En DNA-sequencer (sekventering) er et videnskabeligt instrument eller en enhed, der automatisk bestemmer sekvensen af nukleotider i en DNA -kæde - sekventering . En DNA-prøve indlæses i sequenceren, resultatet af dens arbejde er et sæt adenin- , thymin- , guanin- , cytosinbasesekvenser , normalt gemt som tekststrenge med bogstaverne A, T, G, C (de såkaldte "reads" ").
De første automatiserede sequencere blev introduceret af Applied Biosystems i 1987 og brugte Sanger-metoden . Denne metode ligger til grund for den første generation af sequencere. Med hans hjælp blev Human Genome Project afsluttet i 2001 (fuldstændig læsning af det menneskelige genom ). Installationer af den første generation var automatiseringen af elektroforetiske systemer, der bestemte migrationen af mærkede DNA-fragmenter i gelen og adskilte dem efter masse (længde).
Human Genome Project affødte udviklingen af billigere, høj-throughput, præcisionssekventeringssystemer kaldet Next Generation Sequencers (NGS). Blandt sådanne systemer: 454, SOLiD, Illumina DNA. Sådanne sequencere har fremskyndet processen med at læse DNA-koder i størrelsesordener sammenlignet med den tidligere Sanger-metode. Forberedelsen af DNA-prøver til sådanne enheder er automatiseret og tager omkring halvanden time. Det tager kun et par dage at læse et genom i menneskestørrelse 15 gange.
Nyere sequencere er tredje generation (f.eks. SMRT og Oxford Nanopore) og fungerer ved realtidsmåling af individuelle nukleotider af enkelte DNA-molekyler (ved at tilføje nukleotider eller ved at trække en kæde gennem en nanopore proteinstruktur ).
Moderne[ hvornår? ] sequencere[ hvad? ] har optiske systemer, ved hjælp af hvilke signaler er fikserede - farvestofterminatorer ( eng. dye-terminators ) - fluorokromer med forskellige bølgelængder og følgelig farve, binder sig til et specifikt nukleotid i DNA (grøn - adenin , rød - thymin , sort- guanin , blå- cytosin ).
Den første automatiserede DNA-sequencer baseret på Sanger-metoden blev udviklet af L. M. Smith og kommercialiseret af Applied Biosystems i 1987. [en]