BioBrick

Den aktuelle version af siden er endnu ikke blevet gennemgået af erfarne bidragydere og kan afvige væsentligt fra den version , der blev gennemgået den 3. februar 2019; checks kræver 8 redigeringer .

BioBrick  (BioBlock) - DNA-sekvenser beregnet til samling ved restriktionsligeringsmetoden, som bruges til at udvikle og skabe kunstige biologiske systemer med visse egenskaber [1] [2] . Siden 2008 er det blevet anerkendt som den førende standard for syntetisk biologi [2] . Når først den er udviklet på en computer, sprøjtes koden typisk ind i levende celler, såsom Escherichia coli , for at give dem nye funktioner.

Hierarki af standarden

Standarden har et tre-niveau hierarkisk system, som syntetisk biologi er baseret på :

  1. Dele: DNA-sekvens, der danner en funktionel enhed (fx promotorer , ribosombindingssteder , kodende sekvenser, terminatorsekvenser osv.)
  2. Enheder: et sæt af indbyrdes forbundne komplementære dele, der har en given funktion;
  3. Systemer: et sæt enheder, der udfører opgaver på højt niveau;

Fordele ved standarden

Standarden blev udviklet på MIT for at anvende tekniske principper for abstraktion og modularitet til programmering af biologiske systemer og levende organismer. Fordele ved Biobricks standardiserede tilgang :

Historien om BioBrick

2003

BioBrick - standarden blev beskrevet og præsenteret af Tom Knight ved MIT. Siden da er forskellige forskergrupper begyndt at bruge BioBrick til at skabe nye biologiske enheder og systemer.

2006

I 2006 blev non-profit organisationen BioBricks Foundation grundlagt af ingeniører og videnskabsmænd med det formål at standardisere biologiske dele inden for dette videnskabsområde. [3]

2008

Siden starten af ​​projektet er mere end 2.000 BioBricks blevet frigivet til offentligheden og er tilgængelige i Registry of Standard Biological Parts. BioBrick er anerkendt som den førende standard inden for syntetisk biologi [2]

2015

5018 deltagere (280 hold) fra 38 lande deltog i iGEM 2015- konkurrencer [1]

2017

5400 deltagere (310 hold) deltog i iGEM 2017 konkurrencer.

2018

BioBrick Parts Catalog havde allerede over 20.000 dokumenterede genetiske dele. Disse dele er tilgængelige til gratis brug af iGEM-hold og akademiske laboratorier [2] .

Alternative standarder

Det første forsøg på at lave en liste over standardiserede biologiske dele af NOMAD blev lavet i 1996 af en gruppe videnskabsmænd ledet af D. Rebatchuk. Hans team præsenterede en kloningsstrategi for samling af korte DNA-fragmenter. Men dette tidlige forsøg blev ikke bredt vedtaget. [fire]

Noter

  1. ↑ Tom Knight (2003). Idempotent vektordesign til standardsamling af biobricks . Hentet 26. september 2014. Arkiveret fra originalen 6. oktober 2014.
  2. ↑ 1 2 3 Ridder, Thomas F; Reshma P Shetty; Drew Andy. Engineering BioBrick vektorer fra BioBrick dele  (neopr.)  // Journal of Biological Engineering. - 2008. - 14. april ( bind 2 , nr. 5 ). - S. 1-12 . - doi : 10.1186/1754-1611-2-5 . — PMID 18410688 . Arkiveret fra originalen den 28. september 2015.
  3. ↑ BioBricks Foundation . BioBricks Foundation . Hentet 19. marts 2018. Arkiveret fra originalen 12. marts 2018.
  4. ↑ Rebatchouk, Dmitri; Daraselia, N.; Narita, JO NOMAD: en alsidig strategi for in vitro DNA-manipulation anvendt til promotoranalyse og vektordesign.  (engelsk)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal. - 1996. - 1. oktober ( bind 93 , nr. 20 ). - P. 10891-10896 . - doi : 10.1073/pnas.93.20.10891 . Arkiveret fra originalen den 24. september 2015.
 Bioteknik
Områder inden for bioteknik
Relaterede artikler
Videnskabsmænd
Popularisatorer