Beta sandwich

β-sandwichdomæner består af 80-350 aminosyrer og findes almindeligvis i proteiner . De er karakteriseret ved to modsatrettede antiparallelle β-ark [1] . Antallet af strenge fundet i sådanne domæner kan variere fra et protein til et andet. β-sandwich-domæner forekommer i mange forskellige foldtyper.

Den immunglobulin-type fold fundet i antistoffer (Ig-fold) består af en sandwichstruktur af to grupper af antiparallelle β-kæder (7 og 9 stk.) arrangeret i to β-ark med et græsk nøglemotiv [2] . Motivet "græsk nøgle" forekommer også i humant transthyretin .

Gelérullemotivet , en udvikling af det græske nøglemotiv, findes i kulhydratbindende proteiner såsom concanavalin A og forskellige lectiner , i det kollagenbindende domæne af Staphylococcus aureus Adhesin og i fibronectin -bindende moduler, som i tenascin ( den tredje gentagelse af fibronectin type III). L-type lectin-domænet er en variation af jelly roll-motivet. C2-domænet i sin typiske version (PKC-C2) er en β-sandwich bestående af 8 β-strenge.

Se også

Noter

  1. Kister, AE (2006). "Strenge regler bestemmer arrangementer af strenge i sandwichproteiner". PNAS . 103 (11): 4107-4110. DOI : 10.1073/pnas.0510747103 . PMID  16537492 .
  2. Bokhove, Marcel & Jovine, Luca (2018-01-01), Chapter Thirteen - Structure of Zona Pellucida Module Proteins , Current Topics in Developmental Biology bind 130: 413–442 , DOI 10.1016/bs.ctdb.07.2007