Orthohantavirus

Orthohantavirus
Elektronmikrofotografi af Sin Nombre-virus
videnskabelig klassifikation
Gruppe:Virus [1]Rige:RiboviriaKongerige:OrthornaviraeType:NegarnaviricotaUndertype:PolyploviricotinaKlasse:EllioviricetesBestille:BunyaviralesFamilie:HantaviridaeSlægt:Orthohantavirus
Internationalt videnskabeligt navn
Orthohantavirus
Baltimore-gruppen
V: (-)ssRNA-vira
Systematik hos Wikispecies Billeder på Wikimedia Commons NCBI   1980442

Orthohantavirus ( lat.  Orthohantavirus , tidligere Hantavirus ) er en slægt af humane og animalske vira fra familien Hantaviridae (hantavirus) af ordenen Bunyavirales . Sfæriske virioner i størrelse fra 228 til 5051 nm er dækket med en lipidmembran. Typestammen blev først beskrevet i 1978. Som medlemmer af ordenen Bunyavirales har Orthohantavira et tredelt fragmenteret genom af negativt enkeltstrenget RNA . Det store segment af genomet koder for RNA-afhængig RNA-polymerase (replikase ), det midterste segment koder for to glycoproteiner af virusets ydre membran, og det lille koder for nukleocapsidproteinet . Infektion med hantavirus hos indbyggere i Europa og Asien viser sig i en mild form for hæmoragisk feber med nyresyndrom , selvom der i de senere år er blevet rapporteret om dødsfald hos patienter med Dobrava - Beograd orthohantavirusvirus , hvoraf fire tilfælde blev registreret i 2009 i Krasnodar-territoriet [2] . Navnene på vira tildeles i overensstemmelse med traditionen for taksonomi for arbovirus og robovirus  - i overensstemmelse med det geografiske område, hvor de blev fundet [3] . Siden 2017, for at undgå forvirring i navnene på arter fra én region for slægten Orthohantavirus , er ordet virus i dem blevet erstattet af orthohantavirus [4] .

Symptomer

Globalt kan der skelnes mellem to hovedkategorier: Old World hantaviruses og New World hantaviruses .

Hæmoragisk feber med nyresyndrom

Hæmoragisk feber med nyresyndrom (HFRS) er en gruppe af klinisk lignende sygdomme forårsaget af forskellige typer hantavirus i den gamle verden. Blandt dem er: Hantaan orthohantavirus , Puumala orthohantavirus , Dobrava-Belgrad orthohantavirus og Khabarovsk orthohantavirus [5] . Dødeligheden af ​​denne sygdom er i gennemsnit omkring 12%.

Hantavirus kardiopulmonært syndrom

Hantavirus kardiopulmonært syndrom er en lignende gruppe af klinisk lignende sygdomme, der forekommer i Nord- og Sydamerika. Denne gruppe af vira omfatter arter som Andes orthohantavirus , Laguna Negra orthohantavirus , Rio Segundo virus og Sin Nombre orthohantavirus [6] . Dødeligheden af ​​denne sygdom er i gennemsnit op til 36 % [7] , selvom den i nogle tilfælde nåede 60 %.

Opdagelseshistorie

Det første store møde med hantavirus anses for at være et udbrud af en sygdom kendt som "koreansk hæmoragisk feber". Dette skete under Koreakrigen 1950-1953. Derefter blev mere end 3.000 FN- soldater udsat for et ukendt middel, der forårsagede indre blødninger og nedsat nyrefunktion. Niveauet af medicin på det tidspunkt tillod ikke at bestemme årsagen til sygdommen, så virussen forblev ukendt indtil 1976.

Det lykkedes lægerne Lee og Johnson at isolere det ætiologiske middel fra en almindelig markmus . Lungevævet fra fangede gnavere viste en specifik reaktion på blodserum hos patienter med koreansk hæmoragisk feber. Senere blev der foretaget en sammenligning mellem virusstammer fra mus og syge mennesker. En undersøgelse fra samme år viste en sammenhæng mellem udbrud af en lignende sygdom i Sovjetunionen [5] . I øjeblikket er koreansk hæmoragisk feber kendt som hæmoragisk feber med nyresyndrom og har vist sig at være forårsaget af Hantaan orthohantavirus .

