Ostreococcus

Ostreococcus
Elektronmikrofotografi af
Ostreococcus tauri
videnskabelig klassifikation
Domæne:eukaryoterKongerige:PlanterUnderrige:grønne planterAfdeling:grønne algerKlasse:MamiellophyceaeBestille:MamiellalesFamilie:bathycoccaceaeSlægt:Ostreococcus
Internationalt videnskabeligt navn
Ostreococcus Courties & Chrét.-Din.

Ostreococcus  (lat.) er en slægt af encellede coccoid - grønalger , der er en del af Mamiellophyceae -klassen . De er en del af picoplankton , som spiller en nøglerolle i det oceaniske kulstofkredsløb . Denne slægt omfatter de mindste fritlevende eukaryoter , der når størrelser på kun 0,8 mikron .

Studiehistorie

Den første kendte art af slægten, Ostreococcus tauri , blev beskrevet i 1994 i en flowcytometrisk undersøgelse af picoplankton fra søen til [1] . Enkeltcellede fotosyntetiske organismer undersøges bekvemt ved flowcytometri på grund af autofluorescensen klorofyl og andre fluoroforer, der bruges til at absorbere sollys [2] . Den nyligt beskrevne art blev tildelt Prasinophyceae -klassen baseret på sammensætningen af ​​klorofyler og carotenoider [1] samt cellens ultrastruktur. Efterfølgende blev artens position bekræftet ved 18S rRNA-analyse [3] . Molekylær fylogenetiske data opnået i undersøgelsen af ​​18S rRNA gjorde det muligt at isolere en ny klasse - Mamiellophyceae , som omfattede Ostreococcus- arter i Bathycoccaceae- familien [4] . Mamiellophyceae er en af ​​de mest økologisk succesrige grupper af eukaryoter, der udgør marine og muligvis ferskvands fotosyntetisk picoplankton. Metagenomisk analyse [5] og metabarcoding [6] gjorde det muligt at påvise ostreokokker i forskellige dele af havene.

Beskrivelse

Slægten Ostreococcus indeholder de mindste kendte fritlevende eukaryoter, da størrelsen af ​​de fleste celler ikke overstiger 0,8 mikron [1] . Cellens ultrastruktur er enkel: disse er coccoidceller, blottet for en cellevæg og indeholder en kloroplast , en mitokondrie , et Golgi-apparat og også en kerne [1] . Ostreococcus genomer er meget små [7] . Genomiske sekvenser er kendt for tre arter af slægten: O. tauri RCC422 (størrelse 13 megabaser (Mb), genomet blev sekventeret i 2006 [8] og dataene blev opdateret i 2014 [9] ), O. lucimarinus CCMP2514 [10 ] og stammen RCC809 [11] . GC-sammensætningen af ​​disse alger er højere end for højere planter , dog er to usædvanlige kromosomer karakteriseret ved en lav GC-sammensætning og bærer mange transposoner og gener af prokaryot oprindelse [7] . Virus er kendt for at inficere repræsentanter for slægten Ostreococcus , men nogle linjer udvikler resistens over for dem. Resistens kan skyldes næsten halvdelen af ​​generne fra usædvanligt kromosom 19, som, som vist ved en sammenligning af karyotyper , har gennemgået fysiske omlejringer [7] . I 2012 blev metaboliske vejkort for disse to arter af slægten rekonstrueret ved hjælp af KEGG- databasen [12] .

Økologi

Ostreococcus- arter er fordelt over hele kloden i havenes fotografiske zone , hvor de binder kuldioxid og frigiver ilt , og er dermed producenter [7] .

Klassifikation

Ifølge AlgaeBase -databasen omfatter slægten fra januar 2017 2 slægter [13] :

Ifølge andre kilder skelnes der fra en anden art - Ostreococcus lucimarinus [10] , samt mindst en stamme, der ikke tilhører nogen af ​​de tidligere listede arter - Ostreococcus sp. RCC809 [11] .

