Ikke-strukturelt protein 5A , forkortet til NS5A , er et zinkbindende prolin-rigt hydrofilt phosphoprotein, der spiller en nøglerolle i hepatitis C-virus (HCV) RNA- replikation [1] [2] . Det er en dimer uden transmembrane helixer [3] .
Hepatitis C virus (HCV) RNA-genomet koder for et ~3000 aminosyre polypeptid, der bearbejdes af både virale og cellulære proteaser til strukturelle proteiner (Core, E1 og E2), ionkanal (p7) og ikke-strukturelle proteiner (NS2, NS3) , NS4A, NS4B, NS5A og NS5B) [4] . Ikke-strukturelle proteiner er ansvarlige for replikationen af det virale genom og for samlingen af den virale partikel fra strukturelle proteiner ved hjælp af værtsfaktorer . HCV NS5A er et peptid med 447 aminosyrerester, der består af tre domæner forbundet med korte fragmenter, kaldet lavkompleksitetssekvenser (LCS) [5] .
NS5A er dannet af et komplekst protein, der er et resultat af translationen af HCV-genomet, hvorefter det undergår post-translationel modifikation af den virale protease NS3 [6] . På trods af manglen på direkte enzymatisk aktivitet i dette protein, udføres dets funktion gennem interaktion med andre ikke-strukturelle (NS) virale og cellulære proteiner [2] [6] . NS5A har to phosphorylerede former, p56 og p58 , som adskiller sig i elektroforetisk mobilitet [3] . p56 phosphoryleres af værtscelleproteinkinase i midten og nær C-terminalen , og p58 er hyperphosphoryleret i midten af den serinrige region [3] . De 30 aminosyrerester ved N-terminalen danner en konserveret amfipatisk alfa-helix , som er essentiel for bindingen af dette protein til det endoplasmatiske retikulum [3] [6] . Den IFN-følsomhedsbestemmende region placeret ved C-terminalen har en stærk transaktiveringsaktivitet, hvilket indikerer virkningen af NS5A som en transkriptionel aktivator [3] .
NS5A har tre strukturelt adskilte domæner . Krystallografi har vist, at domæne I er en alternativ dimer struktur, mens domæne II og III forbliver udfoldede [1] . Derudover spiller den konformationelle fleksibilitet af NS5A en vigtig rolle i forskellige stadier af HCV-infektion [1] . Det er også muligt, at NS5A er en kritisk komponent i processen med HCV-replikation og subcellulær lokalisering, hvilket kan kaste lys over den dårligt forståede HCV-livscyklus [1] [6] . Derudover modulerer NS5A polymeraseaktiviteten af NS5B , en RNA-afhængig RNA-polymerase [3] . NS5A er i stand til at binde den 3'-utranslaterede region af plus- og minusstrengene af det virale RNA [3] .
NS5A er en nøglemediator i reguleringen af værtscellefunktion og aktivitet [6] og regulerer også interferonresponset . Af denne grund bliver dette protein aktivt undersøgt som et mål for antivirale lægemidler til behandling af hepatitis C [1] [6] . Lægemidler med små molekyler rettet mod dette protein viser bedre resultater end andre lægemidler [1] .