Biologisk sikkerhed er levende organismers bevarelse af deres biologiske essens, biologiske kvaliteter, systemdannende forhold og egenskaber, forebyggelse af et omfattende tab af biologisk integritet, som kan opstå som følge af:
Når der arbejdes med infektiøse stoffer , skal praksisretningslinjer følges, der beskriver det passende udstyr til sikker opbevaring af biologisk materiale, samt det nødvendige udstyr og aktiviteter, der skal udføres af laboratoriepersonale. Disse retningslinjer kaldes biosikkerhedsniveauer (BSL'er). Der er fire sådanne niveauer.
Bioteknologi er en ny gren af videnskaben, og derfor er interaktionen mellem genetisk modificerede organismer (GMO'er) med forskellige økosystemer endnu ikke fuldt ud forstået. GMO'er kan udvise egenskaber, som ikke er tilsigtet af deres udviklere. For eksempel kan oprindeligt harmløse mikroorganismer være smitsomme, og planter kan være mere konkurrencedygtige end normale planter af samme eller andre arter. I denne forbindelse er det muligt at erstatte konventionelle arter med genetisk modificerede, at krydse GMO'er med almindelige organismer af samme eller beslægtede arter. Der er også risiko for fremkomst af herbicid- og insektresistent ukrudt , da modificerede gener kan overføres til vilde planter, og skadedyrsresistente planter kan udgøre en risiko for gavnlige insekter.
I 1999, på en konference i den colombianske by Cartagena de Indias , blev den internationale Cartagena-protokol om biosikkerhed vedtaget ., som definerer de foranstaltninger og procedurer, der er nødvendige for sikker transport på tværs af landegrænser, behandling og brug af GMO'er.