POLR2F

Polypeptid F RNA polymerase II (styret DNA)

PDB -gengivelse baseret på 1qkl.

Tilgængelige strukturer

Ortholog søgning: PDBe , RCSB

Liste over PDB-id'er
1QKL

Identifikatorer

Symbol

POLR2F ; HRBP14,4; POLRF; RPABC14,4; RPABC2; RPB14,4; RPB6; RPC15

Eksterne ID'er

OMIM: 604414 MGI : 1349393 HomoloGene : 7178 GeneCards : POLR2F Gen

EF-nummer

2.7.7.6

Gen-ontologi
Fungere	• RNA-polymerase I-aktivitet • RNA-polymerase II-aktivitet • RNA-polymerase III-aktivitet • DNA-binding
celle komponent	• kerne • nukleoplasma • DNA-styret RNA-polymerase II, kernekompleks • DNA-styret RNA-polymerase III-kompleks • nukleolus • DNA-dirigeret RNA-polymerase I-kompleks • cytosol
biologisk proces	• mRNA-splejsning, via spliceosom • DNA-reparation • transkriptionskoblet nukleotidudskæringsreparation • nukleotidudskæringsreparation • transkription fra RNA-polymerase I-promotor • transkription fra RNA-polymerase II-promotor • transkriptionsinitiering fra RNA-polymerase II-promotor • transkriptionsforlængelse fra RNA-polymerase II-promotor • 7-methylguanosin mRNA capping • transkription fra RNA polymerase III promotor • transkriptionsforlængelse fra RNA polymerase III promotor • terminering af RNA polymerase III transkription • RNA splejsning • genekspression • viral proces • positiv regulering af type I interferon produktion • medfødt immunrespons • positiv regulering af viral transkription
Kilder: Amigo / QuickGO

RNA-ekspressionsprofil

Mere information

ortologer

Udsigt

Human

Mus

Entrez

RefSeq (mRNA)

RefSeq (protein)

Locus (UCSC)

Chr 22:
38,35 – 38,44 Mb

Chr 15:
79,14 – 79,15 Mb

Søg i PubMed

[en]

[2]

RPABC2-underenheden af DNA-styret RNA-polymerase I, II og III er et protein kodet i mennesker af POLR2F -genet . [en]

Dette gen koder for den sjettestørste underenhed af RNA-polymerase II , polymerasen, der er ansvarlig for eukaryotisk messenger-RNA-syntese , som også involverer to andre DNA-styrede RNA-polymeraser. I gær danner denne polymerase-underenhed i kombination med mindst to andre underenheder en struktur, der stabiliserer transskriptionen af polymerasen i DNA-skabelonen. [2]

Interaktioner

POLR2F har vist sig at interagere med POLR2C . [3]

Noter

↑ Pusch C., Wang Z., Roe B., Blin N. Genomisk struktur af RNA-polymerase II lille underenhed (hRPB14.4) locus (POLRF ) og kortlægning til 22q13.1 ved sekvensidentitet // Genomics : journal. - Academic Press , 1996. - September ( vol. 34 , nr. 3 ). - S. 440-442 . - doi : 10.1006/geno.1996.0312 . — PMID 8786150 .
↑ Entrez-gen: POLR2F-polymerase (RNA) II (DNA-styret) polypeptid F. Arkiveret fra originalen den 5. december 2010. (ubestemt)
↑ Acker, J; de Graaff M; Cheynel I; Khazak V; Kedinger C; Vigneron M. Interaktioner mellem de humane RNA-polymerase II-underenheder // J. Biol. Chem. : journal. - USA, 1997. - Juli ( vol. 272 , nr. 27 ). - P. 16815-16821 . — ISSN 0021-9258 . doi : 10.1074 / jbc.272.27.16815 . — PMID 9201987 .

