Bradyrhizobium japonicum

Bradyrhizobium japonicum

Bradyrhizobium japonicum stamme USDA 110 på en agarplade
videnskabelig klassifikation
Domæne:bakterieType:ProteobakterierKlasse:Alfa proteobakterierBestille:RhizobiumFamilie:BradyrhizobiaceaeSlægt:BradyrhizobiumUdsigt:Bradyrhizobium japonicum
Internationalt videnskabeligt navn
Bradyrhizobium japonicum
( Kirchner 1896 ) Jordan 1982
Synonymer
  • Rhizobacterium japonicum
    Kirchner 1896
  • Rhizobium japonicum
    (Kirchner 1896) Buchanan 1926     [1]

Bradyrhizobium japonicum   (lat.) er en art af knudebakterier , en saprofytisk nitrogenfikserende sojabønne-symbiont ( Glycine max ). En af de økonomisk vigtigste bakteriearter [2] .

Beskrivelse

Gram -negativ stav -formet bakterie. Som andre arter af slægten vokser Bradyrhizobium langsomt i kultur og alkaliserer mediet uden serum. Siden 2002 har der været en genomsekvens for B. japonicum . Genomstørrelsen er 9105828 basepar, indholdet af GC-sekvenser er omkring 64,1% [3] .

B. japonicum er i stand til at nedbryde catechin til dannelse af phloroglucinsyre , som derefter decarboxyleres til phloroglucinum , som dehydroxyleres til resorcinol . Resorcinol hydroxyleres til gengæld for at danne hydroxyquinol [4] .

Nitratånde

B. japonicum besidder nosRZDFYLX -genet , som koder for et enzym involveret i denitrifikation. Dette enzym har to katalytiske underenheder, Cu-a og Cu-z (med flere histidinrester). Det udløser en sekventiel genekspressionskaskade, omtalt som 'FixJ-FixK2-FixK1', som er følsom over for iltkoncentration. FixJ regulerer positivt FixK2, som aktiverer nitratrespirationsgener, samt FixK1-proteinet. FixK1-mutanter er ikke i stand til nitrat-respiration på grund af en defekt i den kobberholdige katalytiske underenhed (Cu-z) i nosRZDFYLX -genet [5] .

Brug

Denne bakterie bruges ofte som modelorganisme til undersøgelse af respiratoriske enzymer [6] . B. japonicum stamme USDA 110, som først blev isoleret fra sojaknuder i Florida, USA, i 1957, er meget brugt til forskning inden for molekylær genetik, fysiologi og økologi [7] . Dette skyldes, at stammen B. japonicum USDA110 har et højere niveau af nitrogenfiksering end andre stammer [7] .

Noter

  1. ↑ Overførsel af Rhizobium japonicum Buchanan 1980 til Bradyrhizobium gen. nov., en slægt af langsomtvoksende rodknoldebakterier fra bælgplanter. Int. J. Syst. Bacteriol., 1982, 32, 136-139.
  2. ↑ AB Hollis, WE Kloos & GE Elkan. DNA:DNA hybridiseringsundersøgelser af Rhizobium japonicum og beslægtede   Rhizobiaceae // Mikrobiologi. — Mikrobiologisk Selskab, 1981. - Vol. 123 . - S. 215-222 . - doi : 10.1099/00221287-123-2-215 .
  3. ↑ Takakazu Kaneko, Yasukazu Nakamura, Shusei Sato, Kiwamu Minamisawa, Toshiki Uchiumi, Shigemi Sasamoto, Akiko Watanabe, Kumi Idesawa, Mayumi Iriguchi, Kumiko Kawashima, Mitsuyo Kohara, Midori Matsumoto, Sayau Shimpo, Sayau Shima, Washia, Shikau, Tshima, Shikau, Tshima, Shikau, Tshima tabata. Komplet genomisk sekvens af nitrogenfikserende symbiotisk bakterie Bradyrhizobium japonicum USDA110   : tidsskrift . - 2002. - S. 189-197 .
  4. ↑ Waheeta Hopper & A. Mahadevan. Nedbrydning af catechin af Bradyrhizobium japonicum  (engelsk)  : tidsskrift. – 1997.
  5. ↑ D. Nellen-Anthamatten, P. Rossi et al. Bradyrhizobium japonicum, FixK2, en afgørende distributør i den FixLJ-afhængige regulatoriske kaskade til kontrol af gener, der kan induceres af lave iltniveauer  //  [Journal of Bacteriology] : tidsskrift. - 1998. - Bd. 180 , nr. 19 . - P. 5251-5255 .
  6. ↑ Westenberg, DJ Bradyrhizobium japonicum (utilgængeligt link) . Missouri University of Science and Technology (2008). Hentet 11. juli 2011. Arkiveret fra originalen 16. september 2012. 
  7. ↑ 1 2 [EBI] European Bioinfomatics Institute Bacteria Genomes - BRADYRHIZOBIUM JAPONICUM . European Bioinfomatics Institute (2011). Hentet 12. juli 2011. Arkiveret fra originalen 14. maj 2011.