Epigenetisk ur

Det epigenetiske ur er et sæt af epigenetiske DNA-mærker , der bestemmer den biologiske alder af et væv, en celle eller et organ. Det bedst kendte eksempel på et epigenetisk ur er Steve Horvaths ur, som tager højde for 353 epigenetiske markører af det menneskelige genom [1] [2] [3] . Der er også udviklet andre versioner af det epigenetiske ur: K. Weidners ur, baseret på methylering af tre CpG-dinukleotider [4] , I. Florats ur [5] , G. Hannums komplekse ur [6] og K. Giulianis ur, hvis indikator er beregnet ud fra methyleringen af ​​tre gener i DNA-prøver fra dentin [7] .

Opdagelseshistorie

Den betydelige indflydelse af alder på niveauet af DNA-methylering har været kendt siden 1960'erne [8] . Et stort antal værker beskriver sæt af CpG-dinukleotider, hvis methylering korrelerer med alderen [9] [10] [11] . Adskillige værker er afsat til vurdering af biologisk alder ved DNA-methylering i spyt [12] eller blod [6] .

Baggrund for skabelsen af ​​det epigenetiske ur

Alder er en af ​​kroppens grundlæggende egenskaber, og derfor finder biomarkører for aldring mange anvendelser i biologisk forskning. Det biologiske ur for aldring kan bruges på følgende områder:

Generelt kan det biologiske ur være nyttigt til at undersøge årsagerne til aldring og bekæmpe det.

Forbindelse med årsagerne til biologisk aldring

Det er ikke helt klart, hvad der præcist måles af det epigenetiske ur. Professor Horvaths hypotese var, at alderen opnået fra beregningsresultaterne afspejler den samlede effekt af systemerne til at indføre epigenetiske modifikationer af kroppen. De fleste aldersrelaterede ændringer i DNA-methylering er vævsspecifikke, med undtagelse af methylering af ELOVL2-genpromotoren, der fungerer som hovedregulatoren for syntesen (forlængelsen) af polyumættede fedtsyrer (PUFA'er), der er nødvendige for en effektiv funktion af endoplasmatisk retikulum og mitokondrier [13] [14] . Derfor blev der udviklet forenklede versioner af det epigenetiske ur, der er universelt for alle væv, baseret på aldersbestemmelse ved graden af ​​methylering af kun én CpG i ELOVL2-genet [15] [16] .

Alder beregnet ud fra DNA-methylering forudsiger dødelighed af alle årsager i alderdommen [17] [18] , hvilket tyder på en sammenhæng mellem methylering og årsagen til menneskelig aldring [17] . Det er dog usandsynligt, at CpG-parrene anvendt i 353-metoden direkte spiller en rolle i ældningsprocessen [1] . Det er mere sandsynligt, at det epigenetiske ur registrerer den systemiske effekt af epigenomet. Det er afgørende, at det epigenetiske ur har vist, at " aldring faktisk er evolutionært bevaret og relateret til udviklingsprocesser i alle pattedyrarter." [19] [20]

For at forstå essensen af ​​det epigenetiske ur, ville det være rimeligt at sammenligne og finde de underliggende processer, der medierer forholdet mellem aflæsningerne af det epigenetiske ur og det aldrende ur på basis af transkriptomet [21] [22] [23] [ 24] [25] , samt på baggrund af proteomdata. [26] [27] [28] [29] Ifølge forfatterne af det proteomiske ur forudsagde deres proteomiske aldersmodel dødelighed mere præcist end kronologisk alder og skrøbelighedsindeks . [30] [29] Den proteomiske urmetode er baseret på SomaScan-teknologien, der måler fluorescensen af ​​aptamerer bundet til målproteiner. Med disse aptamerer, skabt ved hjælp af en alsidig kemisk teknologi, der forsyner nukleotider med proteinlignende funktionelle grupper til at opdage biomarkørproteiner, kan tusindvis af proteiner måles samtidigt (og meget billigt) i små prøvevolumener (15 µl serum eller plasma). [31] Vigtigst er det, ved at analysere data om de proteiner, der er kraftigst ændret med aldring, det er muligt at finde og evaluere effektiviteten af ​​målrettede anti-aldringslægemidler. [29]

