Kimærisk gen

Kimæriske gener (bogstaveligt betyder nukleotidsekvenser bestående af fragmenter af polynukleotider fra forskellige kilder) dannes ved at kombinere dele af to eller flere kodende eller ikke-kodende sekvenser for at producere nye gener med en specifik funktion. Disse mutationer er forskellige fra fusionsgener , som kombinerer hele sekvenser af gener eller deres udvidede kodende regioner i en enkelt åben læseramme og ofte bevarer en kombination af deres oprindelige funktioner.

Formation

Kimæriske gener kan dannes på flere forskellige måder. Mange kimære gener dannes på grund af fejl i DNA-replikation eller DNA-reparation , således at dele af to forskellige gener utilsigtet kombineres [1] . Kimæriske gener kan også dannes ved retrotransposition , når en retrotransposon ved et uheld kopierer et gentranskript og indsætter det i genomet på et nyt sted. Afhængigt af hvor det nye retrogen optræder , kan det rekruttere nye exoner til at skabe det kimære gen. Og endelig kan ektopisk rekombination producere kimære gener  - når der er en udveksling mellem dele af genomet, som faktisk ikke er beslægtede. Denne proces forekommer ofte i menneskelige genomer. De unormale kimærer, der dannes ved denne proces, er kendt for at forårsage farveblindhed .

Evolutionær betydning af kimære proteiner

Kimæriske gener spiller en vigtig rolle i udviklingen af ​​genetisk diversitet. Ligesom genduplikationer giver de en kilde til nye gener, der kan tillade organismer at udvikle nye fænotyper og tilpasse sig deres miljø. I modsætning til duplikerede gener er kimære proteiner umiddelbart forskellige fra deres forældregener og er derfor mere tilbøjelige til at udføre helt nye funktioner.

Kimæriske fusionsproteiner dannes ofte i genomer [1] , og mange af dem vil sandsynligvis være dysfunktionelle og forsvinde som følge af naturlig selektion . Men i nogle tilfælde kan disse nye peptider danne fuldt funktionelle genprodukter, der er selektivt favoriserede og prolifererer hurtigt i populationer.

Funktioner

Et af de bedst kendte kimære gener blev identificeret i Drosophila og fik navnet Jingwei (jgw) [2] . Dette gen er dannet ud fra en retrotransponeret kopi af alkoholdehydrogenase , som kombineret med det gule kejsergen (ymp, gul-kejser) [3] for at producere et nyt protein [2] . Nye aminosyrerester afledt af det gule kejsergen gør det muligt for det nye protein at virke på langkædede alkoholer og dioler, herunder væksthormoner og feromoner [4] , og dermed påvirke udviklingen af ​​fluer. I dette tilfælde resulterede kombinationen af ​​forskellige proteindomæner i et gen, der var fuldt funktionelt og begunstiget af naturlig selektion.

Funktionerne af mange kimære gener er endnu ikke kendt. I nogle tilfælde er disse genprodukter ikke gavnlige og kan endda forårsage sygdomme som kræft [5] .

Noter

  1. 1 2 Rogers, RL, Bedford, T og Hartl DL. "Danning og levetid af kimære og duplikerede gener i Drosphila ". Genetik . 181:313-322.
  2. 1 2 Long, M., CH Langley 1993. "Naturlig selektion og oprindelsen af ​​jingwei , et kimærisk bearbejdet funktionelt gen i Drosophila ." Science 260: 91-95.
  3. ymp gul-kejser [Drosophila melanogaster (frugtflue) ] . National Library of Medicine. Hentet: 10. juli 2022.
  4. Zhang J, Dean AM, Brunet F, Long M. 2004. "Udviklende proteinfunktionel mangfoldighed i nye gener fra Drosophila ." Proc Natl Acad Sci USA 101: 16246-50.
  5. Shi, X.; Singh, S.; Lin, E.; Li, H. (2021). "Kimæriske RNA'er i cancer". Fremskridt inden for klinisk kemi . 100 : 1-35. DOI : 10.1016/bs.acc.2020.04.001 . PMID  33453863 .