Rhizosfæren er et smalt jordlag, der støder op til en plantes rødder og direkte påvirket af rodsekreter og jordmikroorganismer , omkring 2-5 mm tykt [1] . Jord , der ikke er en del af rhizosfæren , kaldes bulkjord . Rhizosfæren indeholder mange bakterier, der lever af udskillende celler samt proteiner og sukkerarter . Derudover lever adskillige protister og nematoder , der lever af bakterier , i rhizosfæren. . Det meste af næringsstofkredsløbet og planteundertrykkelsen af forskellige patologiske processer sker således i umiddelbar nærhed af rødderne [2] .
Planter udskiller mange stoffer i rhizosfæren, der udfører forskellige funktioner. Strigolacton , et plantehormon , der påvirker mykorrhiza - svampen, stimulerer sporespiring og producerer ændringer, der gør det muligt for svampen at flette planteroden og danne mykorrhiza. Parasitplanten Striga er også følsom over for strigolacton og begynder at spire, når den opdages. Så vil den unge plante hæfte sig til roden og modtage næringsstoffer fra den. Symbiotiske nitrogenfikserende bakterier, såsom medlemmer af slægten Rhizobium , genkender et ukendt stof, der udskilles af rødderne fra planter i bælgplantefamilien ( lat. Fabaceae ) og udskiller en Nod-faktor , der informerer planten om tilstedeværelsen af disse bakterier i nærheden jord. Derefter dannes der rodknogler på plantens rødder , hvor bakterier sætter sig og forsynet med næringsstoffer omdanner kvælstof til en form, der optages af planten. Ikke-symbiotiske (eller "fritlevende") kvælstoffikserende bakterier sætter sig i rhizosfæren, men kun uden for rødderne af flere planter (inklusive mange kornsorter ), og "fikserer" tilsvarende kvælstof i plantens nitrogenrige rhizosfære. Selvom det menes, at disse bakterier ikke har et stærkt forhold til planter i deres habitat, reagerer de meget stærkt på plantens tilstand. For eksempel udviser nitrogenfikserende bakterier, der lever i ris rhizosfæren , daglige cyklusser, der efterligner planters og har en tendens til at levere mere fikseret nitrogen til jorden under plantevækststadiet, hvor behovet for det er særligt stort [3] .
Nogle planters rødder udskiller allelopatiske stoffer, der hæmmer udviklingen af andre organismer. For eksempel producerer hvidløgsfed ( lat. Alliaria petiolata ) et stof, der kan forhindre dannelsen af mykorrhiza i træer i blandede skove i Nordamerika [4] .
I rhizosfæren findes et stort antal symbiotiske mikroorganismer, der stimulerer plantevækst og beskytter den mod svampe og skimmelsvamp ( PGPR-bakterier ) [1] .