Menneskelig coronavirus OC43

Menneskelig coronavirus OC43
videnskabelig klassifikation
Gruppe:Virus [1]Rige:RiboviriaKongerige:OrthornaviraeType:PisuviricotaKlasse:PisoniviricetesBestille:NidoviralesUnderrækkefølge:CornidovirineaeFamilie:CoronavirusserUnderfamilie:CoronavirusserSlægt:betacoronavirusUnderslægt:EmbecovirusUdsigt:Betacoronavirus 1Ingen rang:Menneskelig coronavirus OC43
Internationalt videnskabeligt navn
menneskelig coronavirus OC43
Synonymer
  • HCoV-OC43
Baltimore-gruppen
IV: (+)ssRNA-vira

Human coronavirus OC43 [2] ( Eng.  Human coronavirus OC43 ) er en virus fra coronavirus familien , en repræsentant for arten Betacoronavirus 1 , smitsom for mennesker og kvæg [3] [4] . En indhyllet (+) enkeltstrenget RNA-virus , der trænger ind i cellen ved at binde sig til N-acetyl-9-O-acetylneuraminsyre-receptoren [5] . Den har, ligesom andre coronavirusser fra underslægten Embecovirus , et kort spidsprotein, den såkaldte hæmagglutininesterase (HE) [6] [3] .

OC43 er en af ​​syv kendte coronavirus, der inficerer mennesker og er ansvarlig for cirka 10-15% af SARS- tilfældene [7] [8] . Forskere antyder, at alle fire forkølelsesfremkaldende coronavirus har krydset over for at inficere mennesker i løbet af de sidste par århundreder, og derved sandsynligvis forårsaget pandemier på overgangstidspunktet [9] .

Virologi

Fire HCoV-OC43- genotyper (A til D) er blevet identificeret, hvor D-genotypen højst sandsynligt er et resultat af genetisk rekombination . Helgenomsekventering af to stammer af genotype C og D og bootscan-analyse viser tegn på rekombination mellem genotype B og C til dannelse af genotype D. Af de 29 identificerede stammer tilhører ingen den ældre genotype A. Spike- og nucleocapsid molekylær clock -metoden tildeler den nærmeste en fælles forfader af alle genotyper i 1950'erne, genotype B i 1990'erne og genotype C i slutningen af ​​1990'erne og begyndelsen af ​​2000'erne. Rekombinante stammer af genotype D blev opdaget allerede i 2004 [7] .

Sammenligning af HCoV-OC43 med dens nærmeste stamme af Betacoronavirus 1- arten , Bovin coronavirus , viste, at de havde den nærmeste fælles forfader i slutningen af ​​det 19. århundrede, med adskillige metoder, der daterede adskillelsen til omkring 1890, hvilket fik forskere til at spekulere i, at indtræden af ​​den første stamme i den menneskelige befolkning forårsagede influenzapandemien 1889-1890 [10] [9] . HCoV-OC43 stammer sandsynligvis fra gnavere [11] .

Patogenese

Sammen med HCoV-229E , en art i slægten Alphacoronavirus , er HCoV-OC43 blandt de kendte vira, der forårsager almindelig forkølelse . Begge vira kan forårsage alvorlige nedre luftvejsinfektioner, herunder lungebetændelse hos spædbørn, ældre og dem, der er immunkompromitterede, såsom dem, der gennemgår kemoterapi, og personer med HIV/AIDS [12] [13] [14] .

Epidemiologi

Coronaviruss er allestedsnærværende på verdensplan og forårsager op til 20-30% af forkølelser [9] (den mest almindelige forkølelsesfremkaldende virus er rhinovirus , der findes i 30-50% af tilfældene). Infektioner er sæsonbestemte , hvor de fleste tilfælde forekommer i vintermånederne [15] [16] [17] .

Virussens rutinemæssige karakter tiltrak ikke forskeres opmærksomhed i lang tid: ligesom 229E var det en "forældreløs virus", der i modsætning til SARS og MERS ikke engang havde et "indviklet" navn. Imidlertid kan antagelser om dens forbindelse med den russiske influenza-pandemi i 1889-1890 - baseret på ovenstående undersøgelse af genomet og ligheden mellem symptomer på skader på nervesystemet  - indikere en betydelig og relativt hurtig svækkelse af patogeniciteten af ​​coronavirus. Hvis Covid-19 følger samme bane, vil det med tiden blive til endnu en forkølelsesvirus [9] .

