Treponema

videnskabelig klassifikation

Domæne:bakterieType:Spirochaetae Cavalier-Smith 2002Klasse:Spirochaetes Cavalier-Smith 2002Bestille:SpirochetesFamilie:SpirochaetaceaeSlægt:Treponema

Internationalt videnskabeligt navn

Treponema (Schaudin 1905) Abt, Göker og Klenk 2013 [1]

Synonymer

Spironema Vuillemin 1905 [1] non Klebs 1892 non Leger & Hesse 1922 non Rafinesque 1838 non Hochst. 1842 non Lindley 1840 non mild 1864
Microspironema
Stiles og Pfender 1905 [1]

Systematik
hos Wikispecies

Billeder
på Wikimedia Commons

DET ER	958350
NCBI	157
EOL	83190

Treponema [2] ( lat. Treponema ) er en slægt af snoede bakterier fra familien Spirochaetaceae af ordenen spirocheter ( Spirochaetales ) [3] .

Patogenicitet

De forårsagende stoffer til menneskelige treponematoser [4] [5] :

Underarter eller arter af bakterier	Sygdom	Geografisk fordeling	Patienternes alder	Smittevej	medfødte former
Treponema pallidum subsp. pallidum	Syfilis	Overalt	Voksne, teenagere	Seksuel	Ja
Treponema pallidum subsp. karateum	Pint	Varmt klima semi-ørkener: Nordamerika	Børn, teenagere	hudkontakt	Ikke
Treponema pallidum subsp. endemisk	Bejel	Ørkener: Nordafrika, Mellemøsten	Børn, teenagere, voksne	Kontakt med slimhinder	Sjældent
Treponema pertenue	Yaws	Troperne: Afrika, Indonesien, Caribien	Børn	hudkontakt	Ikke

Treponema paraluiscuniculi forårsager syfilis hos kaniner [6] .

Fylogeni

Baseret på analysen af den 16s-ribosomale RNA-underenhed blev der bygget et fylogenetisk træ af alle arter i LTP-projektet (udgave 123) [7] .

T. caldarium (Pohlschroeder et al. 1995) Abt, Göker & Klenk 2013

T. stenostreptum (Zuelzer 1912) Abt, Göker & Klenk 2013

T. isoptericolens Dröge et al. 2008

T. azotonutricium Graber et al. 2004

T. primitia Graber et al. 2004

T. zuelzerae ( ex Veldkamp 1960) Canale-Parola 1980 emend. Abt, Göker & Klenk 2013

T. medium

T.m. bovis ♠ Evans et al. 2006

T.m. medium ♠ Umemoto et al. 1997

T. pedis Evans et al. 2009

T. dentcola ( tidl. Flügge 1886) Chan et al. 1993

T. putidum Wyss et al. 2004

T. lecithinolyticum Wyss et al. 1999

T. maltophilum Wyss et al. 1996

T. brennaborense Schrank et al. 1999

T. saccharophilum Paster og Canale-Parola 1986

T. berlinense Nordhoff et al. 2005

T. pectinovorum Smibert og Burmeister 1983

T. bryantii Stanton og Canale-Parola 1980

T. porcinum Nordhoff et al. 2005

T. succinifaciens Cwyk og Canale-Parola 1981

T. parvum Wyss et al. 2001

T. amylovorum Wyss et al. 1997

T. socranskii

T. s. paredis Smibert et al. 1984

T. s. buccale Smibert et al. 1984

T. s. socranskii Smibert et al. 1984

Taksonomi

Den i øjeblikket accepterede klassificering er baseret på nomenklaturen af prokaryote navne (LPSN) [8] og National Center for Biotechnology Information (NBCI) [9] :

