POLR2E

RNA-polymerase II-polypeptid E (styret DNA), 25 kDa

Identifikatorer

POLR2E ; RPABC1; RPB5; XAP4; hRPB25; hsRPB5

Eksterne ID'er

OMIM: 180664 MGI : 1913670 HomoloGene : 2018 GeneCards : POLR2E Gene

2.7.7.6

Gen-ontologi
Fungere	• RNA-polymerase I-aktivitet • RNA-polymerase II-aktivitet • RNA-polymerase III-aktivitet • DNA-binding • DNA-styret RNA-polymeraseaktivitet • proteinbinding
celle komponent	• kerne • nukleoplasma • DNA-styret RNA-polymerase II, kernekompleks • DNA-styret RNA-polymerase III-kompleks • DNA-styret RNA-polymerase I-kompleks • cytosol
biologisk proces	• mRNA-splejsning, via spliceosom • DNA-reparation • transkriptionskoblet nukleotidudskæringsreparation • nukleotidudskæringsreparation • transkription fra RNA-polymerase I-promotor • transkription fra RNA-polymerase II-promotor • transkriptionsinitiering fra RNA-polymerase II-promotor • transkriptionsforlængelse fra RNA-polymerase II-promotor • 7-methylguanosin mRNA capping • transkription fra RNA polymerase III promotor • transkriptionsforlængelse fra RNA polymerase III promotor • terminering af RNA polymerase III transkription • RNA splejsning • genekspression • viral proces • positiv regulering af type I interferon produktion • medfødt immunrespons • positiv regulering af viral transkription
Kilder: Amigo / QuickGO

RNA-ekspressionsprofil

Mere information

ortologer

Udsigt

Human

Mus

Entrez

RefSeq (mRNA)

RefSeq (protein)

Locus (UCSC)

Chr 19:
1,09 - 1,1 Mb

Chr 10:
80,04 – 80,04 Mb

Søg i PubMed

[en]

[2]

RPABC1-underenheden af DNA-afhængig RNA-polymerase I, II og III er et protein kodet i mennesker af POLR2E -genet . [en]

Dette gen koder for den femtestørste underenhed af RNA-polymerase II , den polymerase, der er ansvarlig for RNA- syntese i eukaryoter . Denne underenhed deles af de to andre DNA-afhængige RNA-polymeraser, og dens koncentration er det dobbelte af de andre polymerase-underenheder. Der er vist en interaktion mellem denne underenhed og transaktiveringen af hepatitisvirusproteinet . Det antages, at interaktionen mellem transkriptionsaktivatoren og polymerasen kan forekomme gennem denne underenhed. Pseudogenet af denne gnea er placeret på kromosom 11 [2] .

Interaktioner

POLR2E har vist sig at interagere med:

TAF15 , [3] POLR2C , [4] POLR2G , [4] POLR2H , [4] POLR2A , [4] POLR2B , [4] POLR2L [4] og GTF2F2 [5] .

