| XbaI | |
|---|---|
| Identifikatorer | |
| Kode KF | 3.1.21.4 |
| Enzymdatabaser | |
| IntEnz | IntEnz visning |
| BRENDA | BRENDA indgang |
| ExPASy | NiceZyme udsigt |
| MetaCyc | metabolisk vej |
| KEGG | KEGG indgang |
| PRIAM | profil |
| FBF strukturer | RCSB PDB PDBe PDBj PDBsum |
| Søg | |
| PMC | artikler |
| PubMed | artikler |
| NCBI | NCBI proteiner |
XbaI er en restriktionsendonuklease isoleret fra bakterien Xanthomonas badrii [1] .
Xbal er en restriktionsendonuklease (type II, subtype P). Det vil sige, at Xbal genkender en palindromisk DNA-sekvens og laver en restriktion i palindromet på et fast punkt. I nærvær af dimethylsulfoxid (DMSO) og ved høje koncentrationer af glycerol i mediet mister XbaI evnen til at genkende et palindrom og udfører uspecifik restriktion ( stjerneaktivitet ) . Efter begrænsning dannes klæbrige ender med fremspring på fire baser.
| palindromisk plot | Begrænsningsprodukter |
|---|---|
| 5'-TCTAGA-3' 3'-AGATCT-5' | 5'-T CTAGA-3' 3'-AGATC T-5' |
XbaI-restriktionsenzymaktivitet hæmmes af adeninmethylering ( DAM-methylase ). Imidlertid bevares restriktionsenzymaktivitet, når cytosin ( DCM- eller CpG - methylase) methyleres. .
Efter at DNA-restriktion er fuldført, kan Xbal inaktiveres ved varmedenaturering til 65°C i 20 minutter. .
XbaI er meget udbredt i molekylærbiologisk forskning. Især bruges XbaI til kloning af specifikke nukleotidsekvenser [2] i restriktionsanalyse .
For eksempel er XbaI blevet brugt i analysen af østrogenreceptor α [3] og lipoprotein a (ApoB) [4] polymorfismer .