POLR2A
RPB1-underenheden af DNA-styret RNA-polymerase II , også kendt som RPB1 , er et enzym kodet i mennesker af POLR2A -genet .
Funktion
Dette gen koder for den store underenhed af RNA-polymerase II , polymerasen, der er ansvarlig for RNA- syntese i eukaryoter . Produktet af dette gen indeholder et carboxylterminalt domæne bestående af heptapeptidgentagelser, der kræves til polymeraseaktivitet . Disse gentagelser indeholder serin- og threoninrester, som, når de er aktive, phosphorylerer transkriptionen af RNA-polymerase . Derudover danner denne underenhed, i kombination med nogle andre polymerase-underenheder, det polymerase-DNA-bindende domæne, hvor messenger-DNA transskriberes til RNA. [en]
Interaktioner
POLR2A har vist sig at interagere med:
- BRCA1 , [2] [3] [4] [5]
- CREBBP , [6]
- CTDP1 , [3]
- CDK8 , [6]
- GTF2B , [3]
- GTF2F1 , [6] [3]
- GTF2H4 , [3]
- MED21 , [6] [3] [7]
- MED26 , [8]
- PCAF , [6]
- POLR2C , [9]
- POLR2E , [9]
- POLR2H , [9]
- POLR2L , [9]
- PQBP1 , [10]
- SMARCA2 , [6] [11] [12]
- SMARCA4 [11] [12] [13]
- SMARCB1 , [6] [11] [12]
- SMYD3 , [14]
- SND1 , [15]
- SUPT5H , [16] [17]
- TAF11 , [3]
- TBP , [3]
- TCEA1 , [18] [19] [20]
- TCERG1 , [21] og
- ZNF74 . [22]
Noter
- ↑ Entrez-gen: POLR2A-polymerase (RNA) II (DNA-rettet) polypeptid A, 220 kDa . (ubestemt)
- ↑ Krum SA, Miranda GA, Lin C., Lane TF BRCA1 associerer med processiv RNA-polymerase II // Journal of Biological Chemistry : tidsskrift. - 2003. - December ( bind 278 , nr. 52 ). - S. 52012-52020 . - doi : 10.1074/jbc.M308418200 . — PMID 14506230 .
- ↑ 1 2 3 4 5 6 7 8 Scully R., Anderson SF, Chao DM, Wei W., Ye L., Young RA, Livingston DM, Parvin JD BRCA1 er en komponent af RNA-polymerase II- holoenzymet // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : tidsskrift. - 1997. - Maj ( bind 94 , nr. 11 ). - P. 5605-5610 . - doi : 10.1073/pnas.94.11.5605 . — PMID 9159119 .
- ↑ Chiba N., Parvin JD Omfordeling af BRCA1 blandt fire forskellige proteinkomplekser efter replikationsblokering // Journal of Biological Chemistry : tidsskrift. - 2001. - Oktober ( bind 276 , nr. 42 ). - P. 38549-38554 . - doi : 10.1074/jbc.M105227200 . — PMID 11504724 .
- ↑ Krum SA, Womack JE, Lane TF Bovin BRCA1 viser klassiske reaktioner på genotoksisk stress, men lav in vitro transkriptionel aktiveringsaktivitet // Onkogen : journal. - 2003. - September ( bind 22 , nr. 38 ). - P. 6032-6044 . - doi : 10.1038/sj.onc.1206515 . — PMID 12955082 .
- ↑ 1 2 3 4 5 6 7 Cho H., Orphanides G., Sun X., Yang XJ, Ogryzko V., Lees E., Nakatani Y., Reinberg D. Et humant RNA-polymerase II-kompleks indeholdende faktorer, der modificerer kromatinstrukturen (engelsk) // Molecular and Cellular Biology : journal. - 1998. - September ( bind 18 , nr. 9 ). - P. 5355-5363 . — PMID 9710619 .
- ↑ Suñé C., Hayashi T., Liu Y., Lane WS, Young RA, Garcia-Blanco MA CA150, et nukleært protein forbundet med RNA-polymerase II-holoenzymet, er involveret i Tat-aktiveret human immundefektvirus type 1- transkription.) // Molekylær og cellulær biologi : journal. - 1997. - Oktober ( bind 17 , nr. 10 ). - P. 6029-6039 . — PMID 9315662 .
