POLR2D

Polypeptid D RNA polymerase II (styret DNA)

FBF er repræsenteret ved eksempel 2c35.

Tilgængelige strukturer

Ortholog søgning: PDBe , RCSB

Liste over PDB-id'er
2C35

Identifikatorer

Symbol

POLR2D ; HSRBP4; HSRPB4; RBP4; RPB16

Eksterne ID'er

OMIM: 606017 MGI : 1916491 HomoloGene : 37968 GeneCards : POLR2D-gen

EF-nummer

2.7.7.6

Gen-ontologi
Fungere	• nukleotidbinding • enkeltstrenget DNA-binding • enkeltstrenget RNA-binding • DNA-rettet RNA-polymeraseaktivitet • translationsinitieringsfaktorbinding
celle komponent	• cytoplasmatisk mRNA-bearbejdningslegeme • kerne • nukleoplasma • DNA-styret RNA-polymerase II, kernekompleks
biologisk proces	• nukleært transskriberet mRNA katabolisk proces, deadenyleringsafhængig henfald • mRNA-splejsning, via spliceosom • DNA-reparation • transkriptionskoblet nukleotidudskæringsreparation • nukleotidudskæringsreparation • transkription fra RNA-polymerase II-promotor • transkriptionsinitiering fra RNA-polymerase II-promotor • transkriptionsforlængelse fra RNA-polymerase II-promotor • 7-methylguanosin mRNA capping • RNA-splejsning • genekspression • viral proces • mRNA eksport fra kerne som reaktion på varmestress • rekruttering af 3'-ende processeringsfaktorer til RNA polymerase II holoenzymkompleks • positiv regulering af translationel initiering • positiv regulering af viral transkription
Kilder: Amigo / QuickGO

RNA-ekspressionsprofil

Mere information

ortologer

Udsigt

Human

Mus

Entrez

RefSeq (mRNA)

RefSeq (protein)

Locus (UCSC)

Chr 2:
128,6 – 128,62 Mb

Chr 18:
31,79 – 31,8 Mb

Søg i PubMed

[en]

[2]

RPB4-underenheden af DNA-afhængig RNA-polymerase II er et enzym kodet i mennesker af POLR2D-genet [1] .

Dette gen koder for den fjerdestørste underenhed af RNA-polymerase II , ansvarlig for RNA- syntese i eukaryoter . I gær binder denne polymeraseunderenhed til polymerase under suboptimale vækstbetingelser og kan spille en rolle i stressbeskyttelse. Den 3'-utranslaterede region af dette gentranskript indeholder sekvensen for et ribosomalt pseudogen [2] .

Noter

↑ Khazak V., Estojak J., Cho H., Majors J., Sonoda G., Testa JR, Golemis EA Analyse af interaktionen af den nye RNA-polymerase II (pol II) underenhed hsRPB4 med dens partner hsRPB7 og med pol II (eng.) // Mol Cell Biol : journal. - 1998. - Maj ( bind 18 , nr. 4 ). - S. 1935-1945 . — PMID 9528765 .
↑ Entrez-gen: POLR2D-polymerase (RNA) II (DNA-styret) polypeptid D. (ubestemt)