Det har vist sig, at de fleste aldersrelaterede CpG'er sameksisterer med udviklingsgener, og aldring kan være ledsaget af øget ekspression af udviklingsgener. [32] [29] Følgelig findes disse CpG'er i bivalente kromatindomæner og mål for undertrykte polycombs , som er elementer, der styrer ekspressionen af ​​udviklingsgener . Mens øget methylering af CpG'er ved forstærkere sandsynligvis undertrykker genekspression, kan methylering af CpG'er ved bivalente kromatindomæner på den anden side stimulere ekspressionen af ​​de tilsvarende nedstrøms loci , som ofte er udviklingsgener. [32] [19]

Horvaths epigenetiske ur

Horvath Epigenetic Clock blev udviklet af Steve Horvath, professor i human genetik og biostatistik ved UCLA. En artikel om dette emne blev første gang publiceret den 21. oktober 2013 i tidsskriftet Genome Biology [1] . Horvath har indsamlet åbne data om human DNA-methylering i over 4 år og har identificeret passende statistiske metoder. Historien om denne opdagelse blev dækket i tidsskriftet Nature [33] . Uret blev udviklet ved hjælp af 8.000 prøver fra 82 DNA-methyleringsdatasæt genereret af Illumina -platformen . Det vigtigste innovative træk ved Horvaths epigenetiske ur er dets brede vifte af anvendelighed. De tillader forudsigelse af alder uanset væv uden at indføre yderligere justeringer [1] . Denne funktion gør det muligt at sammenligne den biologiske alder af forskellige væv i den samme organisme ved hjælp af det samme aldrende ur.

Udtrykket "ur" er i dette tilfælde defineret som en metode til at estimere alder baseret på 353 epigenetiske DNA-markører. Det indstillede indeks har følgende karakteristika: for det første er det tæt på nul i embryonale og inducerede stamceller , for det andet korrelerer det med cellepassagenummer, og for det tredje er metoden anvendelig til chimpansevæv (som bruges som analoger til humant væv i nogle undersøgelser).

Væksten af ​​organismen (og samtidig celledeling) fører til en høj hastighed af "løb" af det epigenetiske ur, som falder til en konstant værdi (lineær afhængighed) efter en person når 20 år [1] . Mange fysiologiske og mentale indikatorer for aldring korrelerer med det epigenetiske ur [34] .

Den gennemsnitlige fejl i aldersbestemmelse er 3,6 år på tværs af en lang række væv og celletyper [1] . Metoden fungerer godt både i heterogene væv og i individuelle cellelinjer. Alder forudsagt af Horvath-metoden har Pearsons korrelationskoefficient lig med r=0,96 med kronologisk alder [1] , hvilket er meget tæt på den maksimale værdi - en.

Der er en online-beregner , hvor du kan downloade genom-methyleringsdata og få et skøn over epigenetisk alder ved hjælp af Howarth-metoden.

Hannums epigenetiske ur

Samme år som artiklen om Horvaths epigenetiske ur blev en anden lignende undersøgelse publiceret [6] . Forfatterne, herunder Gregory Hannum, byggede en model til at kvantificere aldring ved hjælp af målinger af mere end 450.000 CpG-dinukleotider fra blodceller fra mennesker i alderen 19 til 101 år. Af de mange CpG'er blev 71 positioner identificeret ved statistiske metoder, hvorefter den endelige model til beregning af alderen blev bygget. Ifølge forfatterne er hastigheden af ​​epigenetisk aldring påvirket af menneskelig køn og genomvariation.

Det originale arbejde siger, at modellen ikke kun virker for blodceller, men også i andre væv. Nogle senere værker understreger dog, at Hannums ur er specifikt for blod, mens Horvaths ur kan anvendes på en lang række prøver [35] . Der er også værker, der henviser til de epigenetiske ure fra Horvath og Hannum som ækvivalente [36] [37] . I en undersøgelse af en lille gruppe af 100-årige gav Hannums ur mere nøjagtige estimater af alder ud fra leukocyt-DNA-methyleringsdata end Horvats ur [35] .