- ↑ Sato S., Tomomori-Sato C., Parmely TJ, Florens L., Zybailov B., Swanson SK, Banks CA, Jin J., Cai Y., Washburn MP, Conaway JW, Conaway RC Et sæt konsensuspattedyrsmæglere underenheder identificeret ved multidimensionel proteinidentifikationsteknologi // Molecular Cell : journal. - 2004. - Juni ( bind 14 , nr. 5 ). - S. 685-691 . - doi : 10.1016/j.molcel.2004.05.006 . — PMID 15175163 .
- ↑ 1 2 3 4 Acker J., de Graaff M., Cheynel I., Khazak V., Kedinger C., Vigneron M. Interaktioner mellem de humane RNA-polymerase II-underenheder // Journal of Biological Chemistry : journal. - 1997. - Juli ( bd. 272 , nr. 27 ). - P. 16815-16821 . doi : 10.1074 / jbc.272.27.16815 . — PMID 9201987 .
- ↑ Humbert S., Saudou F. Mod cellespecificitet i SCA1 // Neuron. - Cell Press , 2002. - Maj ( vol. 34 , nr. 5 ). - S. 669-670 . - doi : 10.1016/s0896-6273(02)00715-8 . — PMID 12062012 .
- ↑ 1 2 3 Sif S., Saurin AJ, Imbalzano AN, Kingston RE Oprensning og karakterisering af mSin3A-holdige Brg1 og hBrm kromatin remodeling complexes // Genes & Development : journal. - 2001. - Marts ( bind 15 , nr. 5 ). - S. 603-618 . - doi : 10.1101/gad.872801 . — PMID 11238380 .
- ↑ 1 2 3 Wang W., Côté J., Xue Y., Zhou S., Khavari PA, Biggar SR, Muchardt C., Kalpana GV, Goff SP, Yaniv M., Workman JL, Crabtree GR Rensning og biokemisk heterogenitet af pattedyret SWI-SNF-komplekset // The EMBO Journal : journal. - 1996. - Oktober ( bind 15 , nr. 19 ). - P. 5370-5382 . — PMID 8895581 .
- ↑ Zhao K., Wang W., Rando OJ, Xue Y., Swiderek K., Kuo A., Crabtree GR Hurtig og phosphoinositol-afhængig binding af det SWI/SNF-lignende BAF-kompleks til kromatin efter T-lymfocytreceptorsignalering .) // Celle : journal. - Cell Press , 1998. - November ( vol. 95 , nr. 5 ). - s. 625-636 . - doi : 10.1016/s0092-8674(00)81633-5 . — PMID 9845365 .
- ↑ Hamamoto R., Furukawa Y., Morita M., Iimura Y., Silva FP, Li M., Yagyu R., Nakamura Y. SMYD3 koder for en histonmethyltransferase involveret i proliferationen af kræftceller (Eng.) // Nature Cellebiologi : tidsskrift. - 2004. - August ( bind 6 , nr. 8 ). - S. 731-740 . - doi : 10.1038/ncb1151 . — PMID 15235609 .
- ↑ Yang J., Aittomäki S., Pesu M., Carter K., Saarinen J., Kalkkinen N., Kieff E., Silvennoinen O. Identifikation af p100 som en coactivator for STAT6, der bygger bro mellem STAT6 med RNA-polymerase II ) // EMBO Journal : journal. - 2002. - September ( bind 21 , nr. 18 ). - S. 4950-4958 . - doi : 10.1093/emboj/cdf463 . — PMID 12234934 .
- ↑ Kim JB, Yamaguchi Y., Wada T., Handa H., Sharp PA Tat-SF1-protein associerer med RAP30 og humane SPT5-proteiner // Molecular and Cellular Biology : journal. - 1999. - September ( bind 19 , nr. 9 ). - P. 5960-5968 . — PMID 10454543 .
- ↑ Wada T., Takagi T., Yamaguchi Y., Ferdous A., Imai T., Hirose S., Sugimoto S., Yano K., Hartzog GA, Winston F., Buratowski S., Handa H. DSIF, en ny transkriptionsforlængelsefaktor, der regulerer RNA-polymerase II-processivitet, er sammensat af humane Spt4- og Spt5-homologer // Genes & Development : journal. - 1998. - Februar ( bind 12 , nr. 3 ). - S. 343-356 . - doi : 10.1101/gad.12.3.343 . — PMID 9450929 .
