Fenna-Matthews-Olson kompleks

Fenna-Matthews-Olson-komplekset (FMO) er en integreret antenne af lys-høstende kompleks af grønne svovlbakterier , som medierer overførslen af ​​excitationsenergi fra chlorosomer til bakterielle reaktionscentre (RC'er) indlejret i membranen .

Studiehistorie

Pigment-proteinkomplekset blev først isoleret og beskrevet i 1962 af pionerbiokemiker John Melvin Olson (1929-2017) og hans assistent Carol Romano. Kilden til materialet var en bakteriekultur leveret af den sovjetiske mikrobiolog Elena Nikolaevna Kondratieva (1925-1995) [2] .

FMO blev det første pigment-proteinkompleks, hvis tredimensionelle struktur blev beskrevet ved røntgenspektroskopi . Komplekset blev opkaldt efter opdageren John Olson og krystallograferne Roger Fenna (f. 1947) og Brian Matthews (f. 1938) [3] .

Struktur

Det er en trimer af vandopløseligt pigment - proteinkomplekser . Hver af de tre monomerer indeholder 7 bakteriochlorophyll a -molekyler . De er forbundet gennem et proteinstillads, der danner en koordinationsbinding til det centrale magnesiumatom, enten gennem en aminosyrerest (hovedsageligt histidin ) eller via vandbroer (kun én bakteriochlorophyll på hver monomer).

Da kompleksets struktur er kendt, viste det sig at være muligt at beregne optiske spektre baseret på denne information til sammenligning med eksperimentelle data [4] [5] . I det simpleste tilfælde tages kun exciton- konjugationen af ​​bakteriochlorophyller i betragtning [6] . Mere realistiske modeller tager også højde for pigment-protein-konjugationen [7] . En vigtig egenskab er den lokale energioverførsel (positionsenergi) af bakteriochlorophyller, som er individuel for hvert pigmentmolekyle på grund af dets proteinmiljø. Det er positionsenergien af ​​bakteriochlorophyller, der bestemmer retningen af ​​energistrømmen.

Det var muligt at få nogle oplysninger om strukturen af ​​FMO-RC-superkomplekset, som blev opnået ved hjælp af elektronmikroskopi [8] [9] og lineære dikroismespektre målt på FMO-trimere og FMO-RC-komplekset. Fra disse målinger blev det klart, at to orienteringer af FMO i forhold til reaktionscentret (RC) er mulige. Orienteringen, hvor bakteriochlorophyll 3 og 4 er placeret tæt på RC, og bakteriochlorophyll 1 og 6 (efter den oprindelige nummerering af Fenna og Matthews) ser mod chlorosomer fremmer effektiv energioverførsel [10] .

Testobjekt

PMO-komplekset repræsenterer det simpleste lys-høstende kompleks kendt i naturen og er derfor et velegnet testobjekt til udvikling af metoder, der derefter kan overføres til mere komplekse systemer, såsom fotosystem I. FMO udviser overraskende lang kvantekohærens , som spiller en vigtig rolle i energioverførselsprocesser [1] .

Indsamling af lys

Lyshøst i fotosyntese bruger både klassiske og kvantemekaniske processer og har en effektivitet på næsten 100 %. I klassiske processer skal en foton for at modtage lysenergi nå reaktionscentrene, før energien spredes, det vil sige på mindre end et nanosekund. Dette sker dog ikke under fotosyntesen. Fordi energi kan eksistere i mange superpositionstilstande , kan den rejse alle ruter inden for et materiale på samme tid. Når fotonen finder den rigtige destination, kollapser superpositionen, hvilket gør energi tilgængelig. Dette er dog ikke en rent kvanteproces, da nogle kvanteprocesser bremser bevægelserne af kvantiserede objekter i et materiale. For eksempel forhindrer Anderson-lokalisering udbredelsen af ​​kvantetilstande i uordnede medier. Da en kvantetilstand opfører sig som en bølge, er den sårbar over for interferens og ydre påvirkninger. Et andet problem er kvante Zeno-effekten , hvis essens er, at en ustabil kvantetilstand aldrig ændrer sig, hvis den kontinuerligt måles/observeres, da den konstant ændrer den og forhindrer den i at kollapse [11] [12] .

Samspillet mellem kvantetilstande og miljøet fungerer som en slags måling eller observation. Den klassiske interaktion med omgivelserne ændrer kvantetilstandens bølgelignende natur i en sådan grad, at den interfererer med Andersons lokalisering, som et resultat af hvilken kvante-Zeno-effekten øger kvantetilstandens levetid, hvilket tillader den at nå reaktionscenter [11] .

Computing

Problemet med at finde et reaktionscenter i en proteinmatrix svarer formelt til mange problemer inden for computerteknologi. Kortlægning af computerproblemer til at søge efter excitationsenergien i reaktionscentret kan gøre lysindsamling til en ny type computerenhed, hvilket øger designhastigheden ved stuetemperatur og opnår 100-1000 gange effektiviteten [11] .