?Candidatus Treponema suis Molbak et al. 2006
? Treponema calligyrum ♠ Noguchi
? Treponema carateum ♥ (pinta forårsager Treponema )
? Treponema minutum ♦ Dobell 1912
? Treponema pallidum ♦ (Schaudin og Hoffmann 1905) Schaudinn 1905
- T.p. endemicum ♠ Smibert 1984 (bejel forårsager Treponema )
- T.p. pallidum ♠ (Schaudinn og Hoffmann 1905) Schaudinn 1905 ( syfilis forårsager Treponema )
- T.p. pertenue ♠ Smibert 1984 ( yaws forårsager Treponema )
? Treponema paraluisleporis ♠ Lumeij et al. 1994
? Treponema paraluiscuniculi ♦ (Jacobsthal 1920) Smibert 1974
? Treponema pertenue ♦ (Castellani 1905) Castellani & Chalmers 1910
? Treponema phagedenis ♠
- T.p. phagedenis ♠ (Noguchi 1912) Brumpt
- T.p. vaccae ♠ Evans et al. 2006
? Treponema refringens ♠ (Schaudinn og Hofmann 1905) Castellani og Chalmers
? Treponema vincentii ♠ Smibert 1984
? Treponema zioleckii ♠ Piknova et al. 2008
Treponema amylovorum Wyss et al. 1997
Treponema azotonutricium Graber et al. 2004
Treponema berlinense Nordhoff et al. 2005
Treponema brennaborense Schrank et al. 1999
Treponema bryantii Stanton og Canale-Parola 1980
Treponema caldarium (Pohlschroeder et al. 1995) Abt, Göker & Klenk 2013
Treponema dentcola (ex Flügge 1886) Chan et al. 1993
Treponema isoptericolens Dröge et al. 2008
Treponema lecithinolyticum Wyss et al. 1999
Treponema maltophilum Wyss et al. 1996
Treponema medium ♦ Umemoto et al. 1997
- T.m. bovis ♠ Evans et al. 2006
- T.m. medium ♠ Umemoto et al. 1997
Treponema parvum Wyss et al. 2001
Treponema pectinovorum Smibert og Burmeister 1983
Treponema pedis Evans et al. 2009
Treponema porcinum Nordhoff et al. 2005
Treponema primitia Graber et al. 2004
Treponema putidum Wyss et al. 2004
Treponema saccharophilum Paster og Canale-Parola 1986
Treponema socranskii Smibert et al. 1984
- T. s. paredis Smibert et al. 1984
- T. s. buccale Smibert et al. 1984
- T. s. socranskii Smibert et al. 1984
Treponema stenostreptum (Zuelzer 1912) Abt, Göker & Klenk 2013
Treponema succinifaciens Cwyk og Canale-Parola 1981
Treponema zuelzerae (ex Veldkamp 1960) Canale-Parola 1980 emend. Abt, Göker & Klenk 2013

Bemærkninger:

♦ Type stamme mistet eller utilgængelig ♠ Stammen er i NCBI, men ikke i LSPN ♥ Stamme ikke indsendt til NCBI, men opført af LPSN

Noter

↑ 1 2 3 Slægt Treponema : [ eng. ] // LPSN. (Få adgang: 17. september 2017) .
↑ Atlas of Medical Microbiology, Virology and Immunology: Lærebog for medicinstuderende / Ed. A. A. Vorobieva , A. S. Bykova . - M . : Lægeinformationsstyrelsen, 2003. - S. 78. - 236 s. — ISBN 5-89481-136-8 .
↑ Klassifikation af domæner og phyla - Hierarkisk klassifikation af prokaryoter (bakterier) : Version 2.0 : [ eng. ] // LPSN. - 2016. - 2. oktober.
↑ Medicinsk og sanitær mikrobiologi / A. A. Vorobyov, Yu. S. Krivoshein, V. P. Shirobokov. - M . : Academy, 2003. - S. 52. - ISBN 5-7695-1292-X .
↑ De endemiske treponematoser (neopr.) // Microbes Infect .. - 2002. - January ( bind 4 , nr. 1 ). - S. 83-94 . - doi : 10.1016/S1286-4579(01)01513-1 . — PMID 11825779 . Arkiveret fra originalen den 19. september 2019.
↑ Sekvensen af det sure gentagelsesprotein (arp)-genet adskiller veneral fra ikke-veneral Treponema pallidum -underart, og genet har udviklet sig under stærk positiv selektion i den underart, der forårsager syfilis // FEMS Immunol. Med. mikrobiol. : journal. - 2008. - August ( bind 53 , nr. 3 ). - s. 322-332 . - doi : 10.1111/j.1574-695X.2008.00427.x . — PMID 18554302 . Arkiveret fra originalen den 5. januar 2013.
↑ Projektet 'The All-Species Living Tree' . 16S rRNA-baseret LTP-frigivelse 123 (fuldt træ) . Silva Comprehensive Ribosomal RNA Database . Hentet 20. marts 2013. Arkiveret fra originalen 7. juni 2019. (ubestemt)
↑ JP Euzéby Treponema . Liste over prokaryote navne med stående i nomenklatur (LPSN). Hentet 20. marts 2016. Arkiveret fra originalen 4. august 2020. (ubestemt)
↑ Sayers Treponema . National Center for Biotechnology Information (NCBI) taksonomidatabase. Hentet 20. marts 2016. Arkiveret fra originalen 24. oktober 2017. (ubestemt)

Ordbøger og encyklopædier	Fantastisk catalansk Britannica (online)
Taksonomi	EOL GBIF iNaturalist NCBI IRMNG ITIS TSN WorMS