Noter

↑ Acker J., Mattei MG, Wintzerith M., Roeckel N., Depetris D., Vigneron M., Kedinger C. Chromosomal localization of human RNA polymerase II subunit geners // Genomics : journal. - 1994. - August ( bind 20 , nr. 3 ). - S. 496-499 . - doi : 10.1006/geno.1994.1208 . — PMID 8034326 .
↑ Entrez-gen: POLR2E-polymerase (RNA) II (DNA-rettet) polypeptid E, 25kDa . Arkiveret fra originalen den 5. december 2010. (ubestemt)
↑ Bertolotti, A; Melot T; Acker J; Vigneron M; Delattre O; Tora L. EWS, men ikke EWS-FLI-1, er forbundet med både TFIID- og RNA-polymerase II: interaktioner mellem to medlemmer af TET-familien, EWS og hTAFII68, og underenheder af TFIID- og RNA-polymerase II - komplekser / Molecular and Cellular Biology : journal. - USA, 1998. - Marts ( bind 18 , nr. 3 ). - S. 1489-1497 . — ISSN 0270-7306 . — PMID 9488465 .
↑ 1 2 3 4 5 6 Acker, J; de Graaff M; Cheynel I; Khazak V; Kedinger C; Vigneron M. Interaktioner mellem de humane RNA-polymerase II-underenheder (engelsk) // Journal of Biological Chemistry : tidsskrift. - USA, 1997. - Juli ( vol. 272 , nr. 27 ). - P. 16815-16821 . — ISSN 0021-9258 . doi : 10.1074 / jbc.272.27.16815 . — PMID 9201987 .
↑ Wei, W; Dorjsuren D; LinY; Qin W; Nomura T; Hayashi N; Murakami S. Direkte interaktion mellem underenheden RAP30 af transkriptionsfaktor IIF (TFIIF) og RNA polymerase underenhed 5, som bidrager til sammenhængen mellem TFIIF og RNA polymerase II // Journal of Biological Chemistry : journal. - USA, 2001. - April ( vol. 276 , nr. 15 ). - P. 12266-12273 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M009634200 . — PMID 11278533 .

