Hammerhead ribozym

Hammerhead  -ribozymer er små selvskærende RNA'er , der har en konserveret sekvens og findes i nogle viroider og er forbundet med satellit-RNA'er fra nogle plantevira . [2]

Hammerhead- ribozymer blev først opdaget i planteviroider ; sådanne ribozymer katalyserede den sekvensspecifikke skæring af phosphodiesterbindinger i RNA-molekyler på grund af deres specifikke tertiære struktur . [3] [4] Den sekundære struktur ligner hovedet på en hammer .  hammerhoved .

Selvreplikering

Dette ribozym er i stand til selvreplikation. Replikation sker som et rullende hjul [5] . RNA'et er indhakket ved startpunktet af den rullende ring. Frie deoxynukleotider begynder at binde sig til den frigivne 3'-ende af denne kæde. Når datter-RNA-strengen forlænges, forskydes 5'-enden fra moderringen. Når 3'- og 5'-enderne mødes på samme punkt, stopper RNA-syntesen, og datterringen adskilles fra forældreringen.

Links

• Sekundær struktur af Hammerhead-ribozymet . Virtual Laboratory Wiki . - (Billeder). Hentet: 2009-15-10. Arkiveret fra originalen den 19. marts 2012. (Russisk)

• Om betydningen af ​​energiestimering i RNA-modellering - en undersøgelse på Wikiversity om modellering af tertiær struktur ved hjælp af et hammerhoved-ribozym som eksempel

• Tertiær struktur af viroid ribozym af Chrysanthemum chlorotic mottle viroid organisme, forudsagt ved hjælp af RNAInSpace-softwaren på YouTube Borisov, S.S. Yakovlev. Anvendelse af spilteori på problemet med ribonukleinsyrefoldning . (Russisk)

• Modelbane for foldningen af ​​viroid ribozym af organismen Chrysanthemum chlorotic mottle viroid, forudsagt ved hjælp af RNAInSpace-softwaren på YouTube Borisov, S.S. Yakovlev. Anvendelse af spilteori på problemet med ribonukleinsyrefoldning . (Russisk)

Se også

• Ribozyme indeholdende en hårnål
• Startpunkt for replikation
• Splejsning

Noter

1. ↑ Martick M., Scott WG Tertiære kontakter fjernt fra det aktive sted primer et ribozym til katalyse  // Celle  :  journal. - Cell Press , 2006. - Vol. 126 , nr. 2 . - S. 309-320 . - doi : 10.1016/j.cell.2006.06.036 . — PMID 16859740 .
2. ↑ Forster AC, Symons RH Selvspaltning af plus- og minus-RNA'er af en virusoid og en strukturel model for de aktive steder  // Celle  :  journal. - Cell Press , 1987. - Vol. 49 , nr. 2 . - S. 211-220 .
3. ↑ Prody GA, Bakos JT, Buzayan JM, Schneider IR, Bruening G. Autolytic Processing of Dimeric Plant Virus Satellite RNA  //  Science : journal. - 1986. - Bd. 231 , nr. 4745 . - S. 1577-1580 . - doi : 10.1126/science.231.4745.1577 .
4. ↑ Hutchins CJ, Rathjen PD, Forster AC, Symons RH Selvspaltning af plus og minus RNA-transkripter af avocado sunblotch viroid  // Nucleic Acids Res  . : journal. - 1986. - Bd. 14 , nr. 9 . - P. 3627-3640 .
5. ↑ Flores R, Navarro JA, de la Peña M, Navarro B, Ambrós S, Vera A. Viroider med hammerhoved-ribozymer: nogle unikke strukturelle og funktionelle aspekter med hensyn til andre medlemmer af gruppen  // Biol. Chem.. - 1999. - T. 380 , nr. 7-8 . - S. 849-854 .