7SL RNA

7SL RNA
Identifikatorer
Symboler RN7SL1 , 7L1a, 7SL, RN7SL, RNSRP1, Signalgenkendelsespartikel RNA, RNA, 7SL, cytoplasmatisk 1, RNA-komponent af signalgenkendelsespartikel 7SL1
Eksterne ID'er OMIM: 612177 GeneCards: 6029
ortologer
Slags Human Mus
Entrez

6029

n/a

Ensemble

ENSG00000276168

n/a

UniProt

n/a

n/a

RefSeq (mRNA)

n/a

n/a

RefSeq (protein)

n/a

n/a

Locus (UCSC) Chr 14: 49,59 – 49,59 Mb n/a
PubMed- søgning [en] n/a
Rediger (menneske)

7SL RNA  er et langt ikke-kodende RNA , der er en del af den eukaryote signalgenkendelsespartikel ( signalgenkendelsespartikel , SRP ) .  SRP er et lille cytoplasmatisk riboproteinkompleks med en sedimentationsfaktor på 11S, der er involveret i den co-translationelle transport af proteiner. Kun den N-terminale signalsekvens af det syntetiserede protein frigivet fra ribosomet genkendes af SRP-partiklen, som derefter binder til den lille underenhed af ribosomet, midlertidigt bremser translationen på dette ribosom og sikrer bindingen af ​​polypeptid-ribosomet kompleks til membranen af ​​det ru endoplasmatiske retikulum [1] . SRP er også involveret i en af ​​mekanismerne for post-translationel transport af proteiner [2]

Eukaryot SRP omfatter sammen med 7SL RNA seks proteinunderenheder: SRP9 , SRP14 , SRP19 , SRP54 , SRP68 og SRP72 [3] .

Der er mindst tre funktionelle kopier af 7SL RNA-genet i det humane genom: RN7SL1, RN7SL2 og RN7SL3 . Disse gener transskriberes af RNA-polymerase III [4] .

Sandsynligvis, fra 7SL RNA som et resultat af deletion af den centrale sekvens, opstod Alu-gentagelser , som er en fælles familie af korte spredte gentagelser ( eng.  SINEs ) [5] .

Struktur

Længden af ​​7SL RNA er omkring 300 nukleotider; RNA-molekylet isoleret fra SRP har en sedimentationskoefficient på 7S [6] . Den sekundære struktur af 7SL RNA har otte spiralformede elementer, der foldes til et Alu-domæne og et S-domæne adskilt af en lang linker-region [7] . Det antages, at Alu-domænet medierer funktionen med at bremse forlængelsen af ​​peptidkæden [7] . Helix 8, som interagerer med M-domænet af SRP54-proteinet, medierer signalsekvensgenkendelse . Helix 8-sekvensen har en høj lighed med bakterielle og arkæale homologe RNA'er. SRP19-helix 6-komplekset menes at være involveret i SRP-samling og stabiliserer helix 8 for binding til SRP54 [8] .

Discovery

7SL RNA blev først påvist i onkogene virale partikler fra fugle og mus [9] . Efterfølgende blev 7SL RNA fundet at være en stabil komponent i uinficerede HeLa-celler , hvor det er forbundet med membraner og polysomfraktioner. I 1980 isolerede cellebiologer et "signalgenkendelsesprotein" (forkortet "SRP") fra hundens bugspytkirtel, der lettede translokationen af ​​sekretoriske proteiner over den endoplasmatiske retikulummembran. SRP'et viste sig derefter at indeholde en RNA-komponent. Sammenligning af 7SL RNA SRP gener i forskellige arter viste, at 8 7SL RNA helixen er meget konserveret. Regioner placeret nær 5'- og 3'-enderne af pattedyrets 7SL-RNA ligner den dominerende familie af Alu-gentagelser i det humane genom. Det er nu kendt, at Alu-DNA stammer fra 7SL RNA ved deletion af den centrale region, efterfulgt af revers transkription og integration i flere regioner af humane kromosomer. 7SL RNA er også blevet identificeret i nogle organeller , såsom plastiderne i mange fotosyntetiske organismer [10] .

Funktioner

Broadcast transport

7SL RNA er en integreret del af det lille og store domæne af SRP. Funktionen af ​​det lille domæne er at forsinke translation af proteinet, indtil det ribosombundne SRP er i stand til at binde til den membran-resident SRP-receptor (SR). Binding af præceptoren til en SRP ladet med et signalpeptid fremmer hydrolysen af ​​to molekyler af guanosintriphosphat (GTP). Denne reaktion frigiver SRP fra SR-receptoren og ribosomet, hvilket tillader translation at fortsætte, og proteinet kommer ind i translokonet [11] . Proteinet krydser membranen sammen under translation og kommer ind i det indre af det endoplasmatiske reticulum [12] .