Noter

  1. ↑ Taxonomy of Viruses  på webstedet International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) .
  2. ↑ Popov N. N., Kolotova T. Yu. Molekylær udvikling af særligt farlige nye virale infektioner Arkivkopi af 4. december 2021 på Wayback Machine // Annals of the Mechnikov Institute. - 2016. - Nr. 1. - S. 38-47 [38].
  3. ↑ 1 2 Taksonomibrowser (Betacoronavirus 1) . www.ncbi.nlm.nih.gov . Hentet 29. februar 2020. Arkiveret fra originalen 5. november 2020.
  4. ↑ Lim, Yvonne Xinyi (2016-07-25). "Humane Coronaviruses: En gennemgang af virus-vært-interaktioner." sygdomme . 4 (3):26 . doi : 10.3390/sygdomme4030026 . PMID  28933406 . Se tabel 1.
  5. ↑ Li, Fang (29-09-2016). "Struktur, funktion og udvikling af Coronavirus Spike Proteiner." Årlig gennemgang af virologi . 3 (1): 237-261. DOI : 10.1146/annurev-virology-110615-042301 . PMID27578435  . _ BCoV S1-NTD genkender ikke galactose, som galectiner gør. I stedet genkender den 5-N-acetyl-9-O-acetylneuraminsyre (Neu5,9Ac2) (30, 43). Den samme sukkerreceptor genkendes også af humant coronavirus OC43 (43, 99). OC43 og BCoV er tæt beslægtede genetisk, og OC43 kan være et resultat af zoonotisk afsmitning af BCoV (100, 101).
  6. ↑ Woo, Patrick CY (2010-08-24). "Coronavirus genomik og bioinformatik analyse". Virus . 2 (8): 1804-1820. DOI : 10.3390/v2081803 . PMID21994708  . _ I alle medlemmer af Betacoronavirus undergruppe A er et hæmagglutinin esterase (HE) gen, som koder for et glycoprotein med neuraminat O-acetyl-esterase aktivitet og det aktive sted FGDS, til stede nedstrøms for ORF1ab og opstrøms for S gen (figur 1).
  7. ↑ 1 2 Lau, Susanna KP (2011). "Molekylær epidemiologi af menneskelig Coronavirus OC43 afslører udvikling af forskellige genotyper over tid og nylig fremkomst af en ny genotype på grund af naturlig rekombination" . Journal of Virology . 85 (21): 11325-11337. DOI : 10.1128/JVI.05512-11 . PMID21849456  . _
  8. ↑ Gaunt, ER (2010). "Epidemiologi og kliniske præsentationer af de fire humane coronavirusser 229E, HKU1, NL63 og OC43 detekteret over 3 år ved hjælp af en ny multiplex real-time PCR-metode . " J Clinic Microbiol . 48 (8): 2940-2947. DOI : 10.1128/JCM.00636-10 . PMID20554810  . _
  9. ↑ 1 2 3 4 King A. En ualmindelig forkølelse Arkiveret 7. januar 2021 på Wayback Machine // New Sci. 2020;246(3280):32-35. doi : 10.1016/S0262-4079(20)30862-9
  10. ↑ Vijgen, Leen (2005). "Fuldstændig genomisk sekvens af Human Coronavirus OC43: Molekylær uranalyse tyder på en relativt nylig zoonotisk Coronavirus-transmissionsbegivenhed" . Journal of Virology . 79 (3): 1595-1604. DOI : 10.1128/JVI.79.3.1595-1604.2005 . PMID  15650185 .
  11. ↑ Fung, To Sing (2019). "Human Coronavirus: Vært-patogen interaktion". Årlig gennemgang af mikrobiologi . 73 : 529-557. DOI : 10.1146/annurev-micro-020518-115759 . PMID  31226023 .
  12. ↑ Wevers, Brigitte A. (2009). "For nylig opdagede menneskelige coronavirusser". Klinikker i laboratoriemedicin . 29 (4): 715-724. DOI : 10.1016/j.cll.2009.07.007 . PMID  19892230 .
  13. ↑ Manual of Clinical Microbiology. - American Society for Microbiology, 2007. - ISBN 978-1-55581-371-0 .
  14. ↑ Pyrc, K. (2007). "Antivirale strategier mod menneskelige Coronaviruss". Infektiøse lidelser Drug Targets . 7 (1): 59-66. DOI : 10.2174/187152607780090757 . PMID  17346212 .
  15. ↑ Van Der Hoek, L (2007). "Menneskelige coronavirus: Hvad forårsager de?" . Antiviral terapi . 12 (4 Pt B): 651-658. PMID  17944272 . Arkiveret fra originalen 2022-01-28 . Hentet 2020-08-09 . Forældet parameter brugt |deadlink=( hjælp )
  16. ↑ Wat, Dennis (2004). "Forkølelsen: En gennemgang af litteraturen". European Journal of Internal Medicine . 15 (2): 79-88. DOI : 10.1016/j.ejim.2004.01.006 . PMID  15172021 .
  17. ↑ Kissler, Stephen M. (14. april 2020). "Projektering af transmissionsdynamikken i SARS-CoV-2 gennem den postpandemiske periode". Videnskab : eabb5793. doi : 10.1126/science.abb5793 . PMID  32291278 .