Litteratur

Zhang KT Tat, Tat-associeret kinase og transkription. (engelsk) // J. Biomed. sci. : journal. - 1998. - Bd. 5 , nr. 1 . - S. 24-7 . - doi : 10.1007/BF02253352 . — PMID 9570510 .
Yankulov K., Bentley D. Transkriptionel kontrol: Tat-kofaktorer og transkriptionel forlængelse. (engelsk) // Curr. Biol. : journal. - 1998. - Bd. 8 , nr. 13 . - P.R447-9 . - doi : 10.1016/S0960-9822(98)70289-1 . — PMID 9651670 .
Romano G., Kasten M., De Falco G., et al. Regulatoriske funktioner af Cdk9 og cyclin T1 i HIV tat transaktiveringsvej genekspression. (engelsk) // J. Cell. Biochem. : journal. - 2000. - Vol. 75 , nr. 3 . - s. 357-368 . - doi : 10.1002/(SICI)1097-4644(19991201)75:3<357::AID-JCB1>3.0.CO;2-K . — PMID 10536359 .
Marcello A., Zoppé M., Giacca M. Flere måder for transkriptionel regulering af HIV-1 Tat-transaktivatoren. (engelsk) // IUBMB Life: journal. - 2002. - Bd. 51 , nr. 3 . - S. 175-181 . - doi : 10.1080/152165401753544241 . — PMID 11547919 .
Stevens M., De Clercq E., Balzarini J. Reguleringen af HIV-1-transkription: molekylære mål for kemoterapeutisk intervention. (engelsk) // Med Res Rev : journal. - 2007. - Bd. 26 , nr. 5 . - S. 595-625 . - doi : 10.1002/med.20081 . — PMID 16838299 .
Harrich D., McMillan N., Munoz L., et al. Vil forskellige Tat-interaktioner føre til nye antiretrovirale lægemiddelmål? (eng.) // Current drug targets : journal. - 2007. - Bd. 7 , nr. 12 . - S. 1595-1606 . - doi : 10.2174/138945006779025338 . — PMID 17168834 .
Kato H., Sumimoto H., Pognonec P., et al. HIV-1 Tat virker som en processivitetsfaktor in vitro i forbindelse med cellulære forlængelsesfaktorer. (engelsk) // Genes Dev. : journal. - 1992. - Bd. 6 , nr. 4 . - S. 655-666 . - doi : 10.1101/gad.6.4.655 . — PMID 1559613 .
Southgate C., Zapp ML, Green MR Aktivering af transkription af HIV-1 Tat-protein bundet til begyndende RNA gennem et andet protein. (engelsk) // Natur: journal. - 1990. - Bd. 345 , nr. 6276 . - S. 640-642 . - doi : 10.1038/345640a0 . — PMID 2190099 .
Wu-Baer F., Sigman D., Gaynor RB Specifik binding af RNA-polymerase II til det transaktiverende område af human immundefektvirus RNA reguleres af cellulære cofaktorer og Tat. (engelsk) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 1995. - Bd. 92 , nr. 16 . - P. 7153-7157 . - doi : 10.1073/pnas.92.16.7153 . — PMID 7638159 .
Herrmann CH, Rice AP Lentivirus Tat-proteiner associeres specifikt med en cellulær proteinkinase, TAK, der hyperphosphorylerer det carboxylterminale domæne af den store underenhed af RNA-polymerase II: kandidat til en Tat-cofaktor. (engelsk) // J. Virol. : journal. - 1995. - Bd. 69 , nr. 3 . - S. 1612-1620 . — PMID 7853496 .
Keen NJ, Gait MJ, Karn J. Human immundefektvirus type-1 Tat er en integreret komponent af det aktiverede transkriptionsforlængelsekompleks. (engelsk) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 1996. - Bd. 93 , nr. 6 . - S. 2505-2510 . - doi : 10.1073/pnas.93.6.2505 . — PMID 8637904 .
Yang X., Herrmann CH, Rice AP De humane immundefektvirus Tat-proteiner associeres specifikt med TAK in vivo og kræver det carboxylterminale domæne af RNA-polymerase II for at fungere. (engelsk) // J. Virol. : journal. - 1996. - Bd. 70 , nr. 7 . - P. 4576-4584 . — PMID 8676484 .
Agostini I., Navarro JM, Rey F., et al. Den humane immundefektvirus type 1 Vpr-transaktivator: samarbejde med promotorbundne aktivatordomæner og binding til TFIIB. (engelsk) // J. Mol. Biol. : journal. - 1996. - Bd. 261 , nr. 5 . - S. 599-606 . - doi : 10.1006/jmbi.1996.0485 . — PMID 8800208 .
Zhou Q., Sharp PA Tat-SF1: cofaktor til stimulering af transkriptionel forlængelse af HIV-1 Tat. (engelsk) // Videnskab: tidsskrift. - 1996. - Bd. 274 , nr. 5287 . - S. 605-610 . - doi : 10.1126/science.274.5287.605 . — PMID 8849451 .
Okamoto H., Sheline CT, Corden JL, et al. Transaktivering af humant immundefektvirus Tat-protein kræver det C-terminale domæne af RNA-polymerase II. (engelsk) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 1996. - Bd. 93 , nr. 21 . - P. 11575-11579 . - doi : 10.1073/pnas.93.21.11575 . — PMID 8876177 .
Chun RF, Zhang KT Krav til RNA-polymerase II carboxyl-terminalt domæne til aktiveret transkription af humane retrovira human T-celle lymfotropisk virus I og HIV-1. (engelsk) // J. Biol. Chem. : journal. - 1996. - Bd. 271 , nr. 44 . - P. 27888-27894 . doi : 10.1074 / jbc.271.44.27888 . — PMID 8910388 .
Parada CA, Roeder RG Forbedret processivitet af RNA-polymerase II udløst af Tat-induceret phosphorylering af dets carboxy-terminale domæne. (engelsk) // Natur: journal. - 1996. - Bd. 384 , nr. 6607 . - s. 375-378 . - doi : 10.1038/384375a0 . — PMID 8934526 .
García-Martínez LF, Ivanov D., Gaynor RB Association of Tat med oprensede HIV-1 og HIV-2 transkriptions præinitieringskomplekser. (engelsk) // J. Biol. Chem. : journal. - 1997. - Bd. 272 , nr. 11 . - P. 6951-6958 . doi : 10.1074 / jbc.272.11.6951 . — PMID 9054383 .
Cujec TP, Cho H., Maldonado E., et al. Den humane immundefektvirus-transaktivator Tat interagerer med RNA-polymerase II-holoenzymet. (engelsk) // Mol. celle. Biol. : journal. - 1997. - Bd. 17 , nr. 4 . - P. 1817-1823 . — PMID 9121429 .
García-Martinez LF, Mavankal G., Neveu JM, et al. Oprensning af en Tat-associeret kinase afslører et TFIIH-kompleks, der modulerer HIV-1-transkription. (engelsk) // EMBO J. : journal. - 1997. - Bd. 16 , nr. 10 . - P. 2836-2850 . - doi : 10.1093/emboj/16.10.2836 . — PMID 9184228 .