MAP1LC3A

Tilgængelige strukturer

Ortholog søgning: PDBe RCSB

Liste over PDB-id'er
3ECI , 3WAL , 3WAN , 4ZDV

Identifikatorer

Symboler

MAP1LC3A , ATG8E, LC3, LC3A, MAP1ALC3, MAP1BLC3, mikrotubuli associeret protein 1 let kæde 3 alfa

Eksterne ID'er

OMIM: 601242 MGI: 1915661 HomoloGene: 12021 GeneCards: 84557

Gen-ontologi
Funktioner	• phosphatidylethanolaminbinding • GO:0001948, GO:0016582 plasmaproteinbinding • phospholipidbinding • ubiquitinproteinligasebinding • mikrotubulibinding
celle komponent	• cytoplasma • organelmembran • cytosol • sent endosom • membran • autophagosom • mikrotubuli • cytoskelet • GO:0016023 cytoplasmatisk vesikel • endomembransystem • autolysosom • autophagosom membran • synapse
biologisk proces	• Autofagi • Mitofagi • autophagosomsamling • respons på jern(II)-ion • respons på blyion • respons på næringsstofniveauer • cellulær respons på aminosyresult • respons på morfin • cellulær respons på hydrogenperoxid • cellulær respons på kobberion • cellulær reaktion på nitrogensult • cellulær reaktion på sult • makroautofagi • GO:0000046 autophagosommodning
Kilder: Amigo / QuickGO

ortologer

Slags

Human

Mus

Entrez


84557


66734

Ensemble


ENSG00000101460


ENSMUSG00000027602

UniProt


Q9H492


Q91VR7

RefSeq (mRNA)


NM_032514 NM_181509


NM_025735

RefSeq (protein)


NP_115903 NP_852610


NP_080011

Locus (UCSC)

Chr 20: 34,55 – 34,56 Mb

Chr 2: 155,12 – 155,12 Mb

PubMed- søgning

[en]

[2]

Rediger (menneske)

Rediger (mus)

MAP1LC3A ( Mikrotubuli - associerede proteiner 1A/1B let kæde 3A ) er et protein fra autofagicellesystemet , et produkt af det humane MAP1LC3A - gen [1] [2] [3] . Det er en ortolog af gærproteinet Atg8 [4] .

Struktur

Proteinet består af 121 aminosyrer , molekylvægt 14,3 kDa.

Funktioner

MAP1A- og MAP1B - proteinerne er mikrotubuli -associerede proteiner og giver fysisk interaktion mellem mikrotubuli og cytoskeletkomponenter . MAP1A og MAP1B er underenheder med tunge kæder, som hver især kan binde til flere lette kæder (LC1, LC2, LC3). MAP1LC3A (LC3) lette kæde kan interagere med begge tunge kæder [3] .

Ubiquitin -lignende protein, der er involveret i dannelsen af autofagosomer [5] [6] . LC3 spiller en rolle i fagophormembranforlængelse, mens GABARAP/GATE-16 underfamilieproteiner er kritiske på et senere tidspunkt i autophagosommodning [5] .

