Deinococcus-Thermus

Den aktuelle version af siden er endnu ikke blevet gennemgået af erfarne bidragydere og kan afvige væsentligt fra den version , der blev gennemgået den 7. maj 2022; checks kræver 2 redigeringer .
Deinococcus-Thermus

Deinococcus radiodurans , et medlem af ordenen Deinococcales
videnskabelig klassifikation
Domæne:bakterieType:Deinococcus-Thermus
Internationalt videnskabeligt navn
Deinococcus-Thermus
Synonymer
  • Deinococcaeota Oren et al. 2015 [1]
Datter taxa
  • Deinokokker klasse
    • Bestil Deinococcales
    • Orden af ​​termik

Deinococcus-Thermus  (lat.)  - en lille opdeling af bakterier , hvoraf den eneste klasse , Deinococci , omfatter to ordener : Deinococcales , som omfatter en af ​​de mest radioresistente organismer i verden , Deinococcus radiodurans og Thermales , som omfatter Thermus aquaticus , kendt for sin Taq polymerase , der anvendes i PCR , og andre termostabile enzymer .

Afdelingen fik navn efter typeslægterne Deinococcus og Thermus [2] .

Cavalier- Smith kalder denne afdeling for Hadobacteria Cavalier-Smith 2002 (fra ordet Hades  - den græske underverden) [3] .

Beskrivelse

Alle repræsentanter for Deinococcus-Thermus afdelingen har en cellevæg, der er karakteristisk for alle gram-negative bakterier (selvom repræsentanter for slægten Deinococcus farver positivt efter Gram-metoden ) [4] . Medlemmer af ordenen Deinococcales mangler lipopolysaccharider i deres ydre membran ; de ophober carotenoider , som giver cellerne deres røde farve. Genomet er repræsenteret af to multikopi - kromosomer . Shelled Thermales har et S-lag og akkumulerer også carotenoider, hvorfor deres celler ofte er røde eller gule [5] .

Repræsentanter for phylum Deinococcus-Thermus er aerober og kemoorganoheterotrofer , der findes overalt (repræsentanter for Thermales -ordenen findes i varme kilder). Fylogenetisk analyse har vist, at Deinococcus-Thermus- delingen er en af ​​de mest arkaiske bakteriegrupper [6] .

Grundlaget for skabelsen af ​​taxonet var nærheden af ​​16S rRNA-gensekvenserne [ 7] , desuden viser en sammenligning af genomerne fra Deinococcus radiodurans og Thermus aquaticus også et vist niveau af homologi . Tilsyneladende gik begge grupper af bakterier i løbet af evolutionen ad samme vej til at opnå modstandsdygtighed over for høje temperaturer [8] [9] . Det skal dog bemærkes , at medlemmer af Thermus- slægten i modsætning til Deinococcus ikke har øget modstandsdygtighed over for stråling [5] . Mest sandsynligt skyldes Thermales ' termofilicitet specifikke former for DNA - afhængig RNA-polymerase og DNA-topoisomerase I [10] , mens radioresistensen af ​​Deinococcus skyldes specifikke former for excinuclease ABC, DNA-gyrase og RadA-proteinet involveret i reparations-DNA [11] .

Fylogeni

Det fylogenetiske træ af Deinococcus-Thermus phylum , rekonstrueret baseret på 16S rRNA-sekvenserne , er som følger [12] .

Noter

  1. ↑ Deinococcus-Thermus  på webstedet National Center for Biotechnology Information (NCBI)  . (Få adgang: 13. december 2018) .
  2. ↑ Pinevich, 2006 , s. 100.
  3. ↑ Cavalier-Smith T. Rooting the tree of life ved overgangsanalyser.  (engelsk)  // Biology direct. - 2006. - Bd. 1. - S. 19. - doi : 10.1186/1745-6150-1-19 . — PMID 16834776 .
  4. ↑ Battista JR Mod alle odds: Deinococcus radiodurans' overlevelsesstrategier.  (engelsk)  // Årlig gennemgang af mikrobiologi. - 1997. - Bd. 51 . - S. 203-224 . - doi : 10.1146/annurev.micro.51.1.203 . — PMID 9343349 .
  5. ↑ 1 2 Pinevich, 2006 , s. 101.
  6. ↑ Pinevich, 2006 , s. 100-101.
  7. ↑ Weisburg WG , Giovannoni SJ , Woese CR Deinococcus-Thermus phylum og virkningen af ​​rRNA-sammensætning på fylogenetisk trækonstruktion.  (engelsk)  // Systematisk og anvendt mikrobiologi. - 1989. - Bd. 11 . - S. 128-134 . — PMID 11542160 .
  8. ↑ Omelchenko MV , Wolf YI , Gaidamakova EK , Matrosova VY , Vasilenko A. , Zhai M. , Daly MJ , Koonin EV , Makarova KS Komparativ genomik af Thermus thermophilus og Deinococcus radiodurans: divergerende ruter for strålingsresistens og strålingsresistens til termofi.  (engelsk)  // BMC evolutionær biologi. - 2005. - Bd. 5. - S. 57. - doi : 10.1186/1471-2148-5-57 . — PMID 16242020 .
  9. ↑ Makarova KS , Aravind L. , Wolf YI , Tatusov RL , Minton KW , Koonin EV , Daly MJ Genomet af den ekstremt strålingsresistente bakterie Deinococcus radiodurans set fra perspektivet af sammenlignende genomik.  (engelsk)  // Mikrobiologi og molekylærbiologi anmeldelser: MMBR. - 2001. - Bd. 65, nr. 1 . - S. 44-79. - doi : 10.1128/MMBR.65.1.44-79.2001 . — PMID 11238985 .
  10. ↑ Zhang G. , Campbell EA , Minakhin L. , Richter C. , Severinov K. , Darst SA Krystalstruktur af Thermus aquaticus kerne-RNA-polymerase ved 3,3 A opløsning.  (engelsk)  // Cell. - 1999. - 17. september ( bd. 98 , nr. 6 ). - s. 811-824 . — PMID 10499798 .
  11. ↑ Tanaka M. , Earl AM , Howell HA , Park MJ , Eisen JA , Peterson SN , Battista JR Analyse af Deinococcus radiodurans's transkriptionelle respons på ioniserende stråling og udtørring afslører nye proteiner, der bidrager til ekstrem radioresistens.  (engelsk)  // Genetik. - 2004. - September ( bind 168 , nr. 1 ). - S. 21-33 . - doi : 10.1534/genetics.104.029249 . — PMID 15454524 .
  12. ↑ 16S rRNA-baseret LTP-frigivelse 123 (fuldt træ) . Silva Comprehensive Ribosomal RNA Database. Hentet 20. marts 2016. Arkiveret fra originalen 16. september 2016.

Litteratur

  Gå til Wikidata-elementet  Ordbøger og encyklopædier
Taksonomi