B3GAT2

Tilgængelige strukturer

Ortholog søgning: PDBe RCSB

Liste over PDB-id'er
2D0J

Identifikatorer

Symboler

B3GAT2 , GLCATS, beta-1,3-glucuronyltransferase 2

Eksterne ID'er

OMIM: 607497 MGI: 2389490 HomoloGene: 50574 GeneCards: 135152

Beslægtede arvelige sygdomme

Sygdommens navn

Links

fedme


[en]

Gen-ontologi
Funktioner	• transferaseaktivitet • metalionbinding • galactosylgalactosylxylosylprotein 3-beta-glucuronosyltransferaseaktivitet
celle komponent	• del af membranen • Golgi-apparat • membran • Golgi-membran
biologisk proces	• glycosaminoglycan metabolisk proces • GO:0033578, GO:0033577, GO:0033575, GO:0033576 proteinglycosylering • chondroitinsulfat proteoglycan biosynteseproces • chondroitinsulfat metabolisme • Carbohydratmetabolisme
Kilder: Amigo / QuickGO

ortologer

Slags

Human

Mus

Entrez


135152


280645

Ensemble


ENSG00000112309


ENSMUSG00000026156

UniProt


Q9NPZ5


P59270

RefSeq (mRNA)


NM_080742


NM_172124

RefSeq (protein)


NP_542780


NP_742122

Locus (UCSC)

Chr 6: 70,86 – 70,96 Mb

Chr 1: 23,8 – 23,89 Mb

PubMed- søgning

[2]

[3]

Rediger (menneske)

Rediger (mus)

Galactosylgalactosylxylosylprotein 3-beta-glucuronosyltransferase type 2 ( Galactosylgalactosylxylosylprotein 3-beta-glucuronosyltransferase 2 ; B3GAT2) er et enzym fra glucuronosyltransferase -familien , et produkt af det humane gen B3G2 ] [1] [ . Involveret i proteinglykosylering.

Enzymatisk aktivitet og funktioner

B3GAT2 er en del af glucuronosyltransferase -familien . Katalyserer overførslen af beta-1,3-bundet glucuronsyre til den terminale galactose af forskellige glycoproteiner og glycolipider indeholdende Gal-beta-1-4GlcNAc- eller Gal-beta-1-3GlcNAc-rester. Deltager i syntesen af kulhydratepitopen HNK-1 (human natural killer-1), et sulfateret trisaccharid, der spiller en rolle i cellemigration og adhæsion i nervesystemet [2] .

Vævslokalisering

Proteinet kommer til udtryk i luftrøret, nethinden, rygmarven, hippocampus og andre områder af hjernen og i mindre grad i testiklerne og æggestokkene.

I undersøgelsen

Antistoffer mod HNK-1-epitopen er med succes blevet brugt i neurale kamstudier , især i fugleembryoner [3] [4] . Dette gjorde det muligt at analysere de signalveje, der spiller en rolle i cellemigration.

Struktur

B3GAT2 -genproduktet består af 323 aminosyrer og har en molekylvægt på 36,9 kDa. Det aktive websted indeholder Mn 2+ .

Noter

↑ Imiya K., Ishizaki T., Seiki T., Saito F., Inazawa J., Oka S., Kawasaki T. cDNA-kloning, genomisk struktur og kromosomal kortlægning af museglukuronyltransferase-S involveret i biosyntesen af HNK- 1 kulhydratepitop // Gen : journal. - Elsevier , 2002. - Oktober ( vol. 296 , nr. 1-2 ). - S. 29-36 . - doi : 10.1016/S0378-1119(02)00840-5 . — PMID 12383500 .
↑ 1 2 Entrez-gen: B3GAT2 beta-1,3-glucuronyltransferase 2 (glucuronosyltransferase S) . (ubestemt)
↑ Bronner-Fraser M. Analyse af de tidlige stadier af trunk neural crest migration i fugleembryoner ved hjælp af monoklonalt antistof HNK-1 // Dev . Biol. : journal. - 1986. - Maj ( bind 115 , nr. 1 ). - S. 44-55 . - doi : 10.1016/0012-1606(86)90226-5 . — PMID 3516760 .
↑ Vincent M., Thiery JP En celleoverflademarkør for neurale kam og placodale celler: yderligere udvikling i perifert og centralnervesystem // Dev . Biol. : journal. - 1984. - Juni ( bind 103 , nr. 2 ). - S. 468-481 . - doi : 10.1016/0012-1606(84)90334-8 . — PMID 6202575 .