Noter

  1. 1 2 Tronrud, DE; Schmid, M.F.; Matthews, BW Struktur og røntgenaminosyresekvens af et bakteriochlorophyll a-protein fra Prosthecochloris aestuarii raffineret til 1,9 A opløsning  //  Journal of Molecular Biology : journal. - 1986. - April ( bd. 188 , nr. 3 ). - S. 443-454 . - doi : 10.1016/0022-2836(86)90167-1 . — PMID 3735428 .
  2. Blankenship RE, Brune DC, Olson JC Remembering John M. Olson (1929-2017) // Photosynthesis Research. - 2018. - Bd. 137. - S. 161-169. - doi : 10.1007/s11120-018-0489-9 .
  3. Fenna, RE; Matthews, BW Klorofylarrangement i et bakteriochlorophyllprotein fra Chlorobium limicola  (engelsk)  // Nature : journal. - 1975. - Bd. 258 , nr. 5536 . - S. 573-577 . - doi : 10.1038/258573a0 . — .
  4. Vulto, Simone I.E.; Neerken, Sieglinde; Louwe, Robert JW; De Baat, Michiel A.; Amesz, Jan; Aartsma, Thijs J. Excited-State Structure and Dynamics in FMO Antenne Complexes from Photosynthetic Green Sulphur Bacteria  // The  Journal of Physical Chemistry B : journal. - 1998. - Bd. 102 , nr. 51 . - S. 10630-10635 . doi : 10.1021 / jp983003v .
  5. Wendling, Markus; Przyjalgowski, Milosz A.; Gulen, Demet; Vulto, Simone I.E.; Aartsma, Thijs J.; Van Grondelle, Rienk van; Van Amerongen, Herbert van. Det kvantitative forhold mellem struktur og polariseret spektroskopi i FMO-komplekset af Prosthecochloris aestuarii : raffineringseksperimenter og simuleringer  //  Fotosynteseforskning: tidsskrift. - 2002. - Bd. 71 , nr. 1-2 . - S. 99-123 . - doi : 10.1023/A:1014947732165 . — PMID 16228505 .
  6. Pearlstein, Robert M. Teori om de optiske spektre af bakteriochlorophyll en antenneproteintrimer fra Prosthecochloris aestuarii  //  Photosynthesis Research: tidsskrift. - 1992. - Bd. 31 , nr. 3 . - S. 213-226 . - doi : 10.1007 / BF00035538 — PMID 24408061 .  (utilgængeligt link)
  7. Renger, Thomas; Marcus, R.A.Om forholdet mellem proteindynamik og excitonrelaksation i pigment-proteinkomplekser: En estimering af den spektrale tæthed og en teori til beregning af optiske spektre  //  Journal of Chemical Physics  : journal. - 2002. - Bd. 116 , nr. 22 . - S. 9997-10019 . - doi : 10.1063/1.1470200 . - .
  8. Rémigy, Hervé-W; Stahlberg, Henning; Fotiadis, Dimitrios; Müller, Shirley A; Wolpensinger, Bettina; Engel, Andreas; Hauska, Gunther; Tsiotis, Georgios. Reaktionscenterkomplekset fra den grønne svovlbakterie Chlorobium tepidum : en strukturel analyse ved scanning transmissionselektronmikroskopi  //  Journal of Molecular Biology : journal. - 1999. - Juli ( bind 290 , nr. 4 ). - s. 851-858 . - doi : 10.1006/jmbi.1999.2925 . — PMID 10398586 .
  9. Rémigy, Hervé-W.; Hauska, Gunter; Müller, Shirley A.; Tsiotis, Georgios. Reaktionscentret fra grønne svovlbakterier: fremskridt mod strukturel belysning  //  Fotosynteseforskning: tidsskrift. - 2002. - Bd. 71 , nr. 1-2 . - S. 91-8 . - doi : 10.1023/A:1014963816574 . — PMID 16228504 .
  10. Tronrud, D.E.; Schmid, M.F.; Matthews, BW Hvordan proteiner udløser excitationsenergioverførsel i FMO-komplekset af grønne svovlbakterier  // Biophysical  Journal : journal. - 2006. - Oktober ( bind 91 , nr. 8 ). - P. 2778-2797 . - doi : 10.1529/biophysj.105.079483 . - . — PMID 16861264 .
  11. 123 MIT . _ Quantum Light Harvesting Hints til en helt ny form for computing . Technologyreview.com (25. november 2013). Hentet 6. december 2013. Arkiveret fra originalen 24. september 2015.
  12. Vattay, Gabor & Kauffman, Stuart A. (2013), Evolutionary Design in Biological Quantum Computing, arΧiv : 1311.4688 [cond-mat.dis-nn].