Histon deacetylase 11

Histon deacetylase 11

Identifikatorer

HDAC11 ; HD11

Eksterne ID'er

OMIM: 607226 MGI : 2385252 Homologen : 11743 IUPHAR : ChEMBL : 3310 GeneCards : HDAC11-gen

Gen-ontologi
Fungere	• histondeacetylaseaktivitet • transkriptionsfaktorbinding • NAD-afhængig histon-deacetylase-aktivitet (H3-K14-specifik) • NAD-afhængig histon-deacetylase-aktivitet (H3-K9-specifik) • NAD-afhængig histon-deacetylase-aktivitet (H4-K16-specifik) • NAD-afhængig histon-deacetylase-aktivitet (H3-K18-specifik)
celle komponent	• histon deacetylase kompleks • kerne • plasmamembran • ekstracellulært vesikulært exosom
biologisk proces	• transkription, DNA-templeret • regulering af transkription, DNA-templeret • oligodendrocyt udvikling • kromatin modifikation • histon deacetylering • histon H3 deacetylering • histon H4 deacetylering
Kilder: Amigo / QuickGO

RNA-ekspressionsprofil

Mere information

ortologer

Udsigt

Human

Mus

Entrez

ENSG00000163517

ENSMUSG00000034245

RefSeq (mRNA)

RefSeq (protein)

Locus (UCSC)

Chr 3:
13,52 – 13,55 Mb

Chr 6:
91,16 – 91,17 Mb

Søg i PubMed

Histone deacetylase 11 ( Histone deacetylase 11 ) er et 39 kDa enzym kodet af HDAC11 genet hos mennesker, lokaliseret på kromosom 3 hos mennesker og på kromosom 6 hos mus [1] [2] .

Det er en klasse IV HDAC. (Klasse IV har karakteristika for både Klasse I og Klasse II HDAC). Det blev først beskrevet i 2002.

Histon-deacetylaser såsom HDAC11 kontrollerer DNA -ekspression ved at modificere den histon- oktameriske kerne , som pakker DNA ind i tætte kromatinstrukturer og undertrykker genekspression [ 2] .

Funktioner

HDAC11 udtrykkes normalt i hjerne- og testikelvæv, men øget ekspression af HDAC11 er også set i forskellige cancerceller .

HDAC11 har vist sig at være en negativ regulator af IL-10- produktion i antigen-præsenterende celler. Derudover har HDAC11-hæmning vist sig at resultere i øget OX40L -ekspression i Hodgkins lymfomceller .

Interaktioner

HDAC11 har vist sig at interagere med HDAC6 [3] .

Se også

Histon deacetylaser

Noter

↑ Gao L., Cueto MA, Asselbergs F., Atadja P. Kloning og funktionel karakterisering af HDAC11, et nyt medlem af den humane histon-deacetylase-familie // Journal of Biological Chemistry : tidsskrift. - 2002. - Juli ( bind 277 , nr. 28 ). - P. 25748-25755 . - doi : 10.1074/jbc.M111871200 . — PMID 11948178 .
↑ 1 2 Entrez-gen: HDAC11-histondeacetylase 11 . (ubestemt)
↑ Gao, Lin; Cueto Maria A; Asselbergs Fred; Atadja Peter. Kloning og funktionel karakterisering af HDAC11, et nyt medlem af den humane histon-deacetylase-familie (engelsk) // Journal of Biological Chemistry : tidsskrift. - USA, 2002. - Juli ( vol. 277 , nr. 28 ). - P. 25748-25755 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M111871200 . — PMID 11948178 .