Litteratur

Zhang KT Tat, Tat-associeret kinase og transkription. (engelsk) // Journal of Biomedical Science : journal. - 1998. - Bd. 5 , nr. 1 . - S. 24-7 . - doi : 10.1007/BF02253352 . — PMID 9570510 .
Yankulov K., Bentley D. Transkriptionel kontrol: Tat-kofaktorer og transkriptionel forlængelse. (engelsk) // Current Biology : journal. - Cell Press , 1998. - Vol. 8 , nr. 13 . - P.R447-9 . - doi : 10.1016/S0960-9822(98)70289-1 . — PMID 9651670 .
Romano G., Kasten M., De Falco G., et al. Regulatoriske funktioner af Cdk9 og cyclin T1 i HIV tat transaktiveringsvej genekspression. (engelsk) // Journal of Cellular Biochemistry : journal. - 2000. - Vol. 75 , nr. 3 . - s. 357-368 . - doi : 10.1002/(SICI)1097-4644(19991201)75:3<357::AID-JCB1>3.0.CO;2-K . — PMID 10536359 .
Marcello A., Zoppé M., Giacca M. Flere måder for transkriptionel regulering af HIV-1 Tat-transaktivatoren. (engelsk) // IUBMB Life: journal. - 2002. - Bd. 51 , nr. 3 . - S. 175-181 . - doi : 10.1080/152165401753544241 . — PMID 11547919 .
Stevens M., De Clercq E., Balzarini J. Reguleringen af HIV-1-transkription: molekylære mål for kemoterapeutisk intervention. (engelsk) // Med Res Rev : journal. - 2007. - Bd. 26 , nr. 5 . - S. 595-625 . - doi : 10.1002/med.20081 . — PMID 16838299 .
Harrich D., McMillan N., Munoz L., et al. Vil forskellige Tat-interaktioner føre til nye antiretrovirale lægemiddelmål? (eng.) // Current drug targets : journal. - 2007. - Bd. 7 , nr. 12 . - S. 1595-1606 . - doi : 10.2174/138945006779025338 . — PMID 17168834 .
Kato H., Sumimoto H., Pognonec P., et al. HIV-1 Tat virker som en processivitetsfaktor in vitro i forbindelse med cellulære forlængelsesfaktorer. (engelsk) // Gener & Development : tidsskrift. - 1992. - Bd. 6 , nr. 4 . - S. 655-666 . - doi : 10.1101/gad.6.4.655 . — PMID 1559613 .
Pati UK, Weissman SM Isolering og molekylær karakterisering af et cDNA, der koder for 23-kDa-underenheden af human RNA-polymerase II. (engelsk) // Journal of Biological Chemistry : tidsskrift. - 1991. - Bd. 266 , nr. 20 . — S. 13468 . — PMID 2071613 .
Southgate C., Zapp ML, Green MR Aktivering af transkription af HIV-1 Tat-protein bundet til begyndende RNA gennem et andet protein. (engelsk) // Natur: journal. - 1990. - Bd. 345 , nr. 6276 . - S. 640-642 . - doi : 10.1038/345640a0 . — PMID 2190099 .
Pati UK, Weissman SM Isolering og molekylær karakterisering af et cDNA, der koder for 23-kDa-underenheden af human RNA-polymerase II. (engelsk) // Journal of Biological Chemistry : tidsskrift. - 1989. - Bd. 264 , nr. 22 . - S. 13114-13121 . — PMID 2753903 .
Wu-Baer F., Sigman D., Gaynor RB Specifik binding af RNA-polymerase II til det transaktiverende område af human immundefektvirus RNA reguleres af cellulære cofaktorer og Tat. (engelsk) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 1995. - Bd. 92 , nr. 16 . - P. 7153-7157 . - doi : 10.1073/pnas.92.16.7153 . — PMID 7638159 .
Cheong JH, Yi M., Lin Y., Murakami S. Human RPB5, en underenhed, der deles af eukaryote nukleare RNA-polymeraser, binder humant hepatitis B-virus X-protein og kan spille en rolle i X-transaktivering. (engelsk) // The EMBO Journal : journal. - 1995. - Bd. 14 , nr. 1 . - S. 143-150 . — PMID 7828586 .
Herrmann CH, Rice AP Lentivirus Tat-proteiner associeres specifikt med en cellulær proteinkinase, TAK, der hyperphosphorylerer det carboxylterminale domæne af den store underenhed af RNA-polymerase II: kandidat til en Tat-cofaktor. (engelsk) // Journal of Virology : journal. - 1995. - Bd. 69 , nr. 3 . - S. 1612-1620 . — PMID 7853496 .
Keen NJ, Gait MJ, Karn J. Human immundefektvirus type-1 Tat er en integreret komponent af det aktiverede transkriptionsforlængelsekompleks. (engelsk) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 1996. - Bd. 93 , nr. 6 . - S. 2505-2510 . - doi : 10.1073/pnas.93.6.2505 . — PMID 8637904 .
Yang X., Herrmann CH, Rice AP De humane immundefektvirus Tat-proteiner associeres specifikt med TAK in vivo og kræver det carboxylterminale domæne af RNA-polymerase II for at fungere. (engelsk) // Journal of Virology : journal. - 1996. - Bd. 70 , nr. 7 . - P. 4576-4584 . — PMID 8676484 .
Agostini I., Navarro JM, Rey F., et al. Den humane immundefektvirus type 1 Vpr-transaktivator: samarbejde med promotorbundne aktivatordomæner og binding til TFIIB. (engelsk) // Journal of Molecular Biology : journal. - 1996. - Bd. 261 , nr. 5 . - S. 599-606 . - doi : 10.1006/jmbi.1996.0485 . — PMID 8800208 .
Zhou Q., Sharp PA Tat-SF1: cofaktor til stimulering af transkriptionel forlængelse af HIV-1 Tat. (engelsk) // Videnskab: tidsskrift. - 1996. - Bd. 274 , nr. 5287 . - S. 605-610 . - doi : 10.1126/science.274.5287.605 . — PMID 8849451 .
Okamoto H., Sheline CT, Corden JL, et al. Transaktivering af humant immundefektvirus Tat-protein kræver det C-terminale domæne af RNA-polymerase II. (engelsk) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 1996. - Bd. 93 , nr. 21 . - P. 11575-11579 . - doi : 10.1073/pnas.93.21.11575 . — PMID 8876177 .
Chun RF, Zhang KT Krav til RNA-polymerase II carboxyl-terminalt domæne til aktiveret transkription af humane retrovira human T-celle lymfotropisk virus I og HIV-1. (engelsk) // Journal of Biological Chemistry : tidsskrift. - 1996. - Bd. 271 , nr. 44 . - P. 27888-27894 . doi : 10.1074 / jbc.271.44.27888 . — PMID 8910388 .