Epigenetisk ur baseret på et lille antal CpG-steder

Selvom ure, der bruger hundredvis af CpG-steder, mere nøjagtigt kan afspejle biologisk alder, er deres praktiske brug kompliceret af deres omkostninger. Derfor er flere versioner af det epigenetiske ur baseret på et lille antal CpG-steder blevet udviklet med samme eller endda øget nøjagtighed [38] [39] . Reduktion af antallet af CpG-steder gør det også muligt at standardisere og gøre sammenlignelige resultater opnået af forskellige laboratorier [40] [41] , samt at bruge maskinlæringsmetoder til at skabe nye, mere nøjagtige ure [42] [43] . De gener, der hyppigst anvendes i sådanne ure, er: ELOVL2 (site cg16867657) [44] [45] [46] samt EDARADD [ 47] [41] , C1orf132 , TRIM59, FHL2 og KLF14 [49] [38]

Andre versioner af det biologiske ur

Der er et biologisk ur baseret på a) telomerlængde b) p16INK4a-ekspressionsniveau [50] c) mutationer i mikrosatellitter [51] . Korrelationen i tilfælde (a) er r=-0,51 for kvinder og r=-0,55 for mænd [52] . Korrelation mellem p16INK4a-ekspression i T-celler r=0,56 [53] . Et lovende biologisk ur er "eyeAge" retinals aldrende ur fra fundusfotografier , udviklet med en deep learning computermodel, der er i stand til at forudsige menneskelig aldring på mindre end et års tidsskala med 71 % nøjagtighed [54] [55] .

Der har været en række undersøgelser (Wang et al [56] , Petkovic et al [57] ), der undersøger, om mus har ændringer i methyleringsmønstre svarende til mennesker med alderen. Forskerne fandt ud af, at musenes epigenetiske alder kunstigt steg i levetid (gennem kaloriekontrol eller indtagelse af rapamycin) var signifikant mindre end for en kontrolgruppe på samme alder.

Et epigenetisk ur designet til at forudsige alder hos mus er baseret på 329 unikke CpG-dinukleotider og har en gennemsnitlig absolut fejl på 4 uger (5% af levetiden). Forsøg på at bruge menneskelige ure i mus har vist, at menneskelige ure ikke er fuldstændig konservative hos mus. Forskelle i muse- og menneskeure tyder på, at epigenetiske ure bør kalibreres separat for forskellige arter.

En lovende retning synes at være udviklingen af ​​et epigenetisk ur til at bestemme alderen på vilde dyr og husdyr [58] .

