Cambridge Reference Sequence ( CRS) for human mitokondrie-DNA blev første gang undersøgt i 1981. [2]
En gruppe videnskabsmænd ledet af Frederick Senger fra University of Cambridge sekventerede mitokondrielle genomet af en europæisk kvinde [3] i 1970'erne og bestemte, at dets længde var 16.569 basepar (0,0006 % af det menneskelige kernegenom), der indeholdt omkring 37 gener . Denne sekvens blev først udgivet i 1981. [2]
Da andre forskere gentog sekventeringen, blev der bemærket nogle overraskende uoverensstemmelser. Den oprindeligt publicerede sekvens indeholdt elleve fejl, inklusive et ekstra basepar i position 3107 og individuelle basepar fejltildelinger. Nogle af disse var resultatet af kontaminering med bovine celler og HeLa . En revideret og revideret CRS er blevet offentliggjort af Andrews et al. i 1999 [4] (Den oprindelige nukleotidnummerering er blevet bibeholdt for at undgå forvirring). Referencesekvensen tilhører den europæiske haplogruppe H2a2a1 . Det reviderede CRS omtales som rCRS . Denne sekvens er deponeret i GenBank NCBI-databasen under adgangsnummer NC_012920. [en]
Når mitokondriel DNA-sekventering bruges til genealogiske formål , rapporteres resultaterne ofte som forskellige fra det reviderede CRS. CRS er en referencesekvens, ikke en registrering af det tidligste humane mtDNA. Forskelle mellem testprøver og CRS kan opstå enten i oprindelsen af CRS eller i oprindelsen af de testede prøver.
En alternativ afrikansk (Yoruba) referencesekvens er også nogle gange blevet brugt i stedet for Cambridge. Det har et andet nummereringssystem med en længde på 16.571 basepar og repræsenterer mitokondrielle genom af et afrikansk individ. Andre alternative referencesekvenser, der også lejlighedsvis er blevet brugt, omfatter afrikanske (Uganda), svenske og japanske sekvenser. [5]
I 2012 blev det foreslået at erstatte den reviderede Cambridge Reference Sequence (rCRS) med den nye Sapiens Reconstructed Reference Sequence (RSRS). [6] RSRS bevarer det samme nummereringssystem som CRS, men repræsenterer det forfædres genom af Mitochondrial Eve , hvorfra alle i øjeblikket kendte menneskelige mitokondrier stammer fra. RSRS burde være mere nyttigt til at sammenligne ændringer i forskellige haplogrupper [3] , men denne påstand kan diskuteres. [7] FamilyTreeDNA rapporterer resultaterne af en mtDNA-undersøgelse for både rCRS og RSRS. [3]