ER

AU-rige elementer (ARE'er ) er  regulatoriske motiver placeret i 3'-UTR af mRNA fra nogle gener og spiller en nøglerolle i stabiliseringen af ​​transkripterne af disse gener. Disse elementer varierer i størrelse fra 50 til 150 nukleotider og indeholder sædvanligvis talrige kopier af AUUUA-pentanukleotidet [1] .

Fungerer

Det blev fundet, at sekvenserne af ARE'er adskiller sig, og 3 klasser af ARE'er er kendetegnet ved antallet og arrangementet af AUUUA-motiver:

ARE'er binder til proteiner ( ARE  -bindende proteiner, ARE-BP'er ), som som regel bidrager til ødelæggelsen af ​​mRNA som reaktion på forskellige intra- og ekstracellulære signaler, selvom nogle af dem regulerer translation . Derudover er HuD proteinet kendt for at binde til ARE'er og øge halveringstiden af ​​dette mRNA i neuroner under hjernens udvikling [2] . Nogle af de faktorer, der påvirker ødelæggelsen af ​​mRNA af ARE'er, er tilstedeværelsen af ​​phorbolestere , calciumionoforer , cytokiner , transkriptionshæmmere [3] . ARE'er regulerer ekspressionen af ​​gener, der koder for cytokiner , vækstfaktorer , tumorsuppressorgener , proto-onkogener og gener, hvis proteinprodukter er involveret i cellecyklusregulering , såsom gener for cycliner , enzymer , transkriptionsfaktorer , receptorer og membranproteiner . Denne mangfoldighed af gener, hvis transkripter indeholder ARE'er, indikerer vigtigheden af ​​transkriptstabilitet i genregulering [1] .

Mange ARE-BP'er udtrykkes på en celle- og vævsspecifik måde, og den sekundære struktur af ARE er en vigtig faktor for deres aktivitet . Forskellige ARE-BP'er kan konkurrere om det samme bindingssted, og effekten af ​​en ARE på et transkript kan være forskellig på grund af dets cellulære lokalisering, miljøfaktorer og tidspunkt. For eksempel reducerer klasse III ARE'er lokaliseret i 3'-UTR af c-jun mRNA stabiliteten af ​​transkriptet, men de deltager ikke desto mindre i en stigning i mængden af ​​dannet protein. Dette virker modstridende, men det er sandsynligt, at hver mekanisme bruges på forskellige tidspunkter og til forskellige behov, for eksempel afhængigt af vævstype og udviklingsstadie . ARE-binding til proteiner er også påvirket af miljøfaktorer, og transskriptionsstabilitet spiller en vigtig rolle som reaktion på stressende tilstande såsom varmechok eller ernæringsmangler . Sådanne stimuli udløser en signaleringskaskade, der ændrer antallet af forskellige ARE-BP'er og på samme tid påvirker RNA 's evne til at binde til proteiner. Således øges ekspressionen af ​​det anti - apoptotiske gen Bcl- XL på grund af stabiliseringen af ​​transkripter på grund af eksponering for UV-stråling ; denne proces ses ved hudkræft og andre kræftformer . Studiet af proteiner, der giver stabilisering af Bcl- XL -transkriptet , det vil sige binding til ARE i dets 3'-UTR, viste, at nukleolin er den vigtigste af dem . Forfatterne af undersøgelsen foreslog, at UV-stråling øger nukleolins evne til at binde sig til ARE og derved beskytte Bcl- XL -transkriptet mod nedbrydning [1] .

Ud over at ændre mRNA-stabilitet kan ARE'er også aktivere translation, selvom denne mekanisme er mindre almindelig og mindre godt forstået. 3'-URT mRNA'et af cytokintumornekrosefaktor α (TNFα) indeholder en ekstremt konserveret ARE på 34 nukleotider i længden. Dette gen udtrykkes i stimulerede lymfocytter og er afgørende for udviklingen af ​​den inflammatoriske proces , derfor er det nødvendigt, at det er muligt hurtigt at regulere det, hvis det er nødvendigt. Ved inflammation stopper cellevæksten, og TNFα opreguleres på proteinniveau. Proteinerne Argonaute 2 (AGO 2) og FXR1 har vist sig at binde til dets mRNA og aktivere translation som reaktion på væskeretention ( ødem ). Derudover blev det fundet, at det humane miR369-3 mikroRNA binder til ARE og kontrollerer bindingen af ​​ovennævnte proteiner til ARE, hvilket bekræfter miRNA's rolle i reguleringen af ​​translation. Tidligere blev det fundet, at TNFα ARE indeholder en hårnål , der modulerer bindingen af ​​proteiner til ARE og bestemmer de forskellige effekter af denne interaktion. Alt dette demonstrerer den mangefacetterede effekt af ARE, RNA-bindende proteiner og miRNA'er på genekspression, som om nødvendigt kan være både positiv og negativ [4] .

Klinisk betydning

Mutationer , der påvirker ARE, er vigtige, fordi en sådan mutation kan påvirke ekspressionen af ​​mange gener. Mutationer, der er opstået i ARE, fører således til en fejlfunktion af ARE-bindende proteiner, hvilket resulterer i udviklingen af ​​sygdomme som malign degeneration af hæmatopoietiske organer og leukæmi [5] [6] .

Noter

  1. 1 2 3 4 Barrett et. al., 2013 , s. 28.
  2. Nora Perrone-Bizzozero og Federico Bolognani. HuDs rolleog andre RNA-bindende proteiner i neural udvikling og plasticitet  // J  Neurosci Res : journal. - 2002. - Bd. 68 , nr. 2 . - S. 121-126 . - doi : 10.1002/jnr.10175 . — PMID 11948657 .
  3. Chen, Chyi-Ying A.; Shyu, Ann Bin. AU-rige elementer: karakterisering og betydning i mRNA-nedbrydning  (engelsk)  // Trends In Biochemical Science: tidsskrift. - 1995. - November ( bind 20 , nr. 11 ). - S. 465-470 . - doi : 10.1016/S0968-0004(00)89102-1 . — PMID 8578590 .
  4. Barrett et. al., 2013 , s. 29.
  5. Baou, M.; Norton, JD; Murphy, JJ AU-rige RNA-bindende proteiner i hæmatopoiese og   leukomogenese // Blod. — American Society of Hematology, 2011. - 13. september ( bind 118 , nr. 22 ). - P. 5732-5740 . - doi : 10.1182/blood-2011-07-347237 .
  6. Khabar, Khalid SA Post-transkriptionel kontrol under kronisk inflammation og cancer: fokus på AU-rige elementer  // Cellular and Molecular Life Sciences  : journal  . - 2010. - 22. maj ( bd. 67 , nr. 17 ). - P. 2937-2955 . - doi : 10.1007/s00018-010-0383-x .

Litteratur

Links