Litteratur

Nagase T., Kikuno R., Ohara O. Forudsigelse af de kodende sekvenser af uidentificerede humane gener. XXII. De komplette sekvenser af 50 nye cDNA-kloner, som koder for store proteiner. (engelsk) // DNA Res. : journal. - 2002. - Bd. 8 , nr. 6 . - s. 319-327 . - doi : 10.1093/dnares/8.6.319 . — PMID 11853319 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH et al. Generering og indledende analyse af mere end 15.000 fuldlængde humane og muse cDNA-sekvenser. (engelsk) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 2003. - Bd. 99 , nr. 26 . - P. 16899-16903 . - doi : 10.1073/pnas.242603899 . — PMID 12477932 .
Marcos I., Galán JJ, Borrego S., Antiñolo G. Kloning, karakterisering og kromosomkortlægning af det humane GlcAT-S-gen. (engelsk) // J. Hum. Genet. : journal. - 2003. - Bd. 47 , nr. 12 . - S. 677-680 . - doi : 10.1007/s100380200103 . — PMID 12522689 .
Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK et al. DNA-sekvensen og analysen af humant kromosom 6. (engelsk) // Nature : journal. - 2003. - Bd. 425 , nr. 6960 . - s. 805-811 . - doi : 10.1038/nature02055 . — PMID 14574404 .
Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T. et al. Fuldstændig sekventering og karakterisering af 21.243 fuldlængde humane cDNA'er. (engelsk) // Nat. Genet. : journal. - 2004. - Bd. 36 , nr. 1 . - S. 40-5 . - doi : 10.1038/ng1285 . — PMID 14702039 .
Kakuda S., Oka S., Kawasaki T. Oprensning og karakterisering af to rekombinante humane glucuronyltransferaser involveret i biosyntesen af HNK-1-kulhydrat i Escherichia coli. (engelsk) // Protein Expr. Purif. : journal. - 2004. - Bd. 35 , nr. 1 . - S. 111-119 . - doi : 10.1016/j.pep.2003.12.021 . — PMID 15039073 .
Kakuda S., Sato Y., Tonoyama Y. et al. Forskellige acceptorspecificiteter af to glucuronyltransferaser involveret i biosyntesen af HNK-1-kulhydrat. (engelsk) // Glycobiology : journal. - 2005. - Bd. 15 , nr. 2 . - S. 203-210 . - doi : 10.1093/glycob/cwi001 . — PMID 15470230 .
Kimura K., Wakamatsu A., Suzuki Y. et al. Diversificering af transkriptionel modulering: storstilet identifikation og karakterisering af formodede alternative promotorer af menneskelige gener. (engelsk) // Genome Res. : journal. - 2006. - Bd. 16 , nr. 1 . - S. 55-65 . - doi : 10.1101/gr.4039406 . — PMID 16344560 .
Shiba T., Kakuda S., Ishiguro M. et al. Krystalstruktur af GlcAT-S, en human glucuronyltransferase, involveret i biosyntesen af HNK-1-kulhydratepitopen. (engelsk) // Proteins: journal. - 2006. - Bd. 65 , nr. 2 . - S. 499-508 . - doi : 10.1002/prot.21118 . — PMID 16897771 .

Membranproteiner