Et sygdomsudbrud og begyndelsen af ​​arbejdet med undersøgelsen af ​​hantavirus i USA fandt sted i 1993 i Four Corners -regionen i Colorado . En ung og fysisk sund repræsentant for Navajo- folket følte sig pludselig utilpas, begyndte at blive kvalt og døde, på trods af lægernes bedste indsats. Efterforskningen viste, at få dage før hændelsen døde den unge mands forlovede også af lignende symptomer. På bare en kort periode blev der registreret fem lignende dødsfald. Forskere ved US Centers for Disease Control and Prevention brugte en ny metode til molekylær analyse af vira for at bestemme kilden. Virusset viste sig at være en ny, hidtil ukendt art af hantavirus. Efterfølgende blev virussen navngivet Sin Nombre virus fra det spanske for "navnløs virus" [8] .

Klassifikation

Arter registreret med ICTV

Arter af slægten har kun lidt lighed med andre grupper af vira. Den første klassificering af slægten Hantavirus blev foreslået i 1987 i en rapport til International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). Efterfølgende ændrede klassifikationen sig på grund af udvidelse og korrektion af artssammensætningen. I 2017, i forbindelse med beskrivelsen af ​​ordenen Bunyavirales , blev slægten adskilt i den monotypiske familie Hantaviridae , navnet blev ændret til Orthohantavirus [9] , og 41 arter blev inkluderet i den [4] :

Arter afventer registrering hos ICTV

Hvert år stiger antallet af opdagede hantavirus. De anerkendes enten som typestammer af nye arter eller sorter af andre arter. Fra marts 2017 er de vira, der kan inkluderes i Orthohantavirus- slægten [4] :

• Altai virus
• Camp Ripley virus
• isla vista virus
• Jemez Springs virus
• Kilimanjaro virus
• Muleshoe virus
• Qian Hu Shan virus
• Rio Segundo virus
• Shenyang virus
• Serang virus
• Uluguru virus
• Ussuri virus
• Xinyi virus
• xuan son virus
• Yuanjiang virus

Transportører

Hantavirus er robovirus , hvilket betyder, at de spredes gennem gnavere . Derudover kendes tilfælde, hvor infektion opstod efter bid af nogle arter af insektædende flagermus [12] . Forskellige typer vira har tætte bånd til deres bærere, hvilket gør dem til naturlige reservoirer . Nu er der ikke noget præcist svar på, om bærere af vira påvirker deres artsdannelse. Nogle undersøgelser tyder på, at hantavirus tilpasser sig en ny vært, og derved ændrer strukturen af ​​deres RNA og danner nye arter [13] [14] [15] . Andre undersøgelser viser, at mutationshastigheden af ​​RNA-vira svarer til mutationer i andre vira med en lignende struktur, hvoraf det konkluderes, at hypotesen om ledudvikling er falsk [16] [17] .

I de fleste tilfælde viser det naturlige reservoir ingen tegn på sygdom fra deres oprindelige hantavirus [18] (undtagelsen er Puumala-virussen, som i nogle tilfælde fører til værtens død [19] ). Ved infektion med alternative typer hantavirus fjerner voksne gnavere det fuldstændigt fra kroppen inden for 25-50 dage, men for unge individer er infektion oftest dødelig [20] .

En undersøgelse udført i 2010 på Eurasiens, Nord- og Sydamerikas territorium viste, at alle typer hantavirus kan opdeles i 3 globale grupper i henhold til underfamilierne af gnavere, der er deres bærere: mus , mus , bomuldshamstere [21] .

Overfør til en person

Oftest opstår menneskelig infektion med hantavirus gennem kontakt med gnavere eller deres affaldsprodukter (urin, spyt, lungesekret og ekskrementer). Oftere opstår smitte i varme og tørre årstider, når folk går ture i skoven i stort antal. Virussen trænger ind i menneskekroppen på forskellige måder [22] :

• Indånding af mikropartikler af ekskrementer sammen med støv i luften, for eksempel når man går ind i forladte eller mølkuglede lokaler, herunder lader, garager og lagerbygninger.
• Indtagelse af urinforurenet vand og mad.
• Direkte kontakt med en bærer (gnaverbid) er mindst tilbøjelige til at overføre denne virus.

Person-til-person overførsel af sygdommen er ikke karakteristisk for hantavirus. Ikke desto mindre forekommer sådanne tilfælde, men de er kun blevet registreret i Argentina [23] og Chile [24] .

Diagnostik

I øjeblikket bruges kun nukleocapsidproteinet til serologisk diagnose af hantavirusinfektioner . I klinisk praksis, til den primære påvisning af infektion og overvågning af den, er antistofserodiagnose i vid udstrækning anvendt i form af indirekte enzym-linked immunosorbent assay (ELISA).

