| RasMol | |
|---|---|
| Type | bioinformatik |
| Udvikler | Herbert J. Bernstein |
| Skrevet i | C |
| Operativ system | Microsoft Windows , Linux , Apple Macintosh |
| Interface sprog | engelsk russisk |
| Første udgave | 1992 |
| nyeste version | 2.7.5 (3. juni 2009 (rev. 23. juli 2009)) |
| Læsbare filformater | Proteindatabank |
| Licens | GNU General Public License |
| Internet side | rasmol.org |
| Mediefiler på Wikimedia Commons | |
RasMol er et computerprogram til molekylær visualisering, der primært bruges til at studere og afbilde de rumlige strukturer af biologiske makromolekyler , primært proteiner og nukleinsyrer . Den første version af RasMol-programmet blev skabt af Roger Sale i begyndelsen af 90'erne.
Fra og med versionerne i 2.7-serien distribueres RasMol under en dobbeltlicens ( GPL eller RASLIC ). Således er RasMol (sammen med Jmol og PyMOL ) et af de få open source molekylære visualiseringsprogrammer.
De indledende data til visualisering er koordinaterne for atomerne i et molekyle (eller et kompleks af molekyler), der er indeholdt i en fil i Protein Data Bank (PDB)-formatet. Atomiske koordinatfiler kan kopieres fra et af PDB-webstederne (se Worldwide Protein Data Bank ).
RasMol bliver fortsat aktivt brugt af molekylærbiologer og bioinformatikere. Med en enkel og logisk brugergrænsefladestruktur er programmet nemt at lære. Kommandosystemet udviklet til programmet ("sproget" for RasMol) bruges i andre programmer, for eksempel i Jmol . Sidstnævnte erstatter gradvist RasMol, fordi det er næsten lige så nemt at lære, dækker al funktionaliteten i RasMol og har nogle ekstra funktioner.