Se også

Links

  1. ↑ 1 2 3 4 5 6 7 Steve Horvath. DNA-methyleringsalder af humane væv og celletyper  (engelsk)  // BioMed Central. — 2013-12-10. — Bd. 14 . — S. 3156 . — ISSN 1474-760X . - doi : 10.1186/gb-2013-14-10-r115 .
  2. ↑ Steve Horvath. Erratum til: DNA-methyleringsalder af humane væv og celletyper  (engelsk)  // BioMed Central. — 2015-05-13. — Bd. 16 . — S. 96 . — ISSN 1465-6906 . - doi : 10.1186/s13059-015-0649-6 .
  3. ↑ Videnskabsmand afslører internt ur, der er i stand til at måle alderen på de fleste menneskelige væv; Kvinders brystvæv ældes hurtigere end resten af  ​​kroppen , ScienceDaily . Hentet 30. november 2017.
  4. ↑ Carola Ingrid Weidner, Qiong Lin, Carmen Maike Koch, Lewin Eisele, Fabian Beier. Ældning af blod kan spores af DNA-methyleringsændringer på kun tre CpG-steder  //  BioMed Central. - 2014-02-03. — Bd. 15 . — P.R24 . — ISSN 1474-760X . - doi : 10.1186/gb-2014-15-2-r24 .
  5. ↑ Ines Florath, Katja Butterbach, Heiko Müller, Melanie Bewerunge-Hudler, Hermann Brenner. Tværsnits- og longitudinelle ændringer i DNA-methylering med alderen: en epigenom-dækkende analyse, der afslører over 60 nye aldersassocierede CpG-steder  // Human Molecular Genetics. — Oxford University Press , 2014-03-01. - T. 23 , nej. 5 . - S. 1186-1201 . — ISSN 0964-6906 . doi : 10.1093 / hmg/ddt531 .
  6. ↑ 1 2 3 Gregory Hannum, Justin Guinney, Ling Zhao, Li Zhang, Guy Hughes. Genomomfattende methyleringsprofiler afslører kvantitative syn på menneskelig aldring  // Molecular Cell. - T. 49 , no. 2 . - S. 359-367 . - doi : 10.1016/j.molcel.2012.10.016 .
  7. ↑ Cristina Giuliani, Elisabetta Cilli, Maria Giulia Bacalini, Chiara Pirazzini, Marco Sazzini. Udledning af kronologisk alder fra DNA-methyleringsmønstre af menneskelige tænder  (engelsk)  // American Journal of Physical Anthropology. — 2016-04-01. — Bd. 159 , udg. 4 . - S. 585-595 . — ISSN 1096-8644 . - doi : 10.1002/ajpa.22921 .
  8. ↑ GD Berdyshev, GK Korotaev, GV Boiarskikh, BF Vaniushin. [Nukleotidsammensætning af DNA og RNA fra somatiske væv fra pukkelryg og dets ændringer under gydning ] // Biokhimiia (Moskva, Rusland). - september 1967. - T. 32 , no. 5 . - S. 988-993 . — ISSN 0320-9725 .
  9. ↑ Steve Horvath, Yafeng Zhang, Peter Langfelder, René S. Kahn, Marco PM Boks. Aldringseffekter på DNA-methyleringsmoduler i menneskelig hjerne og blodvæv  //  BioMed Central. — 2012-10-03. — Bd. 13 . — P.R97 . — ISSN 1474-760X . - doi : 10.1186/gb-2012-13-10-r97 .
  10. ↑ Vardhman K. Rakyan, Thomas A. Down, Siarhei Maslau, Toby Andrew, Tsun-Po Yang. Menneskelig aldringsassocieret DNA-hypermethylering forekommer fortrinsvis ved bivalente kromatindomæner  //  Genome Research. — 2010-04-01. — Bd. 20 , iss. 4 . - S. 434-439 . — ISSN 1549-5469 1088-9051, 1549-5469 . - doi : 10.1101/gr.103101.109 .
  11. ↑ Andrew E. Teschendorff, Usha Menon, Aleksandra Gentry-Maharaj, Susan J. Ramus, Daniel J. Weisenberger. Aldersafhængig DNA-methylering af gener, der er undertrykt i stamceller, er et kendetegn for kræft  //  Genomforskning. - 2010-04-01. — Bd. 20 , iss. 4 . - S. 440-446 . — ISSN 1549-5469 1088-9051, 1549-5469 . - doi : 10.1101/gr.103606.109 .