Litteratur

Zhang KT Tat, Tat-associeret kinase og transkription. (engelsk) // J. Biomed. sci. : journal. - 1998. - Bd. 5 , nr. 1 . - S. 24-7 . - doi : 10.1007/BF02253352 . — PMID 9570510 .
Yankulov K., Bentley D. Transkriptionel kontrol: Tat-kofaktorer og transkriptionel forlængelse. (engelsk) // Curr. Biol. : journal. - 1998. - Bd. 8 , nr. 13 . - P.R447-9 . - doi : 10.1016/S0960-9822(98)70289-1 . — PMID 9651670 .
Roman G; Kasten M; De Falco G; Micheli, Pietro; Khalili, Kamel; Giordano, Antonio. Regulatoriske funktioner af Cdk9 og af cyclin T1 i HIV tat transaktiveringsvej genekspression (engelsk) // J. Cell. Biochem. : journal. - 2000. - Vol. 75 , nr. 3 . - s. 357-368 . - doi : 10.1002/(SICI)1097-4644(19991201)75:3<357::AID-JCB1>3.0.CO;2-K . — PMID 10536359 .
Marcello A., Zoppé M., Giacca M. Flere måder for transkriptionel regulering af HIV-1 Tat-transaktivatoren // IUBMB Life : journal. - 2002. - Bd. 51 , nr. 3 . - S. 175-181 . - doi : 10.1080/152165401753544241 . — PMID 11547919 .
Stevens M., De Clercq E., Balzarini J. Reguleringen af HIV-1-transkription: molekylære mål for kemoterapeutisk intervention (engelsk) // Med Res Rev : journal. - 2007. - Bd. 26 , nr. 5 . - S. 595-625 . - doi : 10.1002/med.20081 . — PMID 16838299 .
Harrich D; McMillan N; Munoz L; Apolloni, Ann; Meredith, Luke. Vil forskellige Tat-interaktioner føre til nye antiretrovirale lægemiddelmål? (eng.) // Current drug targets : journal. - 2007. - Bd. 7 , nr. 12 . - S. 1595-1606 . - doi : 10.2174/138945006779025338 . — PMID 17168834 .
Kato H; Sumimoto H; Pognonec P; Chen, CH; Rosen, CA; Roeder, R G. HIV-1 Tat virker som en processivitetsfaktor in vitro i forbindelse med cellulære forlængelsesfaktorer // Genes Dev . : journal. - 1992. - Bd. 6 , nr. 4 . - S. 655-666 . - doi : 10.1101/gad.6.4.655 . — PMID 1559613 .
Southgate C., Zapp ML, Green MR Aktivering af transkription af HIV-1 Tat-protein bundet til spirende RNA gennem et andet protein // Nature: journal. - 1990. - Bd. 345 , nr. 6276 . - S. 640-642 . - doi : 10.1038/345640a0 . — PMID 2190099 .
Wu-Baer F., Sigman D., Gaynor RB Specifik binding af RNA-polymerase II til den transaktiverende region for human immundefektvirus RNA reguleres af cellulære cofaktorer og Tat // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 1995. - Bd. 92 , nr. 16 . - P. 7153-7157 . - doi : 10.1073/pnas.92.16.7153 . — PMID 7638159 .
Acker J., Wintzerith M., Vigneron M., Kedinger C. En 14,4 KDa sur underenhed af human RNA-polymerase II med en formodet leucin-lynlås // DNA Seq. : journal. - 1995. - Bd. 4 , nr. 5 . - s. 329-331 . - doi : 10.3109/10425179409020860 . — PMID 7803819 .
Herrmann CH, Rice AP Lentivirus Tat-proteiner associeres specifikt med en cellulær proteinkinase, TAK, der hyperphosphorylerer det carboxylterminale domæne af den store underenhed af RNA-polymerase II: kandidat til en Tat-cofaktor // J. Virol. : journal. - 1995. - Bd. 69 , nr. 3 . - S. 1612-1620 . — PMID 7853496 .
Keen NJ, Gait MJ, Karn J. Human immundefektvirus type-1 Tat er en integreret komponent af det aktiverede transkriptionsforlængelsekompleks (engelsk) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 1996. - Bd. 93 , nr. 6 . - S. 2505-2510 . - doi : 10.1073/pnas.93.6.2505 . — PMID 8637904 .
Yang X., Herrmann CH, Rice AP De humane immundefektvirus Tat-proteiner associeres specifikt med TAK in vivo og kræver det carboxylterminale domæne af RNA-polymerase II for funktion // J. Virol. : journal. - 1996. - Bd. 70 , nr. 7 . - P. 4576-4584 . — PMID 8676484 .
Agostini I; Navarro JM; Ray F; Bouhamdan, M; Spire, B; Vigne, R; Sire, J. Den humane immundefektvirus type 1 Vpr-transaktivator: samarbejde med promotorbundne aktivatordomæner og binding til TFIIB // J. Mol. Biol. : journal. - 1996. - Bd. 261 , nr. 5 . - S. 599-606 . - doi : 10.1006/jmbi.1996.0485 . — PMID 8800208 .
Zhou Q., Sharp PA Tat-SF1: cofaktor til stimulering af transkriptionel forlængelse af HIV-1 Tat (engelsk) // Science: journal. - 1996. - Bd. 274 , nr. 5287 . - S. 605-610 . - doi : 10.1126/science.274.5287.605 . — PMID 8849451 .
Okamoto H; Sheline CT; Corden JL; Jones, K.A.; Peterlin, BM Transaktivering af humant immundefektvirus Tat-protein kræver det C-terminale domæne af RNA-polymerase II // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal . - 1996. - Bd. 93 , nr. 21 . - P. 11575-11579 . - doi : 10.1073/pnas.93.21.11575 . — PMID 8876177 .
Chun RF, Zhang KT Krav til RNA-polymerase II carboxyl-terminalt domæne til aktiveret transkription af humane retrovira human T-celle lymfotropisk virus I og HIV-1 // J. Biol. Chem. : journal. - 1996. - Bd. 271 , nr. 44 . - P. 27888-27894 . doi : 10.1074 / jbc.271.44.27888 . — PMID 8910388 .
Parada CA, Roeder RG Forbedret processivitet af RNA-polymerase II udløst af Tat-induceret phosphorylering af dets carboxy-terminale domæne // Nature: journal. - 1996. - Bd. 384 , nr. 6607 . - s. 375-378 . - doi : 10.1038/384375a0 . — PMID 8934526 .
García-Martínez LF, Ivanov D., Gaynor RB Association of Tat med eliminerede HIV-1 og HIV-2 transkriptions præinitieringskomplekser // J. Biol. Chem. : journal. - 1997. - Bd. 272 , nr. 11 . - P. 6951-6958 . doi : 10.1074 / jbc.272.11.6951 . — PMID 9054383 .