Shintoministeriet ( Jap. 神祇省jingi-sho:) er det centrale regeringsagentur i Japan under Meiji-perioden , et ministerium, der var engageret i forkyndelsen af Shinto , kompilering og koordinering af denne religions ritualer. Eksisterede i 1871-1872 . _
Shintoministeriet blev dannet den 22. september 1871 fra Shintorådet . Det var underordnet det øverste statsråd , den centrale kejserlige regering i Japan.
Ministeriet havde ikke en minister, og blev ledet af hans stedfortræder. Sidstnævntes stilling blev besat af Fukuba Bisei .
Ministeriets første prioritet var reformen af Shinto, som bestod i at gøre det til landets statsreligion. Afdelingens aktiviteter blev ledsaget af forfølgelse af buddhister og kristne , hvilket forårsagede protester både hjemme og i udlandet. I denne henseende skrinlagde regeringen ideen om nationalisering af Shinto og likviderede den 21. april 1872 ministeriet. I stedet blev der oprettet et nyt japansk ministerium for religioner .