  12. ↑ Sven Bocklandt, Wen Lin, Mary E. Sehl, Francisco J. Sánchez, Janet S. Sinsheimer. Epigenetisk prædiktor for alder  (engelsk)  // PLOS One . - Public Library of Science , 2011-06-22. — Bd. 6 , iss. 6 . — P. e14821 . — ISSN 1932-6203 . - doi : 10.1371/journal.pone.0014821 .
  13. ↑ Slieker, RC, Relton, CL, Gaunt, TR, Slagboom, PE, & Heijmans, BT (2018). Aldersrelaterede DNA-methyleringsændringer er vævsspecifikke med ELOVL2-promotormethylering som en undtagelse. Epigenetik og kromatin, 11(1), 1-11. PMID 29848354 PMC 5975493 doi : 10.1186/s13072-018-0191-3
  14. ↑ Li, X., Wang, J., Wang, L., Gao, Y., Feng, G., Li, G., ... & Zhang, K. (2022). Lipidmetabolismedysfunktion induceret af aldersafhængig DNA-methylering fremskynder aldring. Signaltransduktion og målrettet terapi, 7(1), 1-12. PMID 35610223 PMC 9130224 doi : 10.1038/s41392-022-00964-6
  15. ↑ Garagnani, P., Bacalini, MG, Pirazzini, C., Gori, D., Giuliani, C., Mari, D., ... & Franceschi, C. (2012). Methylering af ELOVL2-gen som en ny epigenetisk aldersmarkør. Aging cell, 11(6), 1132-1134. PMID 23061750 doi : 10.1111/acel.12005
  16. ↑ Manco, L., & Dias, H.C. (2022). DNA-methyleringsanalyse af ELOVL2-gen ved anvendelse af digital PCR med dråber til aldersvurderingsformål. Forensic Science International, 333, 111206. PMID 35131731 doi : 10.1016/j.forsciint.2022.111206
  17. ↑ 1 2 Brian H. Chen, Riccardo E. Marioni, Elena Colicino, Marjolein J. Peters, Cavin K. Ward-Caviness. DNA-methyleringsbaserede mål for biologisk alder: metaanalyse, der forudsiger tid til død  // Aldring. - T. 8 , nej. 9 . - S. 1844-1865 . - doi : 10.18632/aging.101020 .
  18. ↑ Riccardo E. Marioni, Sonia Shah, Allan F. McRae, Brian H. Chen, Elena Colicino. Blods DNA-methyleringsalder forudsiger dødelighed af alle årsager senere i livet  //  BioMed Central. — 30-01-2015. — Bd. 16 . — S. 25 . — ISSN 1465-6906 . - doi : 10.1186/s13059-015-0584-6 .
  19. ↑ 1 2 Ake T. Lu, Zhe Fei, Amin Haghani, Todd R. Robeck et al., & Steve Horvath (2021). Universal DNA-methyleringsalder på tværs af pattedyrsvæv . biorxiv.org doi : 10.1101/2021.01.18.426733
  20. ↑ Arneson, A., Haghani, A., Thompson, MJ, Pellegrini, M., Kwon, SB, Vu, HT, ... & Horvath, S. (2021). Et pattedyrs methyleringsarray til profilering af methyleringsniveauer ved konserverede sekvenser . bioRxiv, 2021-01. doi : 10.1101/2021.01.07.425637
  21. ↑ Meyer, D., & Schumacher, B. (2020). Et transkriptombaseret aldringsur nær den teoretiske grænse for nøjagtighed . bioRxiv. doi : 10.1101/2020.05.29.123430
  22. ↑ Fleischer, JG, Schulte, R., Tsai, HH, Tyagi, S., Ibarra, A., Shokhirev, MN, ... & Navlakha, S. (2018). Forudsigelse af alder ud fra transkriptomet af humane dermale fibroblaster. Genome biology, 19(1), 221. doi : 10.1186/s13059-018-1599-6 PMC 6300908 PMID 30567591
  23. ↑ Shokhirev, MN, & Johnson, AA (2021). Modellering af det menneskelige aldrende transkriptom på tværs af væv, sundhedsstatus og køn. Aging cell , 20(1), e13280. PMC 7811842 doi : 10.1111/acel.13280
  24. ↑ Wang, F., Yang, J., Lin, H., Li, Q., Ye, Z., Lu, Q., ... & Tian, ​​G. (2020). Forbedret menneskelig aldersforudsigelse ved at bruge genekspressionsprofiler fra flere væv. Frontiers in Genetics, 11. PMC 7546819 doi : 10.3389/fgene.2020.01025
