MDGrape-3 er en supercomputer designet til at løse problemer med molekylær dynamik , nemlig modellering af proteinfoldning . På tidspunktet for ibrugtagning havde den en rekord teoretisk ydeevne på 1000 billioner operationer i sekundet.
MDGrape-3 er udviklet på det japanske forskningsinstitut RIKEN ( Yokohama ) med teknisk support fra SGI Japan og den japanske afdeling af Intel .
MDGrape-3 blev første gang officielt præsenteret den 24. juni 2006 .
MDGrape-3 er baseret på MDGrape- 3 processorer fremstillet af Hitachi , der giver en ydeevne på 230 Gflops hver. Et computermodul indeholder 24 sådanne processorer, og hele systemet består af 201 moduler.
Hovedprocessorkernen drives af to grupper af servere baseret på Intel-processorer: en klynge på 64 parallelle servere med dual-core processorer (i alt 256 processorkerner) Intel Xeon ( Dempsey ) og en anden klynge på 37 servere (74 enkelt- kerne Xeon-processorer 3,2 GHz). Samlingen af alle disse computere til et enkelt massivt parallelt system blev udført af SGI Japan.
På tidspunktet for idriftsættelsen var MDGrape-3 næsten tre gange så produktiv som den "hurtigste computer på planeten", den amerikanske IBM BlueGene / L , placeret på Livermore Laboratory. Lawrence . Men på grund af det faktum, at MDGrape-3 ikke er en almindelig computer, er det svært at måle dens ydeevne ved hjælp af Linpack -testen (løsning af store lineære ligninger). Og da systemer af verdens supercomputer-vurdering Top500 fortsætter med at rangere på grundlag af Linpack , deltager det ikke i denne vurdering.