Undersøgelse af hantavirus i Rusland

Undersøgelsen af ​​hæmoragisk feber med nyresyndrom begyndte i Rusland for mere end 70 år siden. De forårsagende stoffer til denne sygdom er Puumala- , Hantaan- , Seoul- og Dobrava-Beograd- vira . Disse omfatter, udover patogener til mennesker, også vira med epidemiologiske karakteristika, som endnu ikke er fastlagt. På Ruslands territorium cirkulerer mindst 8 hantavirusserotyper blandt små pattedyr.

Den mest almindelige naturlige fokale infektion i Rusland er hantavirusinfektion i form af hæmoragisk feber med nyresyndrom. Ifølge Rospotrebnadzor blev der i 2006 registreret 7197 tilfælde af sygdommen hos dets folk i 48 regioner i Den Russiske Føderation, forekomsten  var 5 tilfælde pr. 100 tusinde af befolkningen, hvilket er 1,4% mindre end i 2005, men blandt børn under fjorten år steg forekomsten med 17,3 %, det samlede antal syge i denne gruppe er 195 personer; forekomsten af ​​hantavirus er mere end 10-100 gange højere end forekomsten af ​​flåtbåren hjernebetændelse , rabies og andre sædvanlige naturlige fokale infektioner [25] .

Forebyggelse og infektionskontrol

I øjeblikket er der ingen effektiv behandling for hantavirus, andet end at lindre symptomer, samt at understøtte kroppens naturlige immunitet. Ved hantavirus kardiopulmonalt syndrom bliver patienterne straks kørt på hospitalet og hjulpet til at genoprette respiratoriske funktioner med flydende ilt og mekanisk ventilation [26] .

Ved HFRS etableres der løbende monitorering for patienten - der tages højde for den indsprøjtede og tabte væske (for at forhindre dehydrering ), fastlægges diæt nr. 4 , hvorefter følgende udføres: afgiftningsprofylakse, antiviral terapi, antioxidantbehandling , samt forebyggelse og behandling af infektiøs-toksisk shock [27] .

Gnaverbekæmpelse er den bedste måde at forhindre hantavirusinfektion på, da infektion hos mennesker sker gennem direkte kontakt med kropsvæsker og ekskrementer. Det hjælper også med at ødelægge gnaverreder ved at fjerne alle mulige revner og huller i huset, hvorigennem gnavere kan komme ind. Indenlandske rovdyr som katte og fritter kan også være en god hjælp til at forebygge sygdom.

I årene med Koreakrigen (1949-1953) manifesterede hantavirusinfektionen sig tydeligt, hvilket tvang videnskabsmænd til at begynde arbejdet med at skabe en vaccine umiddelbart efter opdagelsen af ​​hantavirus. Traditionelt udviklede antivirale vacciner baseret på inaktiverede hel-virion-materialer eller svækkede stammer blev brugt i de tidlige år, men på grund af vanskeligheder med at opnå high-titer hantavirus lysater, blev ukonventionelle tilgange også brugt i kandidatvacciner mod hæmoragisk feber med nyresyndrom.[ hvad? ] . Den mest prøvede og brugte er den dræbte vaccine Hantavax , udviklet af Institute of Viral Diseases i Sydkorea. I Kina testes fire forskellige vacciner. I Europa skabte Institut for Medicinsk Virologi i Tyskland en vaccine baseret på kimære partikler af Puumala-virus og vacciner baseret på rekombinante proteiner [28] [29] . Siden 1990'erne, Enterprise til produktion af bakterielle og virale præparater IPVE opkaldt efter. MP Chumakova er ved at udvikle en vaccine baseret på substratet af hjernevævet hos syriske hamstere [30] .

