TPSB2

TPSB2 ( eng.  Tryptase beta-2 ; CF-kode 3.4.21.59) er et enzym tryptase , et produkt af TPSB2 -genet [1] .

Struktur

Tryptase beta-2 består af 275 aminosyrer og har en molekylvægt på 30,6 kDa.

Funktioner

Tryptaser er en del af S1 -familien af ​​trypsinlignende serinproteaser . De er katalytisk aktive i den heparinstabiliserede tetramere form og er resistente over for kendte endogene proteaseinhibitorer. Adskillige tryptasegener er samlet på kromosom 16p13.3 og deler nogle fælles træk. Alle disse gener har meget konserverede 3' UTR'er og indeholder tandemgentagelser i 5'-enden, og deres 3' UTR spiller en rolle i reguleringen af ​​deres mRNA -stabilitet . Generne indeholder en intron umiddelbart efter start Met codon, som adskiller Met codon fra proteinkodende sekvens. Denne egenskab ved genstrukturen er hovedsageligt kun karakteristisk for tryptaser. TPSB2 - genet er kendetegnet ved dets mangfoldighed af alleler, de to vigtigste, beta II og beta III, blev tidligere betragtet som separate proteiner. Beta-tryptaser er de vigtigste neutrale proteaser til stede i mastceller, som udskilles fra cellen under aktiverings-degranuleringsprocessen. Kan spille en rolle i medfødt immunitet [1] .

Selvom de vigtigste fysiologiske substrater for beta-tryptaser ikke er blevet belyst, er det kendt, at disse enzymer kan spalte adskillige potentielt vigtige proteiner, herunder fibrinogen , fibronectin , matrixmetalloproteinase - precursoren pro -MMP-3 , den protease-aktiverede receptor PAR2 og komplement komponent C3 [2] .

Se også

• Tryptase

Noter

1. ↑ 1 2 Entrez-gen: tryptase beta 2 (gen/pseudogen) . (ubestemt)
2. ↑ Fukuoka Y, Schwartz LB (2007). "Aktive monomerer af human beta-tryptase har udvidede substratspecificiteter" . Int Immunopharmacol . 7 (14): 1900–8. DOI : 10.1016/j.intimp.2007.07.007 . PMC2278033  . _ PMID  18039527 .