Noter

↑ Mann SS, Hammarback JA Genlokalisering og udviklingsekspression af let kæde 3: en fælles underenhed af mikrotubuli-associeret protein 1A(MAP1A) og MAP1B // J Neurosci Res : journal. - 1997. - Maj ( bind 43 , nr. 5 ). - S. 535-544 . - doi : 10.1002/(SICI)1097-4547(19960301)43:5<535::AID-JNR3>3.0.CO;2-J . — PMID 8833088 .
↑ Pankiv S., Clausen TH, Lamark T., Brech A., Bruun JA, Outzen H., Overvatn A., Bjorkoy G., Johansen T. p62/SQSTM1 binder direkte til Atg8/LC3 for at lette nedbrydning af ubiquitinerede proteinaggregater ved autophagy (engelsk) // J Biol Chem : journal. - 2007. - August ( bind 282 , nr. 33 ). - P. 24131-24145 . - doi : 10.1074/jbc.M702824200 . — PMID 17580304 .
↑ 1 2 Entrez-gen: MAP1LC3A mikrotubuli-associeret protein 1 let kæde 3 alfa . Arkiveret fra originalen den 5. december 2010. (ubestemt)
↑ Valente G., Morani F., Nicotra G., Fusco N., Peracchio C., Titone R., Alabiso O., Arisio R., Katsaros D., Benedetto C., Isidoro C. Udtryk og klinisk betydning af autophagy proteiner BECLIN 1 og LC3 i ovariecancer // Biomed Res Int : journal. - 2014. - Bd. 2014 . — S. 462658 . - doi : 10.1155/2014/462658 . — PMID 25136588 .
↑ 1 2 Cherra SJ, Kulich SM, Uechi G., Balasubramani M., Mountzouris J., Day BW et al. Regulering af autofagproteinet LC3 ved fosforylering. (engelsk) // J Cell Biol : journal. - 2010. - Bd. 190 , nr. 4 . - S. 533-539 . - doi : 10.1083/jcb.201002108 . — PMID 20713600 .
↑ Suzuki H., Tabata K., Morita E., Kawasaki M., Kato R., Dobson RC et al. Strukturelt grundlag for det autofagi-relaterede LC3/Atg13 LIR-kompleks: genkendelses- og interaktionsmekanisme. (engelsk) // Struktur: tidsskrift. - 2014. - Bd. 22 , nr. 1 . - S. 47-58 . - doi : 10.1016/j.str.2013.09.023 . — PMID 24290141 .

