Hongan-ji ( Jap. 本願寺, "Tempel for Buddhas store løfte") er det generelle navn på templerne i den buddhistiske skole Jodo-shinshu .
Det første tempel kaldet Hongan-ji blev bygget i 1321 i Kyoto , ved siden af begravelsesstedet for Shinran , grundlæggeren af Jodo-shinshu-skolen. Templets første abbed var Shinrans tipoldebarn Kakunyo . I det 15. århundrede, under abbeden af Rennyo , blev Hongan-ji stærkt styrket ved at tiltrække et stort antal militante samuraier og bønder i rækken af tilhængerne af Jodo-shinshu-læren, som dannede en hær kaldet Ikko-ikki . Tendai - skolen , hvis base var placeret på Mount Hiei ved Enryaku-ji-templet , så dog styrkelsen af Hongan-ji som en fare for sig selv. I 1465 angreb krigermunkene fra Tendai-skolen rivalernes tempel, ødelagde en del af bygningerne og tvang Rennyo til at flygte.
I 1496 etablerede Rennyō en ny base for sin skole ved mundingen af Yodo-floden , hvor den moderne by Osaka ligger . Det nye befæstede tempelkompleks fik navnet Ishiyama Hongan-ji . Daimyo Oda Nobunaga , en af Japans tre legendariske forenere, frygtede Jodo Shinshu-tilhængernes militære magt og belejrede denne fæstning i ti år (fra 1570 til 1580), indtil kejser Ogimachi overbeviste sin abbed Kennyo om at overgive sig. Efter overgivelsen blev tempelkomplekset brændt ned, og tre år senere begyndte Toyotomi Hideyoshi opførelsen af Osaka Slot i stedet .
Efter nederlaget forlod Kennyo ikke tanker om at restaurere templet og skiftede dets plads flere gange, indtil endelig Toyotomi Hideyoshi tildelte et sted til templet i Kyoto. Således vendte Hongan-ji tilbage til Kyoto. I 1592 døde Gengnyo, og hans ældste søn Gyongyo blev abbed i templet, men Gengnyo angav selv i sit testamente, at han ønskede, at en anden søn, Junnyo, skulle være abbed. Ifølge Hideyoshis instruktioner blev Junnyo abbed i 1593, og Kyonyo trak sig tilbage. Men ti år senere, i 1602, modtog Kyonyo fra den første shogun Tokugawa Ieyasu et jordstykke øst for Hongan-ji og en ordre om at etablere et nyt tempel dér. Således blev Hongan-ji og med den sektens tilhængere delt i to. Det gamle tempel ledet af Junnyo hed Nishi Hongan-ji (Western Hongan-ji, 34°59′28″ N 135°45′04″ E ), og det nye ledet af Gyonyo - Higashi Hongan-ji (Østlige Hongan-ji).