TCF4
TCF4
|
---|
|
|
|
Symboler
| TCF4 , E2-2, ITF-2, ITF2, PTHS, SEF-2, SEF2, SEF2-1, SEF2-1A, SEF2-1B, SEF2-1D, TCF-4, bHLHb19, FECD3, transkriptionsfaktor 4, CDG2T |
---|
Eksterne ID'er |
OMIM: 602272 MGI: 98506 HomoloGene: 2407 GeneCards: 6925
|
---|
|
Sygdommens navn |
Links |
---|
sygelig fedme |
|
skizofreni |
|
colitis ulcerosa |
|
skleroserende kolangitis |
|
Endotel hornhindedystrofi |
|
Pitt-Hopkins syndrom |
|
Funktioner |
• proteindimeriseringsaktivitet • proteinhomodimerisering • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-bindende transkriptionsfaktoraktivitet • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001130:0001201:000120GO:000120GO:000120GO, GO:0001201, GO:00010GO,5 -bindende transkriptionsaktivatoraktivitet, RNA-polymerase II-specifik • bHLH-transkriptionsfaktorbinding • E- boksbinding • protein C-terminusbinding • GO:0001948, GO:0016582 plasmaproteinbinding • lignende proteinbinding • TFIIB-klasse transkriptionsfaktorbinding • proteinheterodimeriseringsaktivitet • DNA-binding • GO:0000980 RNA-polymerase II cis-regulatorisk region sekvensspecifik DNA-binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-bindende transkriptionsfaktoraktivitet, RNA-polymerase II-specifik
|
---|
celle komponent |
• transkriptionsregulatorkompleks • cellekerne • beta-catenin-TCF-kompleks • beta-catenin-TCF7L2-kompleks
|
---|
biologisk proces |
• Celledifferentiering • GO:0009373 DNA-afhængig regulering af transkription • protein-DNA kompleks samling • transkription, DNA-afhængig • udvikling af nervesystemet • GO:0060469, GO:0009371 DNA-afhængig positiv regulering af transkription • DNA-templeret transkription, initiering • transkriptionsinitiering fra RNA-polymerase II-promotor • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positiv regulering af transkription med RNA-polymerase II-promotor • positiv regulering af neurondifferentiering
|
---|
Kilder: Amigo / QuickGO | |
Slags |
Human |
Mus |
---|
Entrez |
|
|
---|
Ensemble |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (mRNA) |
| |
---|
RefSeq (protein) |
| |
---|
Locus (UCSC) |
Chr 18: 55,22 – 55,66 Mb
| Chr 18: 69,34 – 69,69 Mb
|
---|
PubMed- søgning |
[9]
| [ti] |
---|
Rediger (menneske) | Rediger (mus) |
TCF-4 (fra engelsk Transcription factor 4 ) eller Transcription factor 4 , også kendt som immunoglobulin transcription factor 2 ( ITF-2 ), er et protein, som hos mennesker er kodet af TCF4-genet placeret på kromosom 18q21.2 [1] .
Funktion
TCF4-proteinet fungerer som en transkriptionsfaktor, der binder til mu-E5/kappa-E2-immunoglobulinforstærker-motivet. TCF4 aktiverer transkription ved at binde til E-boksen (5'-CANNTG-3'), der almindeligvis findes på SSTR2 -INR eller initiatorelementet af somatostatinreceptoren 2 . TCF4 er primært involveret i føtal neurologisk udvikling under graviditet ved at initiere neural differentiering ved at binde til DNA. Det findes i centralnervesystemet, somitter og progenitor gonader tidligt i udviklingen. I senere udviklingsstadier findes det i skjoldbruskkirtlen, thymus og nyrerne, mens TCF4 i voksenalderen kan findes i lymfocytter, muskler, modne neuroner og mave-tarmsystemet [2] [3] [4] .
Klinisk betydning
Mutationer i TCF4 forårsager Pitt-Hopkins syndrom (PTHS). Disse mutationer forårsager, at TCF4-proteiner ikke binder ordentligt til DNA og kontrollerer differentiering af nervesystemet. I de fleste af de undersøgte tilfælde var mutationerne de novo, det vil sige, det var en ny mutation, der ikke blev fundet i andre medlemmer af patientens familie. Almindelige symptomer på Pitt-Hopkins syndrom omfatter en bred mund, mave-tarmproblemer, forsinket finmotorisk udvikling, tale- og vejrtrækningsproblemer, epilepsi og andre hjernedefekter [5] [6] .
Noter
- ↑ Henthorn P, McCarrick-Walmsley R, Kadesch T (feb 1990). "Sekvens af cDNA'et, der koder for ITF-2, en positivt virkende transkriptionsfaktor" . Nukleinsyreforskning . 18 (3): 678. doi : 10.1093/nar/ 18.3.678 . PMC 333500 . PMID2308860 . _
- ↑ de Pontual L, Mathieu Y, Golzio C, Rio M, Malan V, Boddaert N, et al. (april 2009). "Mutationelle, funktionelle og ekspressionsundersøgelser af TCF4-genet i Pitt-Hopkins syndrom." Menneskelig mutation . 30 (4): 669-76. DOI : 10.1002/humu.20935 . PMID 19235238 .
- ↑ Pscherer A, Dörflinger U, Kirfel J, Gawlas K, Rüschoff J, Buettner R, Schüle R (dec. 1996). "Helix-loop-helix-transkriptionsfaktoren SEF-2 regulerer aktiviteten af et nyt initiatorelement i promotoren af det humane somatostatinreceptor II-gen" . EMBO Journal . 15 (23): 6680-90. DOI : 10.1002/j.1460-2075.1996.tb01058.x . PMC 452492 . PMID 8978694 .
- ↑ D'Rozario, Mitchell; Zhang, Ting; Waddell, Edward A.; Zhang, Yonggang; Sahin, Cem; Sharoni, Michal; Hu, Tina; Nayal, Mohammed; Kutty, Kaveesh; Liebl, Tro; Hu, Wenhui (2016-04-12). "Type I bHLH-proteiner datterløse og Tcf4 begrænser neuritforgrening og synapsedannelse ved at undertrykke Neurexin i postmitotiske neuroner" . Cellerapporter . 15 (2): 386-397. DOI : 10.1016/j.celrep.2016.03.034 . ISSN 2211-1247 . PMC 4946342 . PMID27050508 . _
- ↑ Amiel J, Rio M, de Pontual L, Redon R, Malan V, Boddaert N, et al. (maj 2007). "Mutationer i TCF4, der koder for en klasse I grundlæggende helix-loop-helix transkriptionsfaktor, er ansvarlige for Pitt-Hopkins syndrom, en alvorlig epileptisk encefalopati forbundet med autonom dysfunktion . " American Journal of Human Genetics . 80 (5): 988-93. DOI : 10.1086/515582 . PMC 1852736 . PMID 17436254 .
- ↑ Zweier C, Peippo MM, Hoyer J, Sousa S, Bottani A, Clayton-Smith J, et al. (maj 2007). "Haploinsufficiens af TCF4 forårsager syndromal mental retardering med intermitterende hyperventilation (Pitt-Hopkins syndrom)" . American Journal of Human Genetics . 80 (5): 994-1001. DOI : 10.1086/515583 . PMC 1852727 . PMID 17436255 .