Noter

1. ↑ Taxonomy of Viruses  på webstedet International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) .
2. ↑ Boris Klempa, Evgeniy A. Tkachenko, Tamara K. Dzagurova, Yulia V. Yunicheva, Vyacheslav G. Morozov. Hæmoragisk feber med nyresyndrom forårsaget af 2 afstamninger af Dobrava Hantavirus, Rusland  // Nye infektionssygdomme. - 2008-04. - T. 14 , nej. 4 . — S. 617–625 . — ISSN 1080-6059 1080-6040, 1080-6059 . - doi : 10.3201/eid1404.071310 . Arkiveret fra originalen den 4. juli 2012.
3. ↑ Plusnin A. , Vaheri A. Saaremaa Hantavirus bør ikke forveksles med sin farlige slægtning, Dobrava-virus  //  Journal of Clinical Microbiology : tidsskrift. - 2006. - April ( nr. 44 ). — S. 1608 . - doi : 10.1128/JCM.44.4.1608-1611.2006 . .
4. ↑ 1 2 3 I slægten Hantavirus (foreslået familie Hantaviridae , foreslået rækkefølge Bunyavirales ), skab 24 nye arter, afskaffe 7 arter, ændr afgrænsningskriterierne og skift slægtens navn til Orthohantavirus ; ligeledes omdøb dens bestanddele  : [ eng. ] // ICTVonline. — Kode tildelt: 2016.023a-cM. - 2016. - S. 8, 14-15.
5. ↑ 1 2 Lee H. W. , Lee P. W. , Johnson K. M. Isolation of the etiologic agent of Korean Hemorrhagic Fever  //  Transactions of the Royal Society of Tropical Medicine and Hygiene : Journal. - 1978. - Marts ( nr. 137 ). - S. 298-308 .
6. ↑ Padula P. J. , Colavecchia S. B. , Martinez V. P. , Gonzalez Della Valle M. O. , Edelstein A. , Miguel S. D. L. , Russi J. , Mora Riquelme J. , Colucci N. , Almiron M. , Rabinovichs Distribution,  R. D. Hantavirusinfektion i fem lande i Sydamerika (engelsk)  // Journal of Clinical Microbiology : tidsskrift. - 2000. - August ( nr. 38 ). - S. 3029-3035 .
7. ↑ Rapporterede tilfælde af HPS: HPS i USA . Centers for Disease Control and Prevention (CDC) (21. april 2014). Hentet 21. november 2015. Arkiveret fra originalen 26. august 2017. (ubestemt)
8. ↑ Fulhorst C. F. , Monroe M. C. , Salas R. A. , Duno G. , Utrera A. , Ksiazek T. G. , Nichol S. T. , de Manzione N. M. , Tovar D. , Tesh R. B. Isolation, karakterisering og geografisk udbredelse af Caño-virus, en ny amerikansk delgadito-virus. hantavirus (familie Bunyaviridae)  (engelsk)  // Virus Research: journal. - 1997. - Oktober ( nr. 51 ). - S. 159-171 .
9. ↑ Opret en ny ordre, Bunyavirales , til at rumme ni familier (otte nye, en omdøbt) omfattende tretten slægter  : [ eng. ] // ICTVonline. — Kode tildelt: 2016.030a-vM. - 2016. - S. 5, 13.
10. ↑ 1 2 3 4 5 6 7 Implementering af ikke-latiniserede binomiale artsnavne i familien Bunyaviridae  : [ eng. ] // ICTVonline. — Kode tildelt: 2015.003aM. - 2015. - S. 3-4.
11. ↑ Liste over mikroorganismer, toksiner, udstyr og teknologier, der er underlagt eksportkontrol  : [godkendt. Dekret fra præsidenten for Den Russiske Føderation af 20. august 2007 nr. 1083]: embedsmand. tekst: tilgået 1. juni 2016
12. ↑ Guo W. P. , Lin X. D. , Wang W. , Tian J. H. , Cong M. L. , Zhang H. L. , Wang M. R. , Zhou R. H. , Wang J. B. , Li M. H. , Xu J. , Holmes E. C. Z. oprindelse af Phylogeny-virus, Phylogeny og harbor  Y. Z. insektædere og gnavere (engelsk)  // PLoS Pathogens : journal. - 2013. - Februar ( nr. 9 ). - doi : 10.1371/journal.ppat.1003159 . .
13. ↑ Hughes A. L. , Friedman R. Evolutionær diversificering af proteinkodende gener fra hantavirus   // Molecular Biology and Evolution : magasin. - Oxford University Press , 2000. - Oktober ( nr. 17 ). - S. 1558-1568 .
14. ↑ Plyusnin A. , Morzunov S. P. Virusudvikling og genetisk mangfoldighed af hantavira og deres gnaverværter  (engelsk)  // Aktuelle emner i mikrobiologi og immunologi : tidsskrift. - 2001. - Nej. 256 . - S. 47-75 .
15. ↑ Jackson A. P. , Charleston M. A. Et cofylogenetisk perspektiv på RNA-virus-evolution  //  Molecular Biology and Evolution : magasin. - Oxford University Press , 2004. - Januar ( nr. 21 ). - S. 45-57 .