Litteratur

Verdin E., Dequiedt F., Kasler HG Klasse II histon-deacetylaser : alsidige regulatorer // Trends : journal. - 2003. - Bd. 19 , nr. 5 . - S. 286-293 . - doi : 10.1016/S0168-9525(03)00073-8 . — PMID 12711221 .
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA DNA-kloning ved hjælp af in vitro stedspecifik rekombination // Genomforskning : journal. - 2001. - Bd. 10 , nej. 11 . - S. 1788-1795 . - doi : 10.1101/gr.143000 . — PMID 11076863 .
Simpson JC; Wellenreuther R; Postka A; Pepperkok, R; Wiemann, S. Systematisk subcellulær lokalisering af nye proteiner identificeret ved storskala cDNA-sekventering // EMBO - rapporter : journal. - 2001. - Bd. 1 , nr. 3 . - S. 287-292 . - doi : 10.1093/embo-reports/kvd058 . — PMID 11256614 .
Strausberg R.L.; Feingold EA; Ryper LH; Derge, JG; Klausner, R.D.; Collins, F.S.; Wagner, L; Shenmen, C. M.; Schuler, GD Generering og indledende analyse af mere end 15.000 fuldlængde humane og muse cDNA-sekvenser // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal . - 2003. - Bd. 99 , nr. 26 . - P. 16899-16903 . - doi : 10.1073/pnas.242603899 . — PMID 12477932 .
Ota T; Suzuki Y; Nishikawa T; Otsuki, Tetsuji; Sugiyama, Tomoyasu; Irie, Ryotaro; Wakamatsu, AI; Hayashi, Koji; Sato, Hiroyuki. Komplet sekventering og karakterisering af 21.243 fuldlængde humane cDNA'er // Nature Genetics : tidsskrift . - 2004. - Bd. 36 , nr. 1 . - S. 40-5 . - doi : 10.1038/ng1285 . — PMID 14702039 .
Gerhard D.S.; Wagner L; Feingold EA; Shenmen, C. M.; Ryper, LH; Schuler, G; Klein, S.L.; Gamle, S; Rasooly, R. Status, kvalitet og udvidelse af NIH fuldlængde cDNA-projektet: Mammalian Gene Collection (MGC ) // Genome Research : journal. - 2004. - Bd. 14 , nr. 10B . - S. 2121-2127 . - doi : 10.1101/gr.2596504 . — PMID 15489334 .
Wiemann S; Arlt D; Huber W; Wellenreuther, R; Schleeger, S; Mehrle, A; Bechtel, S; Sauermann, M; Korf, U. From ORFeome to Biology: A Functional Genomics Pipeline // Genome Research : journal. - 2004. - Bd. 14 , nr. 10B . - S. 2136-2144 . - doi : 10.1101/gr.2576704 . — PMID 15489336 .
Voelter-Mahlknecht S., Ho AD, Mahlknecht U. Kromosomal organisation og lokalisering af det nye klasse IV humane histon deacetylase 11 gen // International Journal of Molecular Medicine : journal. - 2005. - Bd. 16 , nr. 4 . - S. 589-598 . - doi : 10.3892/ijmm.16.4.589 . — PMID 16142391 .
Rual JF; Venkatesan K; Hao T; Hirozane-Kishikawa, Tomoko; Dricot, Amelie; Li, Ning; Berriz, Gabriel F.; Gibbons, Francis D.; Dreze, Matija. Mod et kort i proteomskala over det humane protein-protein-interaktionsnetværk (engelsk) // Nature : journal. - 2005. - Bd. 437 , nr. 7062 . - S. 1173-1178 . - doi : 10.1038/nature04209 . — PMID 16189514 .
Mehrle A; Rosenfelder H; Schupp I; Del Val, C; Arlt, D; Hahne, F; Bechtel, S; Simpson, J; Hofmann, O. LIFEdb-databasen i 2006 // Nucleic Acids Research : journal. - 2006. - Bd. 34 , nr. Database problem . - P.D415-8 . doi : 10.1093 / nar/gkj139 . — PMID 16381901 .
Lindberg D., Akerström G., Westin G. Mutationsanalyser af WNT7A og HDAC11 som kandidat-tumorsuppressorgener i sporadiske maligne pankreasendokrine tumorer (engelsk) // Clin. Endokrinol. (Oxf): journal. - 2007. - Bd. 66 , nr. 1 . - S. 110-114 . - doi : 10.1111/j.1365-2265.2006.02694.x . — PMID 17201809 .

Links

MeSH HDAC11+protein,+menneske