Kirkes separatisme - i modsætning til et skisma , ikke skabelsen af sin egen parallelle "kirke", men, med en formel tilhørsforhold til den dominerende kirke, fuldstændig ikke-deltagelse i dens ydre liv. Samtidig er det kun bevidste kristne, der har besluttet at føre en mere eller mindre streng kristen livsstil uden at knytte sig til den officielle kirke, der kan være "separatister" - og ikke bare døbte, men faktisk mennesker, der er ligeglade med Kirken og hører faktisk ikke til den.
Selvom nogle forskere forstår kirkeseparatisme som enhver adskillelse af en person eller gruppe af mennesker fra den officielle kirke, og derfor klassificerer Novatian , Donatus , Tertullian og andre skikkelser fra den tidlige kristendom som separatister, bruges dette udtryk hovedsageligt i relation til reformationstiden . Grundlæggerne af denne form for separatisme er Jodocus van Lodenstein (den "bløde" version) og Jean de Labadi (men senere blev Labadis separatisme forvandlet til en klassisk sekt). Kirkes separatisme var ret almindelig i pietistiske kredse . Separatisterne var Gottfried Arnold (i den første periode af hans aktivitet), Gerhard Terstegens lærer Wilhelm Hoffmann og mange andre. osv. Separatisterne undgik at deltage i gudstjenester og nadver, arrangere bøn og prædikemøder i deres hjem.