Gen knockdown er en teknik , der reducerer ekspressionen af et eller flere gener ved at ændre den tilsvarende nukleotidsekvens eller ved at bruge et kort oligonukleotid , der er komplementært til det tilsvarende mRNA - molekyle . Gen-knockdown-metoden refererer til omvendte genetiske metoder . Når sekvensen af et gen ændres, siges organismen at være knockout for det gen. I tilfælde af brug af korte oligonukleotider, der er komplementære til det tilsvarende mRNA eller binder til nukleotidsekvensen i DNA , fører gen-knockdown til en midlertidig ændring i genekspressionsparametrene uden at ændre strukturen af kromosomerne og DNA-sekvensen af genet .
I tilfælde af en kortvarig knockdown reducerer bindingen af et oligonukleotid til et gen eller transkripter ekspression på grund af blokering af transkription , translation eller mRNA - nedbrydning (for eksempel gennem RNA-interferensvejen ), præ-mRNA- splejsning kan også være svækket . [1] [2] Forskere studerer effekten af at slukke for et gen eller reducere dets ekspression på en organismes fænotype og sammenligne det med normale individer. Kortvarige gennedskæringer bruges ofte i udviklingsbiologi, da oligonukleotider let kan indføres i zygoten og vil blive overført til alle datterceller under embryonal udvikling. [3]