Post-translationel sortering

SRP er også involveret i sorteringen af ​​proteiner efter deres syntese er afsluttet (post-translationel proteinsortering). I eukaryoter leveres haleforankrede proteiner med en hydrofob insertsekvens ved deres C-terminale ende til det endoplasmatiske retikulum af SRP [13] . Tilsvarende fremmer SRP post-translationel import af nuklear-kodede proteiner til thylakoidmembranen af ​​kloroplaster.

Noter

  1. ↑ Appel B., Beneke B.-I., Muller S. Nukleinsyrer: fra A til Z / udg. S. Muller. - M. : Binom: Videnlaboratoriet, 2013. - 413 s. - 700 eksemplarer.  - ISBN 978-5-9963-0376-2 .
  2. ↑ Johnson, N., K. Powis, S. High,. Post-translationel translokation til det endoplasmatiske reticulum  (engelsk)  // Biochimica et Biophysica Acta - Molecular Cell Research. - 2013. - Bd. 1833 , Nr. 11 . - P. 2403-2409. - doi : 10.1016/j.bbamcr.2012.12.008 .
  3. ↑ Birse DEA et al. Krystalstrukturen af ​​signalgenkendelsespartikelen Alu RNA-bindende heterodimer, SRP9/14  //  The EMBO journal. - 1997. - Bd. 16 , nr. 13 . - P. 3757-3766 . - doi : 10.1093/emboj/16.13.3757 .
  4. ↑ Englert M. et al. Nye opstrøms og intragene kontrolelementer til den RNA-polymerase III-afhængige transkription af humant 7SL RNA-gen   // Biochimie . - 2004. - Bd. 86 , nr. 12 . - s. 867-874 . - doi : 10.1016/j.biochi.2004.10.012 .
  5. ↑ Ullu E., Tschudi C. Alu-sekvenser bearbejdes 7SL RNA-gener   // Nature . - 1984. - Bd. 312 , nr. 5990 . - S. 171-172 . - doi : 10.1038/312171a0 . — PMID 6209580 .
  6. ↑ Kovalskaya O. N. et al. Strukturel og funktionel anatomi af en signalgenkendende partikel: fra bakterier til mennesker  // Usp. biol. kemi. - 2007. - T. 47 . - S. 129 .
  7. ↑ 1 2 Mod strukturen af ​​pattedyrets signalgenkendelsespartikel  //  Current Opinion in Structural Biology. - 2002-02-01. — Bd. 12 , udg. 1 . - S. 72-81 . — ISSN 0959-440X . - doi : 10.1016/S0959-440X(02)00292-0 . Arkiveret fra originalen den 3. juni 2021.
  8. ↑ Robert T. Batey, Robert P. Rambo, Louise Lucast, Brian Rha, Jennifer A. Doudna. Krystalstruktur af ribonukleoproteinkernen af ​​signalgenkendelsespartikel  (engelsk)  // Videnskab. - 2000-02-18. — Bd. 287 , udg. 5456 . - S. 1232-1239 . — ISSN 1095-9203 0036-8075, 1095-9203 . - doi : 10.1126/science.287.5456.1232 . Arkiveret fra originalen den 3. juni 2021.
  9. ↑ De lavmolekylære RNA'er fra Rous sarcoma virus: II. 7S RNA  (engelsk)  // Virologi. - 1970-12-01. — Bd. 42 , udg. 4 . - s. 927-937 . — ISSN 0042-6822 . - doi : 10.1016/0042-6822(70)90341-7 . Arkiveret fra originalen den 3. juni 2021.
  10. ↑ Magnus Alm Rosenblad, Tore Samuelsson. Identifikation af kloroplastsignalgenkendelsespartikel-RNA-gener  // Plante- og cellefysiologi. — 2004-11-15. - T. 45 , nej. 11 . - S. 1633-1639 . — ISSN 0032-0781 1471-9053, 0032-0781 . - doi : 10.1093/pcp/pch185 .
  11. ↑ Shu-ou Shan, Peter Walter. Co-translationel proteinmålretning af signalgenkendelsespartikelen  (engelsk)  // FEBS Letters. - 2005. - Bd. 579 , udg. 4 . - s. 921-926 . — ISSN 1873-3468 . - doi : 10.1016/j.febslet.2004.11.049 . Arkiveret fra originalen den 3. juni 2021.
  12. ↑ Celler ifølge Lewin / L. Cassimeris [og andre]. - M . : Videnlaboratoriet, 2021. - S. 306-308. — 1056 s. - ISBN 978-5-00101-342-6 .
  13. ↑ Benjamin M Abell, Martin R Pool, Oliver Schlenker, Irmgard Sinning, Stephen High. Signalgenkendelsespartikel medierer post-translationel målretning i eukaryoter  // The EMBO Journal. - 2004-07-21. - T. 23 , nej. 14 . - S. 2755-2764 . — ISSN 0261-4189 . - doi : 10.1038/sj.emboj.7600281 . Arkiveret fra originalen den 3. juni 2021.

Litteratur

  1. Kovalskaya ON et al. Strukturel og funktionel anatomi af en signalgenkendende partikel: fra bakterier til mennesker  // Usp. biol. kemi. - 2007. - T. 47 . - S. 129 .