  25. ↑ LaRocca, T.J., Cavalier, A.N., & Wahl, D. (2020). Gentagne elementer som en transkriptomisk markør for aldring: Beviser i flere datasæt og modeller. Aging Cell, 19(7), e13167. PMID 32500641 PMC 7412685 doi : 10.1111/acel.13167
  26. ↑ Lehallier, B., Shokhirev, MN, Wyss-Coray, T., & Johnson, AA (2020). Data mining af humane plasmaproteiner genererer et væld af meget forudsigelige aldringsure, der afspejler forskellige aspekter af aldring. Aldringscelle, 19(11), e13256. PMID 33031577 PMC 7681068 doi : 10.1111/acel.13256
  27. ↑ Johnson, A.A., Shokhirev, MN, Wyss-Coray, T., & Lehallier, B. (2020). Systematisk gennemgang og analyse af ældningsundersøgelser af menneskelig proteomik afslører et nyt proteomisk aldringsur og identificerer nøgleprocesser, der ændrer sig med alderen. Aldringsforskningsanmeldelser, 101070. PMID 32311500 doi : 10.1016/j.arr.2020.101070
  28. ↑ Moaddel, R., Ubaida-Mohien, C., Tanaka, T., Lyashkov, A., Basisty, N., Schilling, B., ... & Ferrucci, L. (2021). Proteomics i aldringsforskning: En køreplan til klinisk, translationel forskning. Aging Cell, e13325. PMID 33730416 doi : 10.1111/acel.13325
  29. ↑ 1 2 3 4 Johnson, A.A., Shokhirev, MN, & Lehallier, B. (2021). Proteininputtet fra et ultraforudsigende aldringsur repræsenterer levedygtige anti-aldringslægemiddelmål. Aging Research Reviews, 70, 101404. PMID 34242807 doi : 10.1016/j.arr.2021.101404
  30. ↑ Sathyan, S., Ayers, E., Gao, T., Weiss, E.F., Milman, S., Verghese, J., & Barzilai, N. (2020). Plasmaproteomisk profil af alder, helbredsspændvidde og dødelighed af alle årsager hos ældre voksne. Aldringscelle, 19(11), e13250. PMID 33089916 PMC 7681045 doi : 10.1111/acel.13250
  31. ↑ Gold, L., Ayers, D., Bertino, J., Bock, C., Bock, A., Brody, E., ,,, & Zichi, D. (2010). Aptamer-baseret multiplekset proteomisk teknologi til biomarkøropdagelse. PLOS One. 2010; 5(12): e15004 PMID 21165148 PMC 3000457 doi : 10.1371/journal.pone.0015004
  32. ↑ 1 2 Horvath, S., Haghani, A., Peng, S., Hales, EN, Zoller, JA, Raj, K., ... & Finno, CJ (2021). DNA-methyleringsældning og transkriptomiske undersøgelser hos heste . bioRxiv. doi : 10.1101/2021.03.11.435032
  33. ↑ W. Wayt Gibbs. Biomarkører og aldring: The clock-watcher   // Nature . — 2014-04-10. — Bd. 508 , udg. 7495 . - S. 168-170 . - doi : 10.1038/508168a .
  34. ↑ Riccardo E. Marioni, Sonia Shah, Allan F. McRae, Stuart J. Ritchie, Graciela Muniz-Terrera. Det epigenetiske ur er korreleret med fysisk og kognitiv kondition i Lothian Birth Cohort 1936  // International Journal of Epidemiology. — 01-08-2015. - T. 44 , no. 4 . - S. 1388-1396 . — ISSN 0300-5771 . - doi : 10.1093/ije/dyu277 .
  35. ↑ 1 2 Nicola J Armstrong, Karen A Mather, Anbupalam Thalamuthu, Margaret J Wright, Julian N Trollor. Aldring, enestående lang levetid og sammenligninger af Hannum og Horvath epigenetiske ure  // Epigenomics. — 2017-05-01. - T. 9 , nej. 5 . - S. 689-700 . — ISSN 1750-1911 . - doi : 10.2217/epi-2016-0179 .
  36. ↑ Meaghan J. Jones, Sarah J. Goodman, Michael S. Kobor. DNA-methylering og menneskelig sund aldring  // Aging Cell  . — 2015-12-01. — Bd. 14 , udg. 6 . - P. 924-932 . — ISSN 1474-9726 . - doi : 10.1111/acel.12349 .