16. ↑ Ramsden C. , Melo F. L. , Figueiredo L. M. , Holmes E. C. , Zanotto P. M. , VGDN Consortium. Høje hastigheder af molekylær evolution i hantavirus   // Molekylær biologi og evolution : magasin. - Oxford University Press , 2008. - Juli ( nr. 25 ). - S. 1488-1492 . - doi : 10.1093/molbev/msn093 . .
17. ↑ Ramsden C. , Holmes E. C. , Charleston M. A. Hantavirus-evolution i forhold til dens gnaver- og insektædende værter  : intet bevis for codivergens  // Molecular Biology and Evolution : magasin. - Oxford University Press , 2009. - Januar ( nr. 26 ). - S. 143-153 . - doi : 10.1093/molbev/msn234 . .
18. ↑ B. Fildis , D. Knipe. Virologi. - M . : Mir, 1989. - T. 1. - S. 272-273. — ISBN 5-03-000283-9 . .
19. ↑ Kallio ER, Voutilainen L., Vapalahti O., Vaheri A., Henttonen H., Koskela E., Mappes T. Endemisk hantavirusinfektion forringer vinteroverlevelsen af ​​dens gnavervært  //  Økologi : journal. - 2007. - August ( bind 88 , nr. 8 ). - S. 1911-1916 . - doi : 10.1890/06-1620.1 . — PMID 17824420 . . PMID 17824420 .
20. ↑ Schountz T. , Quackenbuch S. , Rovnak J. , Haddock E. , Black W. C. IV , Feldman H. , Prescott J. Differential Lymphocyte and Antibody Responses in Deer Mouse infected with Sin Nombre Hantavirus or Andes   Hantavirus // - 2014. - August ( nr. 88 ). - P. 8319-8331 .
21. ↑ Jonsson CB , Figueiredo LT , Vapalahti O. A Global Perspective on Hantavirus Ecology, Epidemiology, and Disease  //  Clinical Microbiology Reviews: tidsskrift. - 2010. - April ( nr. 23 ). - S. 412-441 . - doi : 10.1128/CMR.00062-09 . .
22. ↑ Hvordan folk får Hantavirus lungesyndrom (HPS  ) . cdc.gov. Hentet 24. november 2015. Arkiveret fra originalen 21. marts 2021.
23. ↑ Padula P. J. , Edelstein A. , Miguel S. D. , López N. M. , Rossi C. M. , Rabinovich R. D. Hantavirus pulmonal syndrom udbrud i Argentina: molekylært bevis for person-til-person transmission af Andes-virus  //  Virology: journal. - 1998. - Februar ( nr. 241 ). - S. 323-330 .
24. ↑ Toro J. , Vega J. D. , Khan A. S. , Mills J. N. , Padula P. , Terry W. , Yadón Z. , Valderrama R. , Ellis B. A. , Pavletic C. , Cerda R. , Zaki S. , Shieh W. J. , Tapia M. , Mansilla C. , Baro M. , Vergara J.A. , Concha M. , Calderon G. , Enria D. , Peters C.J. , Ksiazek T.G. An outbreak of hantavirus pulmonary syndrome, Chile, 1997  ( engelsk)  // Virology : journal. - 1998. - 10-12 ( nr. 4 ). - s. 687-694 .
25. ↑ Dekret fra Chief State Sanitary Doctor of the Russian Federation dateret 13. juni 2007 nr. 33 "Om foranstaltninger til forebyggelse af sygdomme hos mennesker med hæmoragisk feber med nyresyndrom" . Hentet 29. november 2020. Arkiveret fra originalen 24. juli 2018. (ubestemt)
26. ↑ Safronetz D. , Ebihara H. , Feldmann H. , Hooper J. W. The Syrian hamster model of hantavirus pulmonary syndrome  (engelsk)  // Antiviral Research : journal. - 2012. - September ( nr. 95 ). - S. 282-292 . doi : 10.1016 / j.antiviral.2012.06.002 . .
27. ↑ Khunafina D.Kh., Galiyeva A.T. , Burganova A.N. , Syrtlanova G.R. Hemorrhagic fever with renal syndrome  (engelsk)  // International Journal of Experimental Education: Journal. - 2010. - Nej. 12 . - S. 31-32 .
28. ↑ Maes P. , Clement J. , Van Ranst M. Nylige tilgange til udvikling af hantavirusvacciner  //  Emerging Infectious Diseases : magasin. - Centre for Disease Control and Prevention , 2009. - Januar ( nr. 8 ). - S. 67-76 . - doi : 10.1586/14760584.8.1.67 . .
29. ↑ Schmaljohn C. Vacciner mod hantavirus  //  Vaccine: Journal. - 2009. - 5. november ( nr. 27 ). - S. 61-64 . - doi : 10.1016/j.vaccine.2009.07.096 . .
30. ↑ Vacciner mod HFRS // Fremkomst og kontrol af gnaverbårne virussygdomme, Frankrig, Elsevier. 1999, 147-156.

Taksonomi	GBIF NCBI IRMNG