"San Martin" - bygget som en portugisisk flådegaleon , blev flagskibet for Alonso Pérez de Guzman, den syvende hertug af Medina Sidonia - øverstkommanderende for den spanske armada . Opkaldt efter Sankt Martin
Efter at Portugal kom under kontrol af kong Filip II af Spanien , afsluttede portugiserne i 1580 opførelsen af en stor galjon ved navn São Martinho. Under dannelsen af den spanske armada blev São Martinho fundet at være det bedste skib og blev valgt som flagskibet for den øverstkommanderende for armadaen.
Galjonen havde en samlet længde på cirka 55 meter, en bredde på cirka 12 meter. Den bar godt 40 tunge kanoner fordelt på to dæk og et væld af mindre kalibervåben. Ifølge maleriet "Dag syv i slaget med Armadaen, 7. august 1588" af Hendrick Cornelisz Vroom (1563-1640), der ligger i Tyrolean Museum of Local Lore (Tiroler Landesmuseum Ferdinandeum) i Innsbruck (Østrig), havde San Martin tre master - forgrund og en hovedmast med direkte sejlrigning, en mizzen-mast med latinsejl og en blind på bovsprydet. Formasten var fastgjort inde i tanken. Skibet havde et deplacement på cirka 1000 tons.
San Martin led store skader i slaget ved Gravelines i juli 1588, da en eskadron af engelske skibe ledet af Sir Francis Drake på HMS Revenge overhalede den spanske armada. Skibet var et af syvogtres af de hundrede og tredive skibe fra den spanske armada, der med succes undslap stormen og de engelske kanoner og vendte tilbage til Spanien.