, Voelter W., Verdin E. Human HDAC7-histondeacetylaseaktivitet er forbundet med HDAC3 in vivo // The Journal of Biological Chemistry : journal. - 2001. - September ( bind 276 , nr. 38 ). - P. 35826-35835 . - doi : 10.1074/jbc.M104935200 . — PMID 11466315 .
Lemercier C., Brocard MP, Puvion-Dutilleul F., Kao HY, Albagli O., Khochbin S. Klasse II histondeacetylaser rekrutteres direkte af BCL6 transkriptionel repressor // The Journal of Biological Chemistry : journal. - 2002. - Juni ( bind 277 , nr. 24 ). - P. 22045-22052 . - doi : 10.1074/jbc.M201736200 . — PMID 11929873 .
Bryant H., Farrell PJ Signaltransduktion og transkriptionsfaktorændring under reaktivering af Epstein-Barr-virus fra latens // Journal of Virology : journal. - 2002. - Oktober ( bind 76 , nr. 20 ). - S. 10290-10298 . doi : 10.1128/ JVI.76.20.10290-10298.2002 . — PMID 12239305 .
Xiao H., Chung J., Kao HY, Yang YC Tip60 er en co-repressor for STAT3 // The Journal of Biological Chemistry : tidsskrift. - 2003. - Marts ( bd. 278 , nr. 13 ). - P. 11197-11204 . - doi : 10.1074/jbc.M210816200 . — PMID 12551922 .
Dequiedt F., Kasler H., Fischle W., Kiermer V., Weinstein M., Herndier BG, Verdin E. HDAC7, en thymus-specifik klasse II-histondeacetylase , regulerer Nur77-transkription og TCR-medieret apoptose / Immunitet: journal. - Cell Press , 2003. - Maj ( vol. 18 , nr. 5 ). - s. 687-698 . - doi : 10.1016/S1074-7613(03)00109-2 . — PMID 12753745 .
Lee CH, Chawla A., Urbiztondo N., Liao D., Boisvert WA, Evans RM, Curtiss LK Transkriptionel undertrykkelse af atherogen inflammation: modulering af PPARdelta // Science: journal. - 2003. - Oktober ( bd. 302 , nr. 5644 ). - S. 453-457 . - doi : 10.1126/science.1087344 . — PMID 12970571 .
Li X., Song S., Liu Y., Ko SH, Kao HY Fosforylering af histondeacetylase 7 modulerer dens stabilitet og association med 14-3-3 proteiner // The Journal of Biological Chemistry : tidsskrift. - 2004. - August ( bd. 279 , nr. 33 ). - P. 34201-34208 . - doi : 10.1074/jbc.M405179200 . — PMID 15166223 .
Kato H., Tamamizu-Kato S., Shibasaki F. Histondeacetylase 7 associerer med hypoxi-inducerbar faktor 1alpha og øger transkriptionel aktivitet // The Journal of Biological Chemistry : tidsskrift. - 2004. - Oktober ( bind 279 , nr. 40 ). - P. 41966-41974 . - doi : 10.1074/jbc.M406320200 . — PMID 15280364 .
Beausoleil SA, Jedrychowski M., Schwartz D., Elias JE, Villén J., Li J., Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP Storskala karakterisering af HeLa celle nukleare phosphoproteiner // Proceedings of the National Academy of Sciences of the Amerikas Forenede Stater : tidsskrift. - 2004. - August ( bind 101 , nr. 33 ). - S. 12130-12135 . - doi : 10.1073/pnas.0404720101 . — PMID 15302935 .
Jin J., Smith FD, Stark C., Wells CD, Fawcett JP, Kulkarni S., Metalnikov P., O'Donnell P., Taylor P., Taylor L., Zougman A., Woodgett JR, Langeberg LK, Scott JD, Pawson T. Proteomisk, funktionel og domænebaseret analyse af in vivo 14-3-3-bindende proteiner involveret i cytoskeletregulering og cellulær organisation // Current Biology : journal . - Cell Press , 2004. - August ( vol. 14 , nr. 16 ). - S. 1436-1450 . - doi : 10.1016/j.cub.2004.07.051 . — PMID 15324660 .