Shikimatkinase

Shikimatkinase ( EF-kode 2.7.1.71 ) er et enzym, der katalyserer den ATP - afhængige phosphorylering af shikimat med dannelse af shikimat-3-phosphat [1] . Denne reaktion er det femte trin i shikimat-vejen [2] , som bruges af planter og bakterier til at syntetisere en almindelig aromatisk aminosyreprecursor og sekundære metabolitter. Det systematiske navn for denne klasse af enzymer er ATP: shikimat-3-phosphotransferase . Andre almindeligt anvendte navne inkluderer shikimatkinase (phosphorylering) og shikimatkinase II .

Generel beskrivelse

Shikimat-vejen består af syv enzymatiske reaktioner, hvorved phosphoenolpyruvat og erythrose-4-phosphat omdannes til chorismat , en fælles forløber for de aromatiske aminosyrer phenylalanin , tyrosin og tryptophan . Aromatiske aminosyrer bruges i proteinsyntese og i planter, svampe og bakterier giver anledning til en række andre specialiserede metabolitter såsom phenylpropanoider og alkaloider . Horismat og flere andre mellemprodukter af denne vej tjener som forløbere for en række andre metabolitter såsom folater, quinater og quinoner. De fire enzymer, der går forud for shikimatkinase på denne vej, er DAHP-syntase, 3-dehydroquinatsyntase, 3-dehydroquinatdehydratase og shikimatdehydrogenase, og de to efterfølgende er EPSP-syntase og chorismatsyntase. Hos svampe og protozoer er det en del af AROM-komplekset, som colokaliserer de fem centrale trin i shikimat-banen [3] . Vejen findes ikke hos mennesker og andre dyr, som skal få aromatiske aminosyrer fra fødevarer.

Aktivitet

Reaktionen katalyseret af shikimatkinase er vist nedenfor:

Denne reaktion involverer overførsel af en fosfatgruppe fra ATP til 3-hydroxylgruppen i shikimat. Shikimatkinase har således to substrater , shikimat og ATP , og to produkter, shikimat-3-phosphat og ADP [4] .

Eksempler

Humane proteiner, der indeholder dette domæne, inkluderer: MAPK7 og THNSL1.

Referencer

1. ↑ "Shikimate kinase isoenzymes in Salmonella typhimurium". Journal of Biological Chemistry . 243 (3): 676-7. februar 1968. PMID  4866525 .
2. ↑ "The Shikimate Pathway". Årlig gennemgang af plantefysiologi og plantemolekylærbiologi . 50 : 473-503. juni 1999. doi : 10.1146/annurev.arplant.50.1.473 . PMID  15012217 .
3. ↑ "Arkitektur og funktionel dynamik i det pentafunktionelle AROM-kompleks". Naturens kemiske biologi . 16 (9): 973-978. juli 2020. doi : 10.1038/ s41589-020-0587-9 . PMID 32632294 . 
4. ↑ "Mekanisme af phosphoryloverførsel katalyseret af shikimatkinase fra Mycobacterium tuberculosis". Journal of Molecular Biology . 364 (3): 411-23. December 2006. doi : 10.1016/j.jmb.2006.09.001 . PMID  17020768 .