- ↑ Conaway RC, Kong SE, Conaway JW TFIIS og GreB: to ligesindede transkriptionsforlængelsefaktorer med klæbrige fingre // Celle : journal. - Cell Press , 2003. - August ( vol. 114 , nr. 3 ). - S. 272-274 . — PMID 12914690 .
- ↑ Archambault J., Pan G., Dahmus GK, Cartier M., Marshall N., Zhang S., Dahmus ME, Greenblatt J. FCP1, den RAP74-interagerende underenhed af en human proteinphosphatase, der dephosphorylerer det carboxylterminale domæne af RNA polymerase IIO (engelsk) // Journal of Biological Chemistry : tidsskrift. - 1998. - Oktober ( bind 273 , nr. 42 ). - P. 27593-27601 . doi : 10.1074/ jbc.273.42.27593 . — PMID 9765293 .
- ↑ Pan G., Aso T., Greenblatt J. Interaktion mellem forlængelsesfaktorer TFIIS og elongin A med et humant RNA-polymerase II-holoenzym, der er i stand til promotorspecifik initiering og reagerer på transkriptionelle aktivatorer // Journal of Biological Chemistry : journal . - 1997. - September ( vol. 272 , nr. 39 ). - P. 24563-24571 . doi : 10.1074 / jbc.272.39.24563 . — PMID 9305922 .
- ↑ Carty SM, Goldstrohm AC, Suñé C., Garcia-Blanco MA, Greenleaf AL Protein-interaktionsmoduler, der organiserer nuklear funktion: FF-domæner af CA150 binder phosphoCTD af RNA-polymerase II // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United Amerikas stater : tidsskrift. - 2000. - August ( bind 97 , nr. 16 ). - P. 9015-9020 . - doi : 10.1073/pnas.160266597 . — PMID 10908677 .
- ↑ Grondin B., Côté F., Bazinet M., Vincent M., Aubry M. Direkte interaktion mellem KRAB / Cys2-His2 zinkfingerproteinet ZNF74 med en hyperphosphoryleret form af RNA-polymerase II største underenhed // Journal of Biological Chemistry : journal. - 1997. - Oktober ( bind 272 , nr. 44 ). - P. 27877-27885 . doi : 10.1074 / jbc.272.44.27877 . — PMID 9346935 .
Litteratur
- Zhang KT Tat, Tat-associeret kinase og transkription // Journal of Biomedical Science : journal. - 1998. - Bd. 5 , nr. 1 . - S. 24-7 . - doi : 10.1007/BF02253352 . — PMID 9570510 .
- Yankulov K., Bentley D. Transcriptional control: Tat cofactors and transcriptional elongation (engelsk) // Current Biology : journal. - Cell Press , 1998. - Vol. 8 , nr. 13 . - P.R447-9 . - doi : 10.1016/S0960-9822(98)70289-1 . — PMID 9651670 .
- Romano G., Kasten M., De Falco G., Micheli P., Khalili K., Giordano A. Regulatoriske funktioner af Cdk9 og cyclin T1 i genekspression af HIV tat-transaktiveringsvej // Journal of Cellular Biochemistry : journal. - 2000. - Vol. 75 , nr. 3 . - s. 357-368 . - doi : 10.1002/(SICI)1097-4644(19991201)75:3<357::AID-JCB1>3.0.CO;2-K . — PMID 10536359 .
- Szentirmay MN, Sawadogo M. Rumlig organisation af RNA-polymerase II-transkription i kernen // Nukleinsyreforskning : journal. - 2000. - Vol. 28 , nr. 10 . — S. 2019—2025 . - doi : 10.1093/nar/10/28/2019 . — PMID 10773068 .
- Marcello A., Zoppé M., Giacca M. Flere måder for transkriptionel regulering af HIV-1 Tat-transaktivatoren // IUBMB Life : journal. - 2002. - Bd. 51 , nr. 3 . - S. 175-181 . - doi : 10.1080/152165401753544241 . — PMID 11547919 .
Links