Noter

  1. ↑ 1 2 3 4 Courties Claude , Vaquer André , Troussellier Marc , Lautier Jacques , Chrétiennot-Dinet Marie J. , Neveux Jacques , Machado Cordelia , Claustre Hervé. Mindste eukaryot organisme  (engelsk)  // Nature. - 1994. - Juli ( vol. 370 , nr. 6487 ). - S. 255-255 . — ISSN 0028-0836 . - doi : 10.1038/370255a0 .
  2. ↑ Davey HM , Kell DB Flowcytometri og cellesortering af heterogene mikrobielle populationer: vigtigheden af ​​enkeltcelleanalyser.  (engelsk)  // Mikrobiologiske anmeldelser. - 1996. - Bd. 60, nr. 4 . - s. 641-696. — PMID 8987359 .
  3. ↑ Courties Claude , Perasso Roland , Chrétiennot-Dinet Marie-Josèphe , Gouy Manolo , Guillou Laure , Troussellier Marc. FYLOGENETISK ANALYSE OG GENOMSTØRRELSE AF OSTREOCOCCUS TAURI (CHLOROPHYTA, PRASINOPHYCEAE)  // Journal of Phycology. - 1998. - Oktober ( bind 34 , nr. 5 ). - S. 844-849 . — ISSN 0022-3646 . - doi : 10.1046/j.1529-8817.1998.340844.x .
  4. ↑ Marin Birger , Melkonian Michael. Molekylær fylogeni og klassificering af Mamiellophyceae-klassen. nov. (Chlorophyta) baseret på sekvenssammenligninger af de nuklear- og plastid-kodede rRNA-operoner  // Protist. - 2010. - April ( vol. 161 , nr. 2 ). - S. 304-336 . — ISSN 1434-4610 . - doi : 10.1016/j.protis.2009.10.002 .
  5. ↑ Piganeau Gwenaël , Moreau Herve. Screening af Sargassohavets metagenom for data til undersøgelse af genomudviklingen i Ostreococcus (Prasinophyceae, Chlorophyta  )  // Gen. - 2007. - December ( bind 406 , nr. 1-2 ). - S. 184-190 . — ISSN 0378-1119 . - doi : 10.1016/j.gene.2007.09.015 .
  6. ↑ Demir-Hilton Elif , Sudek Sebastian , Cuvelier Marie L , Gentemann Chelle L , Zehr Jonathan P , Worden Alexandra Z. Globale distributionsmønstre af distinkte klader af den fotosyntetiske picoeukaryote Ostreococcus  // The ISME Journal. - 2011. - 3. februar ( bind 5 , nr. 7 ). - S. 1095-1107 . — ISSN 1751-7362 . - doi : 10.1038/ismej.2010.209 .
  7. ↑ 1 2 3 4 Yau S. , Hemon C. , Derelle E. , Moreau H. , Piganeau G. , Grimsley N. A Viral Immunity Chromosome in the Marine Picoeukaryote, Ostreococcus tauri.  (engelsk)  // PLoS patogener. - 2016. - Bd. 12, nr. 10 . — P. e1005965. - doi : 10.1371/journal.ppat.1005965 . — PMID 27788272 .
  8. ↑ Derelle E. , Ferraz C. , Rombauts S. , Rouze P. , Worden AZ , Robbens S. , Partensky F. , Degroeve S. , Echeynie S. , Cooke R. , Saeys Y. , Wuyts J. , Jabbari K. , Bowler C. , Panaud O. , Piegu B. , Ball SG , Ral J.-P. , Bouget F.-Y. , Piganeau G. , De Baets B. , Picard A. , Delseny M. , Demaille J. , Van de Peer Y. , Moreau H. Genomanalyse af den mindste fritlevende eukaryot Ostreococcus tauri afslører mange unikke egenskaber   // Proceedings of National Academy of Sciences. - 2006. - 25. juli ( bd. 103 , nr. 31 ). - P. 11647-11652 . — ISSN 0027-8424 . - doi : 10.1073/pnas.0604795103 .
  9. ↑ Blanc-Mathieu Romain , Verhelst Bram , Derelle Evelyne , Rombauts Stephane , Bouget François-Yves , Carré Isabelle , Château Annie , Eyre-Walker Adam , Grimsley Nigel , Moreau Hervé , Piégu Benoit , Rivals Pe Wendy Y , Schack , Piganeau Gwenaël. Et forbedret genom af model-marinalgen Ostreococcus tauri udfolder sig ved at vurdere Illumina de novo-samlinger  //  BMC Genomics. - 2014. - Bd. 15 , nr. 1 . — S. 1103 . — ISSN 1471-2164 . - doi : 10.1186/1471-2164-15-1103 .
  10. ↑ 1 2 Palenik B. , Grimwood J. , Aerts A. , Rouze P. , Salamov A. , Putnam N. , Dupont C. , Jorgensen R. , Derelle E. , Rombauts S. , Zhou K. , Otillar R. , Merchant SS , Podell S. , Gaasterland T. , Napoli C. , Gendler K. , Manuell A. , Tai V. , Vallon O. , Piganeau G. , Jancek S. , Heijde M. , Jabbari K. , Bowler C. . , Lohr M. , Robbens S. , Werner G. , Dubchak I. , Pazour GJ , Ren Q. , Paulsen I. , Delwiche C. , Schmutz J. , Rokhsar D. , Van de Peer Y. , Moreau H. , Grigoriev IV Den lille eukaryot Ostreococcus giver genomisk indsigt i paradokset ved planktonspeciering  //  Proceedings of the National Academy of Sciences. - 2007. - 25. april ( bind 104 , nr. 18 ). - P. 7705-7710 . — ISSN 0027-8424 . - doi : 10.1073/pnas.0611046104 .
  11. ↑ 12 Ostreococcus . _ Hentet 31. januar 2017. Arkiveret fra originalen 15. juli 2015.
  12. ↑ Krumholz Elias W. , Yang Hong , Weisenhorn Pamela , Henry Christopher S. , Libourel Igor GL Genomfattende metabolisk netværksrekonstruktion af picoalgaen Ostreococcus  // Journal of Experimental Botany. - 2011. - 29. december ( bd. 63 , nr. 6 ). - S. 2353-2362 . — ISSN 1460-2431 . doi : 10.1093 / jxb/err407 .
  13. ↑ Ostreococcus  . _ AlgaeBase: Taxonomy Browser .  (Få adgang: 3. februar 2017) .
  14. ↑ Subirana Lucie , Péquin Bérangère , Michely Stéphanie , Escande Marie-Line , Meilland Julie , Derelle Evelyne , Marin Birger , Piganeau Gwenaël , Desdevises Yves , Moreau Hervé , Grimsley Nigel H. Morphology, Geneve Plasticity and Genveal Plasticity Kryptiske arter, O. mediterraneus sp. nov. (Mamiellales, Mamiellophyceae)  (engelsk)  // Protist. - 2013. - September ( bind 164 , nr. 5 ). - S. 643-659 . — ISSN 1434-4610 . - doi : 10.1016/j.protis.2013.06.002 .

Links