Proteoformer

Proteoformer ( engelske proteoformer ) - proteingrupper eller proteinarter, der opstår på grund af proteinmodifikationer: aminosyresubstitutioner (single amino acid polymorphism) (SAP), alternativ splejsning (AS) og post-translationelle modifikationer (PTM), såsom phosphorylering . Udtrykket "proteinart" eller "proteoform" refererer til den mindste enhed af proteomet, det vil sige et polypeptid , der har en unik sekvens og bærer et unikt sæt af post-translationelle modifikationer [1] .

Human Proteome Project

Målet med hovedfasen af ​​Human Proteome-projektet var at supplere masterproteomet med information om de former for proteiner, der er et resultat af forskellige modifikationer, såsom tilstedeværelsen af ​​ikke-synonyme enkeltnukleotidpolymorfismer i genomet, alternative splejsningsprocesser og posttranslationelle modifikationer. Som et resultat, i stedet for masterproteomet opnået i pilotfasen, hvor kun ét (master)protein svarede til ét gen, blev hele rækken af ​​mulige proteoformer kodet af ét gen analyseret i projektets hovedfase. Et gen kan kode for op til 100 proteiner (det vil sige adskillige millioner proteoformer på en organismeskala) eller flere titusinder for det menneskelige kromosom 18 . Hovedfasen af ​​Human Proteome-projektet vil gøre det muligt kritisk at evaluere eksisterende bioinformatiske prædiktive algoritmer og eventuelt udvikle nye algoritmer baseret på eksperimentelle data til påvisning af ikke-kanoniske proteoformer [2] .

Se også

Noter

  1. ↑ Naryzhny, S. N., Zgoda, V. G., Mainskova, M. A., Ronzina, N. L., Belyakova, N. V., Legina, O. K., & Archakov, A. I. (2015). Eksperimentel estimering af størrelsen af ​​humane celle- og plasmaproteomer . Biomedical Chemistry , 61(2), 279-285.
  2. ↑ Ponomarenko, E. A., Zgoda, V. G., Kopylov, A. T., Attorney, E. V., Igisonis, E. V., Lisitsa, A. V., & Archakov, A. I. (2015). Rusland i det internationale projekt "menneskeligt proteom": første resultater og udsigter . Biomedical Chemistry , 61(2), 169-175.