Litteratur

Snásel J., Pichová I. Spaltningen af værtscelleproteiner med HIV-1-protease. (engelsk) // Folia Biol. (Praha): dagbog. - 1997. - Bd. 42 , nr. 5 . - S. 227-230 . - doi : 10.1007/BF02818986 . — PMID 8997639 .
Wallin M., Deinum J., Goobar L., Danielson UH Proteolytisk spaltning af mikrotubuli-associerede proteiner med retrovirale proteinaser // Journal of General Virology : journal. — Mikrobiologisk Selskab, 1990. - Vol. 71 , nr. 9 . - S. 1985-1991 . — doi : 10.1099/0022-1317-71-9-1985 . — PMID 2212989 .
Schoenfeld TA, McKerracher L., Obar R., Vallee RB MAP 1A og MAP 1B er strukturelt beslægtede mikrotubulus-associerede proteiner med distinkte udviklingsmønstre i CNS // J. Neurosci. : journal. - 1989. - Bd. 9 , nr. 5 . - P. 1712-1730 . - doi : 10.1523/JNEUROSCI.09-05-01712.1989 . — PMID 2470876 .
Mann SS, Hammarback JA Molekylær karakterisering af let kæde 3. En mikrotubuli-bindende underenhed af MAP1A og MAP1B // J. Biol. Chem. : journal. - 1994. - Bd. 269 , nr. 15 . - P. 11492-11497 . — PMID 7908909 .
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA DNA-kloning under anvendelse af in vitro stedspecifik rekombination // Genome Res . : journal. - 2001. - Bd. 10 , nej. 11 . - S. 1788-1795 . - doi : 10.1101/gr.143000 . — PMID 11076863 .
Wiemann S., Weil B., Wellenreuther R., et al. Mod et katalog over menneskelige gener og proteiner: sekventering og analyse af 500 nye komplette proteinkodende humane cDNA'er // Genome Res . : journal. - 2001. - Bd. 11 , nr. 3 . - S. 422-435 . - doi : 10.1101/gr.GR1547R . — PMID 11230166 .
Bonnet C., Boucher D., Lazereg S., et al. Differentiel bindingsregulering af mikrotubuli-associerede proteiner MAP1A, MAP1B og MAP2 ved tubulin polyglutamylering // J. Biol. Chem. : journal. - 2001. - Bd. 276 , nr. 16 . - P. 12839-12848 . - doi : 10.1074/jbc.M011380200 . — PMID 11278895 .
Deloukas P., Matthews LH, Ashurst J., et al. DNA-sekvensen og sammenlignende analyse af humant kromosom 20 // Nature: journal. - 2002. - Bd. 414 , nr. 6866 . - s. 865-871 . - doi : 10.1038/414865a . — PMID 11780052 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. Generering og indledende analyse af mere end 15.000 fuldlængde humane og muse cDNA-sekvenser // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal . - 2003. - Bd. 99 , nr. 26 . - P. 16899-16903 . - doi : 10.1073/pnas.242603899 . — PMID 12477932 .
He H., Dang Y., Dai F., et al. Post-translationelle modifikationer af tre medlemmer af den humane MAP1LC3-familie og påvisning af en ny type modifikation for MAP1LC3B // J. Biol. Chem. : journal. - 2003. - Bd. 278 , nr. 31 . - P. 29278-29287 . - doi : 10.1074/jbc.M303800200 . — PMID 12740394 .
Tanida I., Sou YS, Ezaki J., et al. HsAtg4B/HsApg4B/autophagin-1 spalter carboxyltermini af tre humane Atg8-homologer og delipiderer mikrotubuli-associeret protein let kæde 3- og GABAA receptor-associeret protein-phospholipid konjugater // J. Biol. Chem. : journal. - 2004. - Bd. 279 , nr. 35 . - P. 36268-36276 . - doi : 10.1074/jbc.M401461200 . — PMID 15187094 .
Kouno T., Mizuguchi M., Tanida I., et al. 1H, 13C og 15N resonanstildelinger af humant mikrotubuli-associeret protein let kæde-3 // J. Biomol . NMR : journal. - 2005. - Bd. 29 , nr. 3 . - S. 415-416 . - doi : 10.1023/B:JNMR.0000032505.99071.ea . — PMID 15213446 .
Goehler H., Lalowski M., Stelzl U., et al. Et proteininteraktionsnetværk forbinder GIT1, en forstærker af huntingtin-aggregation, til Huntingtons sygdom // Mol . celle : journal. - 2004. - Bd. 15 , nr. 6 . - S. 853-865 . - doi : 10.1016/j.molcel.2004.09.016 . — PMID 15383276 .
Gerhard DS, Wagner L., Feingold EA, et al. Status, kvalitet og udvidelse af NIH fuldlængde cDNA-projektet: Mammalian Gene Collection (MGC ) // Genome Res. : journal. - 2004. - Bd. 14 , nr. 10B . - S. 2121-2127 . - doi : 10.1101/gr.2596504 . — PMID 15489334 .
Wiemann S., Arlt D., Huber W., et al. Fra ORFeome til biologi: A Functional Genomics Pipeline // Genome Res . : journal. - 2004. - Bd. 14 , nr. 10B . - S. 2136-2144 . - doi : 10.1101/gr.2576704 . — PMID 15489336 .
Kouno T., Mizuguchi M., Tanida I., et al. Opløsningsstruktur af mikrotubuli-associeret protein let kæde 3 og identifikation af dets funktionelle underdomæner // J. Biol. Chem. : journal. - 2005. - Bd. 280 , nr. 26 . - P. 24610-24617 . - doi : 10.1074/jbc.M413565200 . — PMID 15857831 .
Sou YS, Tanida I., Komatsu M., et al. Phosphatidylserin er ud over phosphatidylethanolamin et in vitro-mål for pattedyrs Atg8-modifikatorer, LC3, GABARAP og GATE-16 // J. Biol. Chem. : journal. - 2006. - Bd. 281 , nr. 6 . - S. 3017-3024 . - doi : 10.1074/jbc.M505888200 . — PMID 16303767 .
Mehrle A., Rosenfelder H., Schupp I., et al. LIFEdb-databasen i 2006 // Nucleic Acids Res . : journal. - 2006. - Bd. 34 , nr. Database problem . - P.D415-8 . doi : 10.1093 / nar/gkj139 . — PMID 16381901 .