Litteratur

• Miller JS, Moxley G, Schwartz LB (1990). "Kloning og karakterisering af et andet komplementært DNA til human tryptase" . J. Clin. Invester . 86 (3): 864-70. DOI : 10.1172/JCI114786 . PMC296804  . _ PMID2203827  . _
• Hallgren J, Lindahl S, Pejler G (2005). "Strukturelle krav og mekanisme til heparinafhængig aktivering og tetramerisering af human betaI- og betaII-tryptase". J. Mol. biol . 345 (1): 129-39. DOI : 10.1016/j.jmb.2004.10.029 . PMID  15567416 .
• Sommerhoff CP, Bode W, Matschiner G, et al. (2000). "Den menneskelige mastcelle tryptase tetramer: en fascinerende gåde løst af struktur". biochim. Biofys. Acta . 1477 (1-2): 75-89. DOI : 10.1016/s0167-4838(99)00265-4 . PMID  10708850 .
• Huang C, Li L, Krilis SA, et al. (1999). "Humane tryptaser alfa og beta/II er funktionelt forskellige på grund af til dels en enkelt aminosyreforskel i en af ​​overfladesløjferne, der danner den substratbindende spalte." J Biol. Chem . 274 (28): 19670-6. DOI : 10.1074/jbc.274.28.19670 . PMID  10391906 .
• Caughey GH, Raymond WW, Blount JL, et al. (2000). "Karakterisering af humane gamma-tryptaser, nye medlemmer af kromosom 16p mastcelle tryptase og prostasin genfamilier." J. Immunol . 164 (12): 6566-75. DOI : 10.4049/jimmunol.164.12.6566 . PMID  10843716 .
• Vanderslice P, Ballinger SM, Tam EK, et al. (1990). "Human mastcelle tryptase: flere cDNA'er og gener afslører en multigen serinproteasefamilie" . Proc. Natl. Acad. sci. USA . 87 (10): 3811-5. DOI : 10.1073/pnas.87.10.3811 . PMC  53993 . PMID2187193  . _
• Guida M, Riedy M, Lee D, Hall J (2000). "Karakterisering af to meget polymorfe human tryptase loci og sammenligning med en nyopdaget abe tryptase ortolog." Farmakogenetik . 10 (5): 389-96. DOI : 10.1097/00008571-200007000-00002 . PMID  10898108 .
• Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "Status, kvalitet og udvidelse af NIH's fuldlængde cDNA-projekt: Mammalian Gene Collection (MGC)" . Genome Res . 14 (10B): 2121-7. DOI : 10.1101/gr.2596504 . PMC  528928 . PMID  15489334 .
• Blom T, Hellman L (1993). "Karakterisering af et tryptase-mRNA udtrykt i den humane basofile cellelinje KU812" . Scand. J. Immunol . 37 (2): 203-8. DOI : 10.1111/j.1365-3083.1993.tb01757.x . PMID  8434231 .
• Pallaoro M, Fejzo MS, Shayesteh L, et al. (1999). "Karakterisering af gener, der koder for kendte og nye humane mastcelletryptaser på kromosom 16p13.3". J Biol. Chem . 274 (6): 3355-62. DOI : 10.1074/jbc.274.6.3355 . PMID  9920877 .
• Caughey G.H. (2002). "Ny udvikling inden for genetik og aktivering af mastcelleproteaser". Mol. Immunol . 38 (16-18): 1353-7. DOI : 10.1016/S0161-5890(02)00087-1 . PMID  12217407 .
• Akin C, Soto D, Brittain E, et al. (2007). "Tryptasehaplotype i mastocytose: forhold til sygdomsvariant og diagnostisk nytte af totale tryptaseniveauer" . Clin. Immunol . 123 (3): 268-71. DOI : 10.1016/j.clim.2007.02.007 . PMC  1949411 . PMID  17449330 .
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2002). "Generering og indledende analyse af mere end 15.000 fuldlængde humane og muse cDNA-sekvenser" . Proc. Natl. Acad. sci. USA . 99 (26): 16899-903. DOI : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241 . PMID  12477932 .
• Sommerhoff CP, Bode W, Pereira PJ, et al. (1999). "Strukturen af ​​den humane betaII-tryptase tetramer: fo(u)r bedre eller værre" . Proc. Natl. Acad. sci. USA . 96 (20): 10984-91. DOI : 10.1073/pnas.96.20.10984 . PMC  34230 . PMID  10500112 .
• Daniels RJ, Peden JF, Lloyd C, et al. (2001). "Sekvens, struktur og patologi af de fuldt kommenterede terminale 2 Mb af den korte arm af humant kromosom 16". Hum. Mol. Genet . 10 (4): 339-52. DOI : 10.1093/hmg/10.4.339 . PMID  11157797 .
• Trivedi NN, Tamraz B, Chu C, et al. (2009). "Menneske forsøgspersoner er beskyttet mod mastcelletryptase-mangel på trods af hyppig nedarvning af funktionstabsmutationer . " J. Allergy Clin. Immunol . 124 (5): 1099-1105.e4. DOI : 10.1016/j.jaci.2009.07.026 . PMC2783561  . _ PMID  19748655 .
• Pereira PJ, Bergner A, Macedo-Ribeiro S, et al. (1998). "Human beta-tryptase er en ringlignende tetramer med aktive steder vendt mod en central pore." natur . 392 (6673): 306-11. DOI : 10.1038/32703 . PMID  9521329 .
• Wu C, Ma MH, Brown KR, et al. (2007). "Systematisk identifikation af SH3-domænemedierede humane protein-protein-interaktioner ved peptidarray-målscreening". Proteomik . 7 (11): 1775-85. DOI : 10.1002/pmic.200601006 . PMID  17474147 .