Autoktonisme (i Europa og USA bruges udtrykket indigenisme ) er en ideologi eller social doktrin, der opretholder den genetiske og/eller sproglige kontinuitet af den historiske udvikling af befolkningen i et bestemt territorium. Autoktonisme blev udbredt i Europa i det 18. - første halvdel af det 20. århundrede, sammen med væksten af national selvbevidsthed og påvirkede mange samfundsvidenskaber, hvor den var i modsætning til " migrationisme " (hypotesen om, at historiske kulturelle ændringer kunne forbindes med befolkningsmigration, en ændring i etnicitet og/eller sprog i et bestemt territorium) og " invasionisme " (hypotesen om invasion og udryddelse af den oprindelige befolkning som årsagerne til kulturelle forandringer). I forbindelse med de europæiske magters konstante territoriale stridigheder i denne periode fik autoktonismen ideologisk og politisk betydning. I russisk historievidenskab var særlige manifestationer af autoktonisme anti -normanisme (hypotesen om overvægten af det slaviske element blandt varangianerne ), hypoteser om autoktonismen af den slaviske befolkning i den forhistoriske periode ( B.A. Rybakov og andre).
Efter indgåelsen af aftaler om de europæiske grænsers uforanderlighed mister autoktonismen gradvist sin betydning i Europa, men er stadig stærk i landene i Østasien, Afrika og Sydamerika.
Migrationisme vandt frem i procesarkæologien i 1960'erne og 1970'erne for at forklare kulturelle forandringer i det forhistoriske Europa i yngre stenalder og bronzealder .