  37. ↑ Michele Zampieri, Fabio Ciccarone, Roberta Calabrese, Claudio Franceschi, Alexander Bürkle. Rekonfiguration af DNA-methylering ved aldring  //  Mechanisms of Aging and Development. — Bd. 151 . - S. 60-70 . - doi : 10.1016/j.mad.2015.02.002 .
  38. ↑ 1 2 Li, A., Mueller, A., English, B., Arena, A., Vera, D., Kane, A.E., & Sinclair, D.A. (2022). Nye funktionsudvælgelsesmetoder til konstruktion af nøjagtige epigenetiske ure. PLoS computational biology, 18(8), e1009938. PMID 35984867 PMC 9432708 doi : 10.1371/journal.pcbi.1009938
  39. ↑ Johnson, AA, Torosin, NS, Shokhirev, MN, & Cuellar, TL (2022). Et sæt almindelige bukkale CpG'er, der forudsiger epigenetisk alder og associerer med levetidsregulerende gener . iScience, 105304. doi : 10.1016/j.isci.2022.105304.
  40. ↑ Weidner, CI, Lin, Q., Koch, CM, Eisele, L., Beier, F., Ziegler, P., ... & Wagner, W. (2014). Ældning af blod kan spores af DNA-methyleringsændringer på kun tre CpG-steder. Genombiologi, 15(2), 1-12. PMID 24490752 PMC 4053864 doi : 10.1186/gb-2014-15-2-r24
  41. ↑ 1 2 Daunay, A., Hardy, LM, Bouyacoub, Y., Sahbatou, M., Touvier, M., Blanché, H., ... & How-Kit, A. (2022). Centenarians præsenterer konsekvent en yngre epigenetisk alder end deres kronologiske alder med fire epigenetiske ure baseret på et lille antal CpG-steder. Aging, 14(19), 7718-7733. PMID 36202132 doi : 10.18632/aging.204316
  42. ↑ Zaguia, A., Pandey, D., Painuly, S., Pal, SK, Garg, VK, & Goel, N. (2022). DNA-methylering biomarkører-baseret menneskelig alder forudsigelse ved hjælp af maskinlæring. Computational Intelligence and Neuroscience, 2022. PMID 35111213 PMC 8803417 doi : 10.1155/2022/8393498
  43. ↑ Fan, H., Xie, Q., Zhang, Z., Wang, J., Chen, X., & Qiu, P. (2021). Kronologisk aldersforudsigelse: udviklingsmæssig evaluering af DNA-methyleringsbaserede maskinlæringsmodeller. Frontiers in bioengineering and biotechnology, 9. PMID 35141217 PMC 8819006 doi : 10.3389/fbioe.2021.819991
  44. ↑ Slieker, RC, Relton, CL, Gaunt, TR, Slagboom, PE, & Heijmans, BT (2018). Aldersrelaterede DNA-methyleringsændringer er vævsspecifikke med ELOVL2-promotormethylering som en undtagelse. Epigenetik og kromatin, 11(1), 1-11. PMID 29848354 PMC 5975493 doi : 10.1186/s13072-018-0191-3
  45. ↑ Garagnani, P., Bacalini, MG, Pirazzini, C., Gori, D., Giuliani, C., Mari, D., ... & Franceschi, C. (2012). Methylering af ELOVL 2-genet som en ny epigenetisk aldersmarkør. Aging cell, 11(6), 1132-1134. PMID 23061750 doi : 10.1111/acel.12005
  46. ↑ Manco, L., & Dias, H.C. (2022). DNA-methyleringsanalyse af ELOVL2-gen ved anvendelse af digital PCR med dråber til aldersvurderingsformål. Forensic Science International, 333, 111206. PMID 35131731 doi : 10.1016/j.forsciint.2022.111206
  47. ↑ Ni, XL, Yuan, HP, Jiao, J., Wang, ZP, Su, HB, Lyu, Y., ... & Yang, Z. (2022). En epigenetisk urmodel til vurdering af den menneskelige biologiske alder af sund aldring. Zhonghua yi xue za zhi, 102(2), 119-124. PMID 35012300 doi : 10.3760/cma.j.cn112137-20210817-01862
