Spacer (biologi)

Spacere (fra det engelske  spacer  - "separator") er sektioner af ikke-kodende DNA placeret mellem tandemly gentagne gener , for eksempel mellem ribosomale RNA- gener [1] i eukaryoter . Deres funktion er højst sandsynligt at give et højt niveau af transkriptionel troskab i beslægtede gener.

I bakterier består spacer-sektionerne af DNA kun af nogle få nukleotider . I eukaryoter kan de være meget større og inkludere gentagne DNA-sekvenser , og dermed omslutte det meste af det genomiske DNA.

I ribosomalt DNA er spacere til stede både i og mellem genklynger og omtales henholdsvis som interne spacere (ITS) og eksterne spacere (ETS). Hos dyr har mitokondrielle DNA-gener en tendens til at have meget korte afstandsstykker. Hos svampe er mitokondrielle DNA-spacere variable i længden og kan være mobile [2] . Da nukleotidsekvenserne af spacere under evolutionen ændrer sig meget hurtigere end gensekvenser, antages det, at funktionen af ​​en spacer ikke afhænger af sekvensen af ​​dens mononukleotider [3] .

I en snævrere forstand bruges udtrykket "spacer" til at henvise til at dele DNA mellem tandemkopier af rRNA-gener.

Noter

  1. Lackie, JM, red. (2007), The Dictionary of Cell & Molecular Biology (4. udgave), Burlington, MA: Academic Press, s. 394
  2. Rédei, G. P. (2008), Encyclopedia of Genetics, Genomics, Proteomics, and Informatics (3. udgave), Springer, s. 1848
  3. Sudbery, P. (2002), Human Molecular Genetics (2. udgave), Pearson Education, pp. 35-36