  48. ↑ Spólnicka, M., Pośpiech, E., Pepłońska, B., Zbieć-Piekarska, R., Makowska, Ż., Pięta, A., ... & Branicki, W. (2018). DNA-methylering i ELOVL2 og C1orf132 forudsagde korrekt kronologisk alder af individer fra tre sygdomsgrupper. Internationalt tidsskrift for juridisk medicin, 132(1), 1-11. PMID 28725932 PMC 5748441 doi : 10.1007/s00414-017-1636-0
  49. ↑ Jung, SE, Lim, SM, Hong, SR, Lee, EH, Shin, KJ, & Lee, HY (2019). DNA-methylering af generne ELOVL2, FHL2, KLF14, C1orf132/MIR29B2C og TRIM59 til aldersforudsigelse fra blod-, spyt- og mundprøver. Forensic Science International: Genetics, 38, 1-8. PMID 30300865 doi : 10.1016/j.fsigen.2018.09.010
  50. ↑ Manuel Collado, Maria A. Blasco, Manuel Serrano. Cellulær alderdom ved kræft og aldring  (engelsk)  // Cell . — Celle Tryk på . — Bd. 130 , iss. 2 . - S. 223-233 . - doi : 10.1016/j.cell.2007.07.003 .
  51. ↑ Peter Forster, Carsten Hohoff, Bettina Dunkelmann, Marianne Schürenkamp, ​​​​Heidi Pfeiffer. Forhøjet kimlinjemutationsrate hos teenagefædre   // Proc . R. Soc. B. - 2015-03-22. — Bd. 282 , udg. 1803 . — S. 20142898 . — ISSN 1471-2954 0962-8452, 1471-2954 . - doi : 10.1098/rspb.2014.2898 .
  52. ↑ Katarina Nordfjäll, Ulrika Svenson, Karl-Fredrik Norrback, Rolf Adolfsson, Göran Roos. Storstilet forældre-barn-sammenligning bekræfter en stærk faderlig indflydelse på telomerlængden  //  European Journal of Human Genetics. - 2010/03. - T. 18 , no. 3 . - S. 385-389 . — ISSN 1476-5438 . - doi : 10.1038/ejhg.2009.178 .
  53. ↑ Wang, Ye, Zang, Xinjie, Wang, Yao, Chen, Peng. Høj ekspression af p16INK4a og lav ekspression af Bmi1 er forbundet med endotelcellulær senescens i den menneskelige hornhinde . www.molvis.org (3. april 2012). Hentet: 1. december 2017.
  54. ↑ Ahadi S, Wilson KA., Babenko B et al. (2022). Longitudinel fundus-billeddannelse og dens genom-dækkende associationsanalyse giver bevis for et menneskeligt retinalt aldringsur . bioRxiv. doi : 10.1101/2022.07.25.501485
  55. ↑ Le Goallec, A., Diai, S., Collin, S., Vincent, T., & Patel, CJ (2021). Identifikation af de genetiske og ikke-genetiske faktorer forbundet med accelereret øjenaldring ved at bruge dyb læring til at forudsige alder fra fundus og optisk kohærens tomografibilleder . medRxiv.
  56. ↑ Tina Wang, Brian Tsui, Jason F. Kreisberg, Neil A. Robertson, Andrew M. Gross. Epigenetiske ældningssignaturer i muselever bremses af dværgvækst, kaloriebegrænsning og rapamycinbehandling  //  BioMed Central. — 2017-03-28. — Bd. 18 . — S. 57 . — ISSN 1474-760X . - doi : 10.1186/s13059-017-1186-2 .
  57. ↑ Daniel A. Petkovich, Dmitriy I. Podolskiy, Alexei V. Lobanov, Sang-Goo Lee, Richard A. Miller. Brug af DNA-methyleringsprofilering til at evaluere biologiske alders- og levetidsinterventioner  // Cellemetabolisme. - T. 25 , nej. 4 . - S. 954-960.e6 . - doi : 10.1016/j.cmet.2017.03.016 .
  58. ↑ Ricardo De Paoli-Iseppi, Bruce E. Deagle, Clive R. McMahon, Mark A. Hindell, Joanne L. Dickinson. Måling af dyrenes alder med DNA-methylering: Fra mennesker til vilde dyr  //  Frontiers in Genetics. - 2017. - Bd. 8 . - ISSN 1664-8021 . - doi : 10.3389/fgene.2017.00106 .

Litteratur

  Gå til Wikidata-